Calculadora de peso molecular de proteínas (por secuencia)

Calculadora de peso molecular de proteínas (por secuencia) | Herramienta online gratis | Elysia Tools

Guía de uso de la herramienta

Conoce cuándo usar esta herramienta, qué admite y cómo la aplican los usuarios.

Datos clave

Categoría: Education
Tipos de entrada: textarea, number
Tipo de salida: json
Cobertura de ejemplos: 4
API disponible: Sí

Resumen

Calcula el peso molecular aproximado de una proteína o péptido a partir de su secuencia de aminoácidos. Usa masas promedio de residuos y añade H₂O, y devuelve la masa en Da, kDa, la longitud y la masa media por residuo. Es una herramienta educativa para analizar cadenas polipeptídicas sin modificar.

Cuándo usarlo

Estimar la masa molecular de una proteína o péptido desde una secuencia de una letra.
Convertir rápidamente la masa calculada entre daltons y kilodaltons.
Comprobar secuencias cortas, etiquetas peptídicas o conjuntos de aminoácidos estándar.

Cómo funciona

1Introduce la secuencia de aminoácidos usando códigos de una letra, sin importar mayúsculas o minúsculas.
2La herramienta elimina espacios y los separadores *, - y . antes del cálculo.
3Suma las masas promedio de los residuos reconocidos y añade 18,01524 Da correspondientes a H₂O.
4Muestra la masa en Da y kDa, la longitud y la masa media por residuo; los códigos ambiguos B, J, O, U, X y Z se cuentan y se reportan, pero no se suman.

Casos de uso

Estimar el tamaño molecular de una cadena para planificar una práctica de bioquímica.
Calcular la contribución de una etiqueta peptídica, como una etiqueta 6×His, a una construcción recombinante.
Verificar una tabla de masas con una secuencia que contiene cada uno de los 20 aminoácidos estándar.

Ejemplos

1. Masa de una etiqueta His estándar

Investigador de proteínas

Contexto

Una construcción recombinante incorpora la secuencia de etiqueta MGSSHHHHHHSSGLVPRGSH.

Problema

Necesita estimar cuánto aporta la etiqueta al peso molecular total de la proteína.

Cómo usarlo

Introduce la secuencia en el campo de aminoácidos y conserva 2 decimales.

Secuencia: MGSSHHHHHHSSGLVPRGSH; decimales: 2.

Resultado

La herramienta devuelve aproximadamente 2181,34 Da, equivalentes a 2,18 kDa, para 20 residuos, con una masa media de 108,17 Da por residuo.

2. Comprobación con los 20 aminoácidos estándar

Estudiante de bioquímica

Contexto

Para comprobar la tabla de masas, utiliza una secuencia que contiene una vez cada aminoácido estándar: ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY.

Problema

Quiere confirmar la masa calculada y comparar la media por residuo con la aproximación habitual de 110 Da.

Cómo usarlo

Pega la secuencia, selecciona 2 decimales y ejecuta el cálculo.

Preguntas frecuentes

¿Qué formato debe tener la secuencia?

Usa códigos de aminoácidos de una letra. La entrada admite mayúsculas o minúsculas y puede incluir espacios o los separadores *, - y .

¿Qué fórmula utiliza la calculadora?

Calcula MW como la suma de las masas promedio de los residuos más 18,01524 Da de H₂O.

¿Incluye modificaciones postraduccionales o puentes disulfuro?

No. El resultado corresponde a una cadena polipeptídica sin modificar y no descuenta puentes disulfuro ni incluye modificaciones, etiquetas o eliminación de péptidos señal.

¿Cómo trata los códigos ambiguos?

B, J, O, U, X y Z no se incorporan a la suma de masa, pero se cuentan y se reportan en el resultado.

¿Puedo cambiar el número de decimales?

Sí. Puedes seleccionar entre 0 y 8 decimales; el valor predeterminado es 2.

Secuencia: ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY; decimales: 2.

Ejecutar esta herramienta

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Cuándo usarlo

Cómo funciona

Casos de uso

Ejemplos

1. Masa de una etiqueta His estándar

2. Comprobación con los 20 aminoácidos estándar

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