Какие последовательности принимает калькулятор?

Последовательности из однобуквенных кодов стандартных аминокислот длиной от 1 до 200 остатков.

Учитывается ли регистр букв?

Нет. Заглавные и строчные буквы обрабатываются одинаково, а пробелы и разделители игнорируются.

Можно ли использовать коды B, J, O, U, X и Z?

Нет. Коды неоднозначности B, J, O, U, X и Z отклоняются.

Что означает параметр «Знаков после запятой»?

Он задаёт количество знаков после запятой в отображаемом результате: от 0 до 8.

Elysia Tools

Навигация

Education

Калькулятор массы пептида (моноизотопная/средняя)

Вычисляет массу пептида суммированием остатков: M = Σ масс остатков + H₂O (таблица ExPASy ProtParam). Два режима: моноизотопный (H₂O = 18,01056, подходит для коротких пептидов в высокоразрешающей масс-спектрометрии) или средний (H₂O = 18,01524, для более длинных цепей), с ионами [M+H]⁺, [M+Na]⁺ и [M+2H]²⁺. Регистр не важен, пробелы и разделители игнорируются; коды неоднозначности B/J/O/U/X/Z отклоняются. Источник: ExPASy ProtParam (Gasteiger 2005). Только для обучения.

Запуск

Запустить этот инструмент

Заполните форму, запустите инструмент и посмотрите результат на этой же странице.

Подготовленные примеры запуска

Нажмите пример, чтобы автоматически заполнить форму. Файлы по-прежнему нужно загрузить.

2 примеров

Ангиотензин II (DRVYIHPF) — моноизотопная 1045,5345 Da

Последовательность ангиотензина II — DRVYIHPF. Сумма восьми моноизотопных масс остатков плюс H₂O даёт M = 1045,5345 Da, поэтому обычный ион ESI — [M+H]⁺ = 1046,5418, что совпадает с учебным значением из руководств по масс-спектрометрии пептидов.

{"result":"DRVYIHPF (8 residues) monoisotopic: M = 1045.5345 Da, [M+H]+ = 1046.5418, [M+Na]+ = 1068.5237","metadata":{"result":{"neutralMass":1045.5345,"protonatedMh":1046.5418,"length":8}}}

GGFL — средняя масса 392,4550 Da

Тетрапептид Gly-Gly-Phe-Leu — классический стандарт синтеза. По средним массам природной смеси нейтральная масса равна 392,4550 Da, а натриевый аддукт [M+Na]⁺ находится при 415,4443 — часто это главный пик при проверке MALDI.

{"result":"GGFL (4 residues) average: M = 392.455 Da, [M+H]+ = 393.4623, [M+Na]+ = 415.4443","metadata":{"result":{"neutralMass":392.455,"sodiatedMNa":415.4443,"length":4}}}

Ввод

Заполните нужные поля и запустите инструмент.

3 параметров

СодержимоеВставьте или введите основные значения.1

Последовательность пептидаtextОбязательноSingle-letter amino acid codes; 1–200 residues.

НастройкиНастройте форматы, диапазоны, числа и режимы.2

Tipo массыselectОбязательноMonoisotopic for short peptides in HRMS; average for longer chains.Знаков после запятойnumberНеобязательно

Результат

Готово к запуску

После запуска здесь появятся файлы, текст, структурированные данные или потоковый вывод.

Примеры

Примеры для этого инструмента

Связано

Калькулятор массы пептида (моноизотопная/средняя)

Запустить этот инструмент

Подготовленные примеры запуска

Ввод

Результат

Примеры для этого инструмента

Продолжить с похожими инструментами и темами

Подготовленные примеры запуска

Ввод

Результат

Узнайте, когда использовать этот инструмент, что он поддерживает и как его применяют пользователи.

Ключевые факты

Обзор

Когда использовать

Как это работает

Сценарии использования

Примеры

1. Расчёт массы ангиотензина II

2. Средняя масса тетрапептида GGFL

FAQ

Примеры Обработки Изображений Android Java

Примеры Обработки Изображений Android Kotlin

Примеры Обработки Изображений Web Python

Примеры Обработки Изображений Web Rust

Калькулятор множественности инфекции (MOI)

Тьютор по дрейфу популяций Райта—Фишера и частотам аллелей

Наглядный тренажёр дробей, десятичных и процентов

Калькулятор температуры отжига ПЦР (Ta = Tm − 5°C)

Инструменты для количественного анализа белков, ферментной кинетики и анализа последовательностей