Berechnet die Molekularmasse eines Proteins aus der Sequenz: MW = Σ mittlere Restmassen + H₂O (18,01524 Da), mit derselben Tabelle wie ExPASy ProtParam (A 71,0788 … W 186,2132). Die Eingabe ist case-insensitiv; Leerzeichen und Trennzeichen * - . werden entfernt; Ambiguitätscodes (B/J/O/U/X/Z) werden nicht summiert, aber gezählt und gemeldet. Das Ergebnis ist die unmodifizierte Polypeptidkette: ohne Signalpeptid-Abspaltung, Disulfidbrücken (−2H pro Brücke), PTMs oder Tags. Liefert kDa, mittlere Restmasse und Länge. Quellen: ExPASy ProtParam (Gasteiger 2005), Fasman-Handbuch. Nur für Ausbildung.
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Wichtige Fakten
Kategorie
Education
Eingabetypen
textarea, number
Ausgabetyp
json
Sample-Abdeckung
4
API bereit
Ja
Überblick
Der Protein-Molekularmassen-Rechner bestimmt die Molekularmasse einer unmodifizierten Polypeptidkette aus ihrer Aminosäuresequenz. Er liefert die Masse in Da und kDa, die mittlere Restmasse sowie die Sequenzlänge nach der mittleren Restmassentabelle von ExPASy ProtParam.
Wann verwenden
Wenn Sie die theoretische Molekularmasse eines Proteins oder Peptids aus einer Ein-Buchstaben-Sequenz berechnen möchten.
Wenn Sie eine erwartete SDS-PAGE-Bandengröße oder eine Konstruktmasse grob einordnen möchten.
Wenn Sie Sequenzlänge, mittlere Restmasse und Molekularmasse für Ausbildungs- oder Laborplanungen benötigen.
So funktioniert es
1Geben Sie die Aminosäuresequenz im Ein-Buchstaben-Code ein; Groß- und Kleinschreibung werden gleichermaßen erkannt.
2Leerzeichen sowie die Trennzeichen *, - und . werden automatisch entfernt.
3Die mittleren Restmassen der Standardaminosäuren werden addiert und um 18,01524 Da für Wasser ergänzt.
4Das Ergebnis zeigt Da, kDa, Sequenzlänge und mittlere Masse pro Rest; die Dezimalstellen können von 0 bis 8 festgelegt werden.
Anwendungsfälle
Theoretische Massenbestimmung von rekombinanten Proteinen, Peptiden und Fusionskonstrukten.
Schneller Vergleich einer berechneten Konstruktmasse mit einer erwarteten experimentellen Proteinbande.
Übungs- und Selbstkontrolle bei der Auswertung von Aminosäuresequenzen in der Biochemie.
Beispiele
1. Molekularmasse eines 6×His-Tags berechnen
Proteinbiologin
Hintergrund
Für die Planung eines Expressionskonstrukts soll die Masse der Sequenz MGSSHHHHHHSSGLVPRGSH bestimmt werden.
Aufgabe
Die zusätzliche Masse des Affinitätstags soll von der Masse des vollständigen Fusionsproteins unterschieden werden.
Verwendung
Geben Sie die Sequenz in das Feld „Aminosäuresequenz“ ein und wählen Sie 2 Dezimalstellen.
Sequenz: MGSSHHHHHHSSGLVPRGSH; Dezimalstellen: 2
Ergebnis
Der Rechner gibt 2181,34 Da beziehungsweise 2,18 kDa für 20 Reste aus.
2. Kontrollsequenz mit allen Standardaminosäuren
Studierender
Hintergrund
Eine Lehrveranstaltung verwendet eine Sequenz, die jede der 20 Standardaminosäuren genau einmal enthält.
Aufgabe
Die Berechnung soll als Plausibilitätskontrolle für eine Sequenz-Massentabelle dienen.
Verwendung
Geben Sie ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY ein und setzen Sie die Dezimalstellen auf 2.
FAQ
Welche Sequenz kann ich eingeben?
Verwenden Sie eine Aminosäuresequenz im Ein-Buchstaben-Code. Die Eingabe ist nicht zwischen Groß- und Kleinschreibung unterscheidend.
Werden Leerzeichen und Trennzeichen berücksichtigt?
Leerzeichen sowie *, - und . werden vor der Berechnung entfernt.
Wie wird die Molekularmasse berechnet?
Die mittleren Restmassen werden summiert und anschließend 18,01524 Da für Wasser addiert.
Was passiert mit Ambiguitätscodes wie X oder B?
B, J, O, U, X und Z werden nicht in die Masse einbezogen, sondern gezählt und im Ergebnis gemeldet.
Berücksichtigt der Rechner Modifikationen oder Disulfidbrücken?
Nein. Das Ergebnis beschreibt die unmodifizierte Polypeptidkette ohne Signalpeptid-Abspaltung, Disulfidbrücken, PTMs oder Tags.