¿Qué secuencias acepta la calculadora?

Acepta secuencias de 1 a 200 residuos con códigos estándar de aminoácidos de una letra.

¿Distingue entre mayúsculas y minúsculas?

No. Las mayúsculas y minúsculas se interpretan de la misma manera.

¿Puedo escribir la secuencia con espacios o separadores?

Sí. La herramienta ignora espacios y separadores al interpretar la secuencia.

¿Qué diferencia hay entre masa monoisotópica y promedio?

La monoisotópica usa masas isotópicas específicas y es adecuada para péptidos cortos en MS de alta resolución; la promedio usa abundancias naturales y resulta útil para cadenas más largas.

¿Qué ocurre si uso B, J, O, U, X o Z?

La secuencia se rechaza porque esos códigos ambiguos no están permitidos.

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Calculadora de masa de péptidos (monoisotópica/media)

Calcula la masa de un péptido sumando residuos: M = Σ masas de residuo + H₂O (tabla ExPASy ProtParam). Dos modos: monoisotópica (H₂O = 18,01056, ideal para péptidos cortos en MS de alta resolución) o promedio (H₂O = 18,01524, para cadenas más largas), con los iones [M+H]⁺, [M+Na]⁺ y [M+2H]²⁺. La secuencia no distingue mayúsculas y se ignoran espacios y separadores; los códigos ambiguos B/J/O/U/X/Z se rechazan. Fuente: ExPASy ProtParam (Gasteiger 2005). Solo para educación.

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2 ejemplos

Angiotensina II (DRVYIHPF) — monoisotópica 1045,5345 Da

La angiotensina II tiene la secuencia DRVYIHPF. Sumando las ocho masas monoisotópicas de residuo y añadiendo H₂O se obtiene M = 1045,5345 Da, por lo que el ion ESI habitual es [M+H]⁺ = 1046,5418, el valor de libro citado en los tutoriales de MS de péptidos.

{"result":"DRVYIHPF (8 residues) monoisotopic: M = 1045.5345 Da, [M+H]+ = 1046.5418, [M+Na]+ = 1068.5237","metadata":{"result":{"neutralMass":1045.5345,"protonatedMh":1046.5418,"length":8}}}

GGFL — masa promedio 392,4550 Da

El tetrapéptido Gly-Gly-Phe-Leu es un estándar clásico de síntesis. Con masas promedio de abundancia natural la masa neutra es 392,4550 Da y el aducto de sodio [M+Na]⁺ aparece en 415,4443, a menudo la especie dominante en las comprobaciones por MALDI.

{"result":"GGFL (4 residues) average: M = 392.455 Da, [M+H]+ = 393.4623, [M+Na]+ = 415.4443","metadata":{"result":{"neutralMass":392.455,"sodiatedMNa":415.4443,"length":4}}}

Entradas

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3 opciones

ContenidoPega o escribe los valores principales.1

Secuencia del péptidotextObligatorioSingle-letter amino acid codes; 1–200 residues.

AjustesAjusta formatos, rangos, números y modos.2

Tipo de masaselectObligatorioMonoisotopic for short peptides in HRMS; average for longer chains.DecimalesnumberOpcional

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1. Angiotensina II: masa monoisotópica

2. GGFL: masa promedio

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