Wandelt beliebigen Unicode-Text in reines ASCII um: entfernt Akzente (é→e, ñ→n), romanisiert Kyrillisch/Griechisch, transliteriert Chinesisch zu Pinyin (北京→Bei Jing).

unicode-to-ascii-transliterator

Rail-Fence / Lattenzaun-Chiffre (ZigZag)

html

Text Processing

Kodiere, dekodiere, visualisiere und knacke die Rail-Fence-Transpositionschiffre.

zigzag-railfence-text

Aminosäurezusammensetzungs-Analysator

json

Education

Analysiert die Zusammensetzung einer Sequenz: Häufigkeiten und Mol-Prozente jeder der 20 Standard-Aminosäuren; Gruppensummen (basisch K/R/H, sauer D/E, aromatisch F/W/Y, schwefelhaltig C/M, aliphatisch A/I/L/V, Amid N/Q, Hydroxyl S/T, sonstige G/P); GRAVY nach den Hydropathie-Werten von Kyte–Doolittle 1982 (>0 hydrophob, <0 hydrophil; lösliche Globuläre meist zwischen −1 und +0,3); dazu die Molekularmasse aus der ProtParam-Tabelle. Ambiguitätscodes (B/J/O/U/X/Z) werden separat gezählt und von den Prozenten ausgeschlossen. Quellen: Kyte & Doolittle 1982, ExPASy ProtParam, Lehninger. Nur für Ausbildung.

amino-acid-composition

DNA-Molkonzentrationsrechner (µg/mL → nM)

json

Education

Rechnet die Massenkonzentration von DNA in die molare Konzentration um: nM = µg/mL × 10⁶ ÷ (Masse pro Basenpaar × bp). Durchschnittsmassen nach NEB: doppelsträngige DNA 650 Da/bp, einzelsträngige 330 Da/nt (Promega nutzt 660). Klassische Falle: Mit 10⁻³ im Nenner ergibt sich µM, nicht nM (Faktor 1000). 1 µg/mL = 1 ng/µL; mit Volumen folgen Gesamt-pmol und Moleküle pro µL. Quellen: NEB NEBioCalculator, Promega BioMath, N_A = 6.022×10²³. Nur für Ausbildung und Versuchsplanung.

molar-dna-concentration

Verdünnungsrechner für Nukleinsäuren (C1V1 = C2V2)

json

Education

Stellt DNA/RNA-Arbeitslösungen in zwei Modi her: über die Zielkonzentration nach C1V1 = C2V2 mit Stockvolumen V1 = C2×V2/C1 und Puffervolumen; oder über den Verdünnungsfaktor 1:X mit Endkonzentration C1/X und Volumen V2/X. Stock und Ziel müssen nur dieselbe Einheit teilen (ng/µL, µg/mL, nM) — die Algebra ist einheitenfrei. Integrierte Pipettierhinweise: V1 < 0.5 µL empfiehlt eine zweistufige Serialverdünnung, V1 < 2 µL einen Low-Retention-Tip; ein Ziel über dem Stock wird abgelehnt. Quellen: Sambrook & Russell 3. Aufl., Thermo-Fisher-Pipettierleitfaden. Nur für Ausbildung und Planung.

nucleic-acid-dilution

OD600-Zelldichte-Rechner (E. coli)

json

Education

Rechnet OD600-Trübungsmessungen in Zellkonzentration und Zelltrockengewicht (CDW) um: normierte OD = Messwert × Verdünnungsfaktor ÷ Schichtdicke; Zellen/mL = OD × Zellen pro OD-Einheit (standardmäßig 1×10⁹, üblich für E. coli); CDW g/L = OD × g/L pro OD-Einheit (Standard 0.36, BioNumbers 109837; Bereich 0.3–0.5). Beide Faktoren sind editierbar — Stamm, Medium und Gerät beeinflussen sie; die Defaults sind selbstkonsistent: 0.36 g/L ÷ 10⁹ Zellen/mL = 0.36 pg/Zelle. Messungen über OD 1 werden als außerhalb des linearen Bereichs markiert (Sigma-Aldrich). Quellen: BioNumbers 109835/109837, Agilent/VectorBuilder. Mit eigener OD-KBE-Kurve kalibrieren. Nur für Ausbildung.

od600-cell-density

Oligonukleotid-Tm-Rechner (Salzkorrektur)

json

Education

Zwei klassische Tm-Schätzungen: die Wallace-Regel Tm = 2×(A+T) + 4×(G+C) (kurze Oligos <14 nt, ohne Salzabhängigkeit) und die salzkorrigierte Formel Tm = 81.5 + 16.6×log₁₀[Na⁺] + 0.41×(%G+C) − 600/n (Sambrook 1989 S. 11.46, wie in Primer3; der Längenterm variiert je nach Quelle 500–675/n). Der Automatikmodus wählt nach Länge. Ausgabe: %GC, Zusammensetzung und beide Schätzungen. Beide sind Näherungen — für Entwurfsgenauigkeit Nearest-Neighbor-Thermodynamik verwenden (Tool pcr-primer-tm). Annahmen: DNA, keine Fehlpaarungen, ohne Formamid/DMSO, [Na⁺] 0.01–1 M. Quellen: Wallace 1979, von Ahsen 2001, Sambrook & Maniatis, OligoCalc. Nur für Ausbildung.

oligo-melting-temperature