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Education

Calculateur de masse moléculaire de protéine (par séquence)

Calcule la masse moléculaire d'une protéine depuis sa séquence : MW = Σ masses moyennes des résidus + H₂O (18,01524 Da), avec la même table qu'ExPASy ProtParam (A 71,0788 … W 186,2132). L'entrée est insensible à la casse ; espaces et séparateurs * - . sont retirés ; les codes d'ambiguïté (B/J/O/U/X/Z) ne sont pas sommés mais comptés et signalés. Le résultat est la chaîne polypeptidique non modifiée : sans clivage du peptide signal, ponts disulfures (−2H par pont), PTM ni étiquettes. Renvoie kDa, masse moyenne par résidu et longueur. Sources : ExPASy ProtParam (Gasteiger 2005), handbook de Fasman. Uniquement à but éducatif.

Education

Calculateur d'affinité protéine-ADN (estimation de Kd)

Estime le Kd à partir d'un point selon l'équilibre 1:1 : en excès de protéine, f = [P]÷([P]+Kd), donc Kd = [P]×(1−f)÷f ; à f = 0,5 le Kd égale la concentration en protéine. Deux entrées : fraction liée directe (0–1) ou anisotropie de fluorescence f = (r−rlibre)÷(rlié−rlibre). Ajoute ΔG° = RT·ln(Kd) (25 °C par défaut). Bandes : <1 nM très forte, 1–100 nM forte (cibles typiques de facteurs de transcription), 100 nM–1 µM modérée, >1 µM faible (vérifier sel et compétiteur poly(dI-dC)). Hypothèses : équilibre, 1:1, protéine en grand excès ; pour une courbe complète, ajuster toute la titration. Sources : Cantor & Schimmel, Heyduk & Lee 1990, Lakowicz. Uniquement pour l'éducation.

Education

Calculateur du coefficient d'extinction des protéines (ε280)

Calcule ε280 selon Pace 1995 / Gill & von Hippel 1989 : ε280 = 5500×nTrp + 1490×nTyr + 125×ncystine (M⁻¹cm⁻¹, erreur typique ±5%). Les cystines sont des paires de Cys liées par pont disulfure et ne comptent qu'à l'état oxydé (⌊Cys/2⌋) ; l'outil renvoie les valeurs tout-réduit et tout-oxydé pour encadrer l'état réel. Le mode séquence compte W/Y/C et calcule la masse moléculaire avec les masses moyennes ProtParam ; le mode comptage prend les nombres de résidus et une masse optionnelle. Inclut A0.1% = ε/PM (absorbance d'une solution à 1 mg/mL), soit c = A/ε pour revenir à la concentration. Attention : les protéines sans Trp/Tyr ont un ε280 quasi nul (utiliser A205 ou BCA) et corriger la contamination par acides nucléiques (A260). Sources : Pace 1995, Gill & von Hippel 1989, ExPASy ProtParam. Uniquement pour l'éducation.

Education

Calculateur de point isoélectrique des protéines (pI)

Calcule le point isoélectrique théorique à partir de la composition en acides aminés : charge nette par Henderson–Hasselbalch sur chaque groupe ionisable (jeu de pKa simplifié ExPASy/Bjellqvist : N-term 7.5, K 10.0, R 12.0, H 5.98 ; C-term 3.55, D 4.05, E 4.45, C 9.0, Y 10.0) et bissection jusqu'à la charge nulle. Renvoie aussi la charge nette au pH physiologique 7.4, la masse moléculaire moyenne (table ProtParam + eau) et la lecture acide/basique. Limites : pKa de chaîne dépliée, sans modifications post-traductionnelles ; le jeu de pKa et l'algorithme de bissection sont identiques à Biopython IsoelectricPoint (résultats numériquement identiques), tandis que le jeu complet de Bjellqvist d'ExPASy distingue les résidus terminaux et peut différer légèrement. Sources : Bjellqvist 1993, Gasteiger 2003 (ExPASy), Biopython IsoelectricPoint. Uniquement pour l'éducation.

Education

Calculateur de probabilité par arbre généalogique

Calcule pas à pas la probabilité de descendance atteinte dans un pedigree à l'aide de l'arbre mendélien (règle du produit le long d'une branche, règle de la somme entre branches). Autosomique récessif : P(atteint) = P(père porteur) × P(mère porteuse) / 4, avec la probabilité de porteur (deux porteurs connus → 1/4 atteint, 1/2 porteur, ex. mucoviscidose). Autosomique dominant (hétérozygotes, ex. Huntington) : les deux atteints → 3/4. Récessif lié à l'X (hémophilie A, daltonisme) : mère porteuse × père sain → 50% des fils atteints, 50% des filles porteuses, avec détail par sexe et probabilité globale. Chaque branche du calcul est affichée. Sources : Griffiths, Hartl & Clark 2007, StatPearls. Usage éducatif uniquement.

Education

Calculateur de fréquence de recombinaison et carte génétique (cM)

Convertit entre fréquence de recombinaison et distance de carte génétique. r = recombinants / descendance totale (r ≤ 0.5 ; tend vers 0.5 pour gènes distants ou sur des chromosomes différents). Trois fonctions de cartographie (d en morgans, 1 M = 100 cM) : linéaire d = r (courtes distances seulement) ; Haldane 1919 : d = −½ln(1−2r) (sans interférence) ; Kosambi 1944 : d = ¼ln((1+2r)/(1−2r)) (interférence positive). Elles corrigent la sous-estimation par les doubles crossing-over : pour un même r, Haldane ≥ Kosambi ≥ linéaire. Le mode intervalles somme les distances et prédit r par les fonctions inverses (la carte totale peut dépasser 50 cM tandis que r sature à 50%). Sources : Sturtevant 1913, Haldane 1919, Kosambi 1944, Griffiths. Usage éducatif uniquement.

Health

Calculateur des Résistances Vasculaires Pulmonaires (PVR)

Calcule les résistances vasculaires pulmonaires PVR = (mPAP − PCWP)/CO (Wood) = 80×(mPAP − PCWP)/CO (dyn·s/cm⁵). mPAP pression artérielle pulmonaire moyenne, PCWP pression capillaire pulmonaire (≈ pression OG), CO débit cardiaque. Normale <3 Wood (<240 dyn·s/cm⁵) ; élevée dans l'HTAP (groupe 1, groupes 2-5), l'hypoxie, l'EP, le shunt G-D. La PVR distingue l'HTP pré-capillaire (mPAP>20, PCWP≤15) de post-capillaire (PCWP>15) et est la cible du traitement médicamenteux de l'HTAP. Sources : Grossman 1991, Simonneau JACC 2019, Humbert ESC/ERS 2022, StatPearls, LITFL. Non un avis médical.

Health

Calculateur du Produit Fréquence-Pression (RPP)

Calcule le produit fréquence-pression RPP = FC × PAS (bpm × mmHg), aussi appelé double produit, un indice non invasif de la consommation d'O₂ myocardique (MVO₂) corrélé à la mesure directe en cathétérisme. Souvent exprimé en RPP×10⁻³. Repos normal 6 000–10 000 ; >12 000 seuil angineux (MVO₂ dépasse l'apport) ; >20 000 ischémie sévère de demande. Utilisé dans l'épreuve d'effort pour évaluer la charge atteinte et titrer les bêtabloquants (baissez FC et PAS → baissez RPP → réduisez MVO₂ ; post-IDM FC 55-60 → RPP <8 000). Limite : ne reflète que FC×pression, sans contractilité ni tension pariétale ; sous inotropes la MVO₂ peut être élevée avec un RPP « normal ». Sources : Gobel Circulation 1978, StatPearls, LITFL, Braunwald, Fletcher 2013. Non un avis médical.

Health

Calculateur de Pression Pulsée (PP = PAS − PAD)

Calcule la pression pulsée PP = PAS − PAD, un substitut du volume d'éjection et de la compliance aortique ; rapporte aussi MAP = PAD + PP/3. Physiologie : PP ∝ volume d'éjection/compliance. Normale ~30–40 mmHg (~25% de PAS) ; élargie (>50–60) suggère haut volume d'éjection (insuffisance aortique/anxiété/fièvre/anémie/hyperthyroïdie/PDA) ou artères rigides (âge/athérome) ; rétrécie (<25–30) suggère bas volume d'éjection (IC/tamponnade/constriction/hypovolémie/sténose aortique sévère). Pouls paradoxal (chute PP >10 à l'inspiration) → tamponnade, asthme/BPCO sévère, pneumothorax suffocant, EP. Sources : McDonald's, Franklin 1999, Blacher 1999, StatPearls, LITFL. Non un avis médical.

Health

Calculateur de Correction du Potassium (Vitesse et Limites)

Calcule les paramètres sûrs de correction du potassium. Voie orale préférée : dose unique 20–40 mEq KCl, maximum quotidien ~120 mEq (1 g KCl = 13.4 mEq K⁺). IV périphérique : ≤10 mEq/h, concentration ≤40 mEq/L (éviter la phlébite) ; IV central (réanimation + scope) : ≤20 mEq/h, ≤80 mEq/L ; plafond IV quotidien 240 mEq. Une baisse de 1 mmol/L ≈ 100–200 mEq de déficit (estimé par poids). Sécurité : KCl IV TOUJOURS sur pompe, JAMAIS en bolus (arrêt cardiaque) ; >10 mEq/h sous monitorage ECG continu ; contrôle K⁺ q2–4h ; corriger d'abord l'hypomagnésémie ; éviter les solutés glucosés. Sources : Gennari NEJM 1998, Cohn 2000, Kraft 2005, MDCalc, Asmar 2023. Non un avis médical.

Health

Analyseur de l'Indice de Distribution des Globules Rouges (RDW)

Analyse la largeur de distribution des globules rouges (RDW) pour différencier les anémies. RDW-CV référence ~11.5–14.5%, RDW-SD ~39–46 fL (dépend du laboratoire). RDW élevé → anisocytose. Classification de Bessman : RDW élevé + VGM bas → anémie ferriprive (s'élève précocement, avant Hb/VGM) ; RDW normal + VGM bas → trait thalassémique (microcytose uniforme). Autres : RDW élevé + VGM élevé → anémie mégaloblastique (B12/folates), SMD, médicaments, hémolyse avec réticulocytose, préleucémie, populations mixtes ; RDW élevé + VGM normal → carence précoce/mixte, anémie dimorphe, post-transfusion, moelle en récupération ; RDW normal + VGM normal → anémie inflammatoire (normocytaire normochrome). Interpréter avec Hb, ferritine, électrophorèse de l'Hb et clinique. Sources : Bessman 1983, Teixeira 2014. Non un avis médical.

Health

Score de Ranson (pancréatite aiguë, non lithiasique)

Évalue la gravité et la mortalité de la pancréatite aiguë (variante classique non lithiasique) : 5 critères à l'admission (âge >55, leucocytes >16 000, glycémie >200, ASAT >250, LDH >350) + 6 critères à 48 h (chute de l'hématocrite >10%, augmentation de l'urée >5, Ca <8, PaO₂ <60, déficit de base >4, séquestration liquidienne >6 L) ; 1 point chacun, total 0-11. 0-2 léger (~2%), 3-4 modéré (~15%), 5-6 sévère (~40%), ≥7 très sévère (~100%). La pancréatite lithiasique a des seuils différents ; cet outil applique uniquement les critères classiques. Source : Ranson 1974. Non un avis médical.