Какие единицы измерения выдаёт калькулятор?

Результат показывается в дальтонах и килодальтонах, а также включает среднюю массу одного остатка.

Учитываются ли пробелы и разделители в последовательности?

Нет. Пробелы и разделители * - . автоматически отбрасываются.

Что происходит с кодами B, J, O, U, X и Z?

Они не включаются в расчёт массы, но подсчитываются и отмечаются в результате.

Учитывает ли расчёт дисульфидные мостики и модификации?

Нет. Рассчитывается немодифицированная цепь без дисульфидных мостиков, ПТМ, меток и удаления сигнального пептида.

Какую точность результата можно выбрать?

Можно задать от 0 до 8 знаков после запятой.

Elysia Tools

Навигация

Education

Калькулятор молекулярной массы белка (по последовательности)

Вычисляет молекулярную массу белка по последовательности: MW = Σ средних масс остатков + H₂O (18,01524 Да), по той же таблице, что ExPASy ProtParam (A 71,0788 … W 186,2132). Ввод нечувствителен к регистру, пробелы и разделители * - . отбрасываются; коды неоднозначности (B/J/O/U/X/Z) не суммируются, но подсчитываются и отмечаются. Результат — немодифицированная полипептидная цепь: без удаления сигнального пептида, дисульфидных мостиков (−2H на мостик), ПТМ и меток. Возвращает кДа, среднюю массу остатка и длину. Источники: ExPASy ProtParam (Gasteiger 2005), справочник Fasman. Только для обучения.

Запуск

Запустить этот инструмент

Заполните форму, запустите инструмент и посмотрите результат на этой же странице.

Подготовленные примеры запуска

Нажмите пример, чтобы автоматически заполнить форму. Файлы по-прежнему нужно загрузить.

2 примеров

His-метка MGSSHHHHHHSSGLVPRGSH → 2181,34 Да (20 остатков)

Стандартная 6×His аффинная метка векторов pET (MGSSHHHHHHSSGLVPRGSH — обратите внимание на седьмой гис на C-конце) даёт 2163,3232 Да остатков плюс 18,0152 Да воды = 2181,34 Да — именно это значение обычно цитируют для данного 20-мера. Это число вычитают, переводя SDS-полосу меченой конструкции в массу без метки.

{"result":"Molecular weight ≈ 2181.34 Da = 2.18 kDa (20 residues, mean 108.17 Da/residue).","metadata":{"input":{"length":20},"result":{"mwDa":2181.34,"mwKda":2.18,"residueCount":20}}}

Каждый остаток по одному разу: ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY → 2395,74 Да

Самопроверочная последовательность ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY (каждая из 20 стандартных аминокислот ровно один раз) весит 2395,74 Да с учётом воды. Это быстрый способ убедиться, что таблица масс цела: средняя масса остатка 118,89 Да, близко к эмпирическим ~110 Да для природных белков.

{"result":"Molecular weight ≈ 2395.74 Da = 2.4 kDa (20 residues, mean 118.89 Da/residue).","metadata":{"input":{"length":20},"result":{"mwDa":2395.74,"residueCount":20}}}

Ввод

Заполните нужные поля и запустите инструмент.

2 параметров

СодержимоеВставьте или введите основные значения.1

Последовательность аминокислотtextareaОбязательноOne-letter amino-acid sequence (case-insensitive; spaces and * - . separators are ignored).

НастройкиНастройте форматы, диапазоны, числа и режимы.1

Знаков после запятойnumberНеобязательно

Результат

Готово к запуску

После запуска здесь появятся файлы, текст, структурированные данные или потоковый вывод.

Примеры

Примеры для этого инструмента

Связано

Калькулятор молекулярной массы белка (по последовательности)

Запустить этот инструмент

Подготовленные примеры запуска

Ввод

Результат

Примеры для этого инструмента

Продолжить с похожими инструментами и темами

Подготовленные примеры запуска

Ввод

Результат

Узнайте, когда использовать этот инструмент, что он поддерживает и как его применяют пользователи.

Ключевые факты

Обзор

Когда использовать

Как это работает

Сценарии использования

Примеры

1. Расчёт массы 6×His-метки

2. Проверка набора из 20 стандартных аминокислот

FAQ

Примеры Обработки Изображений Web Python

FLAC Аудио Образцы Без Авторских Прав

WAV Аудио Образцы Без Авторских Прав

Примеры Обработки Изображений Android Java

Анализатор аминокислотного состава

Симулятор эффекта бутылочного горлышка (потеря гетерозиготности)

Калькулятор длины рестрикционных фрагментов

Калькулятор эффективности трансфекции (доля GFP+)

Инструменты для количественного анализа белков, ферментной кинетики и анализа последовательностей

Инструменты для штрихкодов, QR-кодов и этикеток

Инструменты кодирования и конвертации аудио

Инструменты конвертации форматов изображений и анимированного экспорта