Education

Calcule la masse moléculaire d'une protéine depuis sa séquence : MW = Σ masses moyennes des résidus + H₂O (18,01524 Da), avec la même table qu'ExPASy ProtParam (A 71,0788 … W 186,2132). L'entrée est insensible à la casse ; espaces et séparateurs * - . sont retirés ; les codes d'ambiguïté (B/J/O/U/X/Z) ne sont pas sommés mais comptés et signalés. Le résultat est la chaîne polypeptidique non modifiée : sans clivage du peptide signal, ponts disulfures (−2H par pont), PTM ni étiquettes. Renvoie kDa, masse moyenne par résidu et longueur. Sources : ExPASy ProtParam (Gasteiger 2005), handbook de Fasman. Uniquement à but éducatif.

Education

Estime le Kd à partir d'un point selon l'équilibre 1:1 : en excès de protéine, f = [P]÷([P]+Kd), donc Kd = [P]×(1−f)÷f ; à f = 0,5 le Kd égale la concentration en protéine. Deux entrées : fraction liée directe (0–1) ou anisotropie de fluorescence f = (r−rlibre)÷(rlié−rlibre). Ajoute ΔG° = RT·ln(Kd) (25 °C par défaut). Bandes : <1 nM très forte, 1–100 nM forte (cibles typiques de facteurs de transcription), 100 nM–1 µM modérée, >1 µM faible (vérifier sel et compétiteur poly(dI-dC)). Hypothèses : équilibre, 1:1, protéine en grand excès ; pour une courbe complète, ajuster toute la titration. Sources : Cantor & Schimmel, Heyduk & Lee 1990, Lakowicz. Uniquement pour l'éducation.

Education

Calcule ε280 selon Pace 1995 / Gill & von Hippel 1989 : ε280 = 5500×nTrp + 1490×nTyr + 125×ncystine (M⁻¹cm⁻¹, erreur typique ±5%). Les cystines sont des paires de Cys liées par pont disulfure et ne comptent qu'à l'état oxydé (⌊Cys/2⌋) ; l'outil renvoie les valeurs tout-réduit et tout-oxydé pour encadrer l'état réel. Le mode séquence compte W/Y/C et calcule la masse moléculaire avec les masses moyennes ProtParam ; le mode comptage prend les nombres de résidus et une masse optionnelle. Inclut A0.1% = ε/PM (absorbance d'une solution à 1 mg/mL), soit c = A/ε pour revenir à la concentration. Attention : les protéines sans Trp/Tyr ont un ε280 quasi nul (utiliser A205 ou BCA) et corriger la contamination par acides nucléiques (A260). Sources : Pace 1995, Gill & von Hippel 1989, ExPASy ProtParam. Uniquement pour l'éducation.

Education

Calcule le point isoélectrique théorique à partir de la composition en acides aminés : charge nette par Henderson–Hasselbalch sur chaque groupe ionisable (jeu de pKa simplifié ExPASy/Bjellqvist : N-term 7.5, K 10.0, R 12.0, H 5.98 ; C-term 3.55, D 4.05, E 4.45, C 9.0, Y 10.0) et bissection jusqu'à la charge nulle. Renvoie aussi la charge nette au pH physiologique 7.4, la masse moléculaire moyenne (table ProtParam + eau) et la lecture acide/basique. Limites : pKa de chaîne dépliée, sans modifications post-traductionnelles ; le jeu de pKa et l'algorithme de bissection sont identiques à Biopython IsoelectricPoint (résultats numériquement identiques), tandis que le jeu complet de Bjellqvist d'ExPASy distingue les résidus terminaux et peut différer légèrement. Sources : Bjellqvist 1993, Gasteiger 2003 (ExPASy), Biopython IsoelectricPoint. Uniquement pour l'éducation.

Education

Estime les tailles des fragments après digestion : un substrat circulaire avec n coupures produit n fragments (en bouclant l'origine), un linéaire en produit n+1. Le mode positions calcule les fragments exacts à partir de coordonnées séparées par des virgules ; le mode nombre de sites donne l'effectif et la moyenne pour une répartition uniforme. Inclut la fréquence attendue des sites dans l'ADN aléatoire : enzymes à 4 bases ~1 site/256 bp, à 6 bases ~1/4096 bp (REBASE/Sambrook), et des repères de résolution en agarose (<50 bp peut sortir du gel). Sources : Sambrook & Russell 3ᵉ éd., REBASE. Uniquement pour l'éducation.

Education

Calcule pas à pas la probabilité de descendance atteinte dans un pedigree à l'aide de l'arbre mendélien (règle du produit le long d'une branche, règle de la somme entre branches). Autosomique récessif : P(atteint) = P(père porteur) × P(mère porteuse) / 4, avec la probabilité de porteur (deux porteurs connus → 1/4 atteint, 1/2 porteur, ex. mucoviscidose). Autosomique dominant (hétérozygotes, ex. Huntington) : les deux atteints → 3/4. Récessif lié à l'X (hémophilie A, daltonisme) : mère porteuse × père sain → 50% des fils atteints, 50% des filles porteuses, avec détail par sexe et probabilité globale. Chaque branche du calcul est affichée. Sources : Griffiths, Hartl & Clark 2007, StatPearls. Usage éducatif uniquement.

Education

Détermine la concentration d'ARN par absorbance UV à 260 nm : concentration (µg/mL) = A260 × facteur de dilution × 40 ÷ trajet optique (cm). La constante de l'ARN est 1 OD = 40 µg/mL, entre l'ADN double brin (50) et simple brin (33) ; une erreur fréquente consiste à garder la constante 50 de l'ADNdb, ce qui surestime l'ARN de 25%. 1 µg/mL = 1 ng/µL ; indiquez le volume d'élution pour le rendement total. Inclut la fenêtre linéaire 0.1–1.5 ; un ARN pur doit donner un OD260/280 ≈ 2.0 (ADN ~1.8) — évaluez la pureté avec l'outil de ratio. Travaillez sans RNase et sur glace. Sources : Marmur & Doty, Sambrook & Russell, Manchester 1995, Thermo Fisher. Uniquement pour l'éducation et la planification.

Health

Convertit la glycémie entre unités conventionnelles (mg/dL) et SI (mmol/L). Le glucose (C₆H₁₂O₆) a une masse molaire de 180.156 g/mol, donc le facteur est fixe : mg/dL × 0.05551 = mmol/L (÷18.0182). Références (ADA / OMS) : glycémie à jeun normale <100 mg/dL (<5.6 mmol/L) ; prédiabète 100–125 (5.6–6.9) ; diabète ≥126 (≥7.0). À 2 h après HGPO 75 g : normale <140 (<7.8) ; IGT 140–199 (7.8–11.0) ; diabète ≥200 (≥11.1). Hypoglycémie <70 (<3.9), sévère <54 ; DKA/HHS souvent >250 / >600. HbA1c ≈ 6.5% équivaut à eAG ~140 mg/dL. Sources : ADA 2024, OMS 2006, Young 1987, StatPearls, ADAG 2008. Non un avis médical.

Health

Calcule les résistances vasculaires pulmonaires PVR = (mPAP − PCWP)/CO (Wood) = 80×(mPAP − PCWP)/CO (dyn·s/cm⁵). mPAP pression artérielle pulmonaire moyenne, PCWP pression capillaire pulmonaire (≈ pression OG), CO débit cardiaque. Normale <3 Wood (<240 dyn·s/cm⁵) ; élevée dans l'HTAP (groupe 1, groupes 2-5), l'hypoxie, l'EP, le shunt G-D. La PVR distingue l'HTP pré-capillaire (mPAP>20, PCWP≤15) de post-capillaire (PCWP>15) et est la cible du traitement médicamenteux de l'HTAP. Sources : Grossman 1991, Simonneau JACC 2019, Humbert ESC/ERS 2022, StatPearls, LITFL. Non un avis médical.

Education

Convertit l’âge d’un chien ou d’un chat en années humaines avec la méthode moderne AVMA (regroupant les chiens par taille) ou la formule épigénétique UCSD, affiche l’étape de vie et une carte de visite vétérinaire imprimable.

Health

Calcule la pression pulsée PP = PAS − PAD, un substitut du volume d'éjection et de la compliance aortique ; rapporte aussi MAP = PAD + PP/3. Physiologie : PP ∝ volume d'éjection/compliance. Normale ~30–40 mmHg (~25% de PAS) ; élargie (>50–60) suggère haut volume d'éjection (insuffisance aortique/anxiété/fièvre/anémie/hyperthyroïdie/PDA) ou artères rigides (âge/athérome) ; rétrécie (<25–30) suggère bas volume d'éjection (IC/tamponnade/constriction/hypovolémie/sténose aortique sévère). Pouls paradoxal (chute PP >10 à l'inspiration) → tamponnade, asthme/BPCO sévère, pneumothorax suffocant, EP. Sources : McDonald's, Franklin 1999, Blacher 1999, StatPearls, LITFL. Non un avis médical.

Health

Calcule le débit glucidique GIR (mg/kg/min) = [débit(mL/h) × concentration(%)] / [poids(kg) × 6]. Indicateur clé de la nutrition parentérale néonatale/pédiatrique. Concentrations courantes : D5 (entretien périphérique), D10 (standard néonatal/pédiatrique), D12.5 (concentré néonatal), D25 (voie centrale uniquement), D50 (CAD/central). Cibles GIR : < 4 risque d'hypoglycémie ; 4–6 objectif chez le nouveau-né à terme ; 6–8 besoin accru (prématuré, stress) ; 8–10 courant en réanimation ; 10–12 limite supérieure ; > 12 risque d'hyperglycémie/hyperosmolarité. Prématurés (< 1500 g) souvent 6–10 mg/kg/min. Poids en kg ou g (auto-conversion). Sources : Adamkin 2009, ASPEN 2013, MDCalc, Singhal 2018. Non un avis médical.