Welche Sequenzen akzeptiert der Rechner?

Akzeptiert werden Sequenzen aus den Standardcodes für Aminosäuren mit 1 bis 200 Resten. Groß- und Kleinschreibung sowie Leerzeichen und Trennzeichen werden ignoriert.

Was ist der Unterschied zwischen monoisotopischer und durchschnittlicher Masse?

Die monoisotopische Masse verwendet einzelne Isotopenmassen und eignet sich besonders für kurze Peptide in der hochauflösenden MS. Die Durchschnittsmasse berücksichtigt die natürliche Isotopenverteilung und eignet sich eher für längere Ketten.

Welche Werte werden ausgegeben?

Ausgegeben werden die neutrale Masse M sowie die Werte für [M+H]⁺, [M+Na]⁺ und [M+2H]²⁺.

Warum werden bestimmte Buchstabencodes abgelehnt?

Die Mehrdeutigkeitscodes B, J, O, U, X und Z werden abgelehnt, weil keine eindeutige Standard-Residuumsmassse dafür verwendet wird.

Ist der Rechner für klinische oder diagnostische Entscheidungen geeignet?

Nein. Das Tool dient ausschließlich Ausbildungszwecken und der theoretischen Labor- beziehungsweise Versuchsplanung.

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Peptidmassen-Rechner (monoisotopisch/durchschnittlich)

Berechnet die Peptidmasse durch Residuumssummation: M = Σ Residuumsmassen + H₂O (ExPASy-ProtParam-Tabelle). Zwei Modi: monoisotopisch (H₂O = 18,01056, ideal für kurze Peptide in der hochauflösenden MS) oder durchschnittlich (H₂O = 18,01524, für längere Ketten), mit den Ionen [M+H]⁺, [M+Na]⁺ und [M+2H]²⁺. Groß-/Kleinschreibung ist egal, Leerzeichen und Trennzeichen werden entfernt; Mehrdeutigkeitscodes B/J/O/U/X/Z werden abgelehnt. Quelle: ExPASy ProtParam (Gasteiger 2005). Nur für Ausbildung.

Ausführung

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Vorbereitete Beispielausführungen

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2 Beispiele

Angiotensin II (DRVYIHPF) — monoisotopisch 1045,5345 Da

Angiotensin II hat die Sequenz DRVYIHPF. Die Summe der acht monoisotopen Residuumsmassen plus H₂O ergibt M = 1045,5345 Da, das übliche ESI-Ion ist [M+H]⁺ = 1046,5418 — der Lehrbuchwert aus Peptid-MS-Tutorials.

{"result":"DRVYIHPF (8 residues) monoisotopic: M = 1045.5345 Da, [M+H]+ = 1046.5418, [M+Na]+ = 1068.5237","metadata":{"result":{"neutralMass":1045.5345,"protonatedMh":1046.5418,"length":8}}}

GGFL — Durchschnittsmasse 392,4550 Da

Das Tetrapeptid Gly-Gly-Phe-Leu ist ein klassischer Synthesestandard. Mit durchschnittlichen Massen der natürlichen Isotopenverteilung beträgt die neutrale Masse 392,4550 Da und das Natriumaddukt [M+Na]⁺ liegt bei 415,4443 — beim MALDI-Schnellcheck oft die dominante Spezies.

{"result":"GGFL (4 residues) average: M = 392.455 Da, [M+H]+ = 393.4623, [M+Na]+ = 415.4443","metadata":{"result":{"neutralMass":392.455,"sodiatedMNa":415.4443,"length":4}}}

Eingaben

Fülle die erforderlichen Felder aus und starte das Tool.

3 Optionen

InhaltHaupteingaben einfügen oder eingeben.1

PeptidsequenztextPflichtSingle-letter amino acid codes; 1–200 residues.

EinstellungenFormate, Bereiche, Zahlen und Modi anpassen.2

MassentypselectPflichtMonoisotopic for short peptides in HRMS; average for longer chains.DezimalstellennumberOptionales Feld

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2. GGFL mit Durchschnittsmasse prüfen

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