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Calculadora de massa de peptídeos (monoisotópica/média)
Calcula a massa de um peptídeo somando resíduos: M = Σ massas de resíduo + H₂O (tabela ExPASy ProtParam). Dois modos: monoisotópica (H₂O = 18,01056, ideal para peptídeos curtos em MS de alta resolução) ou média (H₂O = 18,01524, para cadeias mais longas), com os íons [M+H]⁺, [M+Na]⁺ e [M+2H]²⁺. A sequência não diferencia maiúsculas e ignora espaços e separadores; os códigos de ambiguidade B/J/O/U/X/Z são rejeitados. Fonte: ExPASy ProtParam (Gasteiger 2005). Apenas para educação.
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Exemplos
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Guia de uso da ferramenta
Veja quando usar esta ferramenta, o que ela suporta e como os usuários a aplicam.
Fatos principais
Categoria
Education
Tipos de entrada
text, select, number
Tipo de saída
json
Cobertura de exemplos
4
API pronta
Sim
Visão geral
A Calculadora de massa de peptídeos calcula a massa neutra a partir da sequência de aminoácidos usando as massas de resíduos da tabela ExPASy ProtParam. Escolha entre massa monoisotópica ou média e obtenha também os valores dos íons [M+H]⁺, [M+Na]⁺ e [M+2H]²⁺. Uso exclusivamente educacional.
Quando usar
Estimar a massa de peptídeos curtos para planejamento de análises por espectrometria de massas de alta resolução.
Calcular a massa média de cadeias peptídicas mais longas.
Comparar uma sequência de aminoácidos com valores esperados de massa e íons carregados.
Como funciona
1Insira uma sequência de 1 a 200 aminoácidos usando códigos de uma letra.
2Escolha o tipo de massa: monoisotópica ou média.
3Defina de 0 a 8 casas decimais, se necessário.
4A ferramenta soma as massas dos resíduos, acrescenta H₂O e apresenta a massa neutra e os valores de m/z dos íons calculados.
Casos de uso
Planejamento educacional de experimentos de espectrometria de massas.
Verificação rápida da massa teórica de sequências peptídicas.
Comparação entre valores monoisotópicos e médios em estudos de bioquímica.
Exemplos
1. Massa monoisotópica da angiotensina II
Estudante de bioquímica
Contexto
A sequência DRVYIHPF é usada como exemplo clássico em tutoriais de espectrometria de massas de peptídeos.
Problema
Calcular a massa neutra e o íon protonado da angiotensina II.
Como usar
Insira DRVYIHPF, selecione Monoisotópica e defina 4 casas decimais.
Sequência: DRVYIHPF; tipo de massa: monoisotópica; casas decimais: 4.
Resultado
A massa neutra é 1045,5345 Da e o íon [M+H]⁺ é 1046,5418.
2. Massa média do tetrapeptídeo GGFL
Pesquisador em planejamento experimental
Contexto
GGFL é um tetrapeptídeo simples para verificar cálculos de massa média e adutos iônicos.
Problema
Obter a massa média e o valor esperado do aduto de sódio.
Como usar
Insira GGFL, selecione Média e mantenha 4 casas decimais.
Sequência: GGFL; tipo de massa: média; casas decimais: 4.
Perguntas frequentes
Quais sequências podem ser inseridas?
São aceitos códigos de aminoácidos de uma letra em sequências de 1 a 200 resíduos.
A ferramenta diferencia letras maiúsculas e minúsculas?
Não. A sequência não diferencia maiúsculas e minúsculas e ignora espaços e separadores.
Quais códigos são rejeitados?
Os códigos de ambiguidade B, J, O, U, X e Z são rejeitados.
Qual é a diferença entre massa monoisotópica e média?
A monoisotópica é indicada para peptídeos curtos em MS de alta resolução; a média é adequada para cadeias mais longas.
Quais valores são apresentados no resultado?
O resultado inclui a massa neutra M e os íons [M+H]⁺, [M+Na]⁺ e [M+2H]²⁺.