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Calculadora de massa molecular de proteína (por sequência)
Calcula a massa molecular de uma proteína a partir da sequência: MW = Σ massas médias dos resíduos + H₂O (18,01524 Da), com a mesma tabela do ExPASy ProtParam (A 71,0788 … W 186,2132). A entrada não diferencia maiúsculas; espaços e separadores * - . são removidos; códigos de ambiguidade (B/J/O/U/X/Z) não são somados, mas contados e reportados. O resultado é a cadeia polipeptídica não modificada: sem remoção de peptídeo sinal, pontes dissulfeto (−2H por ponte), PTMs ou tags. Retorna kDa, massa média por resíduo e comprimento. Fontes: ExPASy ProtParam (Gasteiger 2005), manual de Fasman. Apenas para educação.
Execução
Executar esta ferramenta
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Exemplos
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Guia de uso da ferramenta
Veja quando usar esta ferramenta, o que ela suporta e como os usuários a aplicam.
Fatos principais
Categoria
Education
Tipos de entrada
textarea, number
Tipo de saída
json
Cobertura de exemplos
4
API pronta
Sim
Visão geral
Calcule a massa molecular média de uma proteína a partir da sequência de aminoácidos. A ferramenta soma as massas médias dos resíduos, adiciona H₂O e retorna o valor em Da, kDa, a massa média por resíduo e o comprimento da cadeia.
Quando usar
Estimar a massa molecular de uma proteína ou peptídeo a partir da sequência.
Converter uma sequência de aminoácidos em massa aproximada em Da e kDa.
Conferir sequências padrão ou tags de afinidade antes de planejar um experimento.
Como funciona
1Insira a sequência de aminoácidos usando o código de uma letra, sem distinguir maiúsculas de minúsculas.
2A ferramenta remove espaços e os separadores * - . da entrada.
3As massas médias dos resíduos são somadas e a massa de H₂O, 18,01524 Da, é adicionada.
4O resultado informa massa em Da e kDa, comprimento, massa média por resíduo e eventuais códigos ambíguos.
Casos de uso
Estimativa rápida da massa de proteínas recombinantes e peptídeos.
Verificação de tags de afinidade e sequências usadas em construções de expressão.
Conferência educacional de tabelas de massas médias de aminoácidos.
Exemplos
1. Tag His MGSSHHHHHHSSGLVPRGSH
Pesquisador de expressão proteica
Contexto
Uma construção recombinante contém a sequência padrão MGSSHHHHHHSSGLVPRGSH antes da proteína de interesse.
Problema
Estimar a contribuição de massa da tag para comparar a construção marcada com a versão sem tag.
Como usar
Insira a sequência no campo de aminoácidos e mantenha 2 casas decimais.