Analisador de composição de aminoácidos

Analisador de composição de aminoácidos | Ferramenta online grátis | Elysia Tools

Guia de uso da ferramenta

Veja quando usar esta ferramenta, o que ela suporta e como os usuários a aplicam.

Fatos principais

Categoria: Education
Tipos de entrada: textarea, number
Tipo de saída: json
Cobertura de exemplos: 4
API pronta: Sim

Visão geral

Analise uma sequência de aminoácidos para obter contagens e percentagens molares dos 20 aminoácidos padrão, estatísticas por grupo, GRAVY pela escala de Kyte–Doolittle e massa molecular segundo a tabela ProtParam. A ferramenta é destinada a fins educativos.

Quando usar

Quando precisar verificar rapidamente a composição de uma sequência proteica.
Quando quiser estimar a tendência hidrofóbica ou hidrofílica pelo valor GRAVY.
Quando precisar comparar conteúdos de aminoácidos, grupos de resíduos ou massa molecular.

Como funciona

1Cole a sequência de aminoácidos no campo de entrada, usando códigos de uma letra.
2A ferramenta ignora maiúsculas e minúsculas, espaços e os separadores *, - e .
3Defina, se necessário, o número de casas decimais entre 0 e 8.
4Consulte as contagens, percentagens molares, grupos de resíduos, GRAVY, códigos ambíguos e massa molecular.

Casos de uso

Avaliação inicial da composição de tags de afinidade e pequenos peptídeos.
Comparação da hidrofobicidade média entre sequências proteicas.
Apoio a aulas e exercícios de bioquímica sobre resíduos, hidropatia e massa molecular.

Exemplos

1. Analisar uma tag 6×His

Estudante de biologia molecular

Contexto

Uma tag de afinidade pode ser analisada antes de ser ligada a uma proteína recombinante.

Problema

Verificar a contribuição de histidinas e serinas e estimar a tendência hidrofílica da sequência.

Como usar

Insira `MGSSHHHHHHSSGLVPRGSH` e mantenha 2 casas decimais.

Sequência: MGSSHHHHHHSSGLVPRGSH; casas decimais: 2

Resultado

A sequência de 20 resíduos apresenta H = 35,00 mol%, S = 25,00 mol%, G = 15,00 mol% e GRAVY = −1,19, indicando tendência hidrofílica.

2. Verificar uma sequência de poli-alanina

Professor de bioquímica

Contexto

Uma sequência homopolimérica simples pode servir como exemplo para validar o cálculo de composição e hidropatia.

Problema

Confirmar o efeito de uma única espécie de aminoácido no resultado global.

Como usar

Insira `AAAAAAAAAA` e selecione 2 casas decimais.

Perguntas frequentes

Que sequência posso inserir?

Insira uma sequência de aminoácidos com códigos de uma letra, sem necessidade de distinguir maiúsculas de minúsculas.

Como são tratados espaços e separadores?

Espaços e os caracteres *, - e . são ignorados durante a análise.

O que significa o valor GRAVY?

É a média dos valores de hidropatia de Kyte–Doolittle. Valores acima de zero indicam tendência hidrofóbica; abaixo de zero, tendência hidrofílica.

Os códigos ambíguos entram nas percentagens?

Não. B, J, O, U, X e Z são contados separadamente e excluídos das percentagens molares.

Posso usar os resultados para diagnóstico ou decisões clínicas?

Não. A ferramenta é destinada apenas a educação e planeamento experimental.

Sequência: AAAAAAAAAA; casas decimais: 2

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Fatos principais

Visão geral

Quando usar

Como funciona

Casos de uso

Exemplos

1. Analisar uma tag 6×His

2. Verificar uma sequência de poli-alanina

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