Quelle séquence puis-je saisir ?

Saisissez une séquence de 1 à 200 résidus avec les codes d’acides aminés à une lettre.

Quelle est la différence entre masse monoisotopique et masse moyenne ?

La masse monoisotopique utilise des isotopes précis et convient notamment aux peptides courts en MS haute résolution. La masse moyenne convient davantage aux chaînes plus longues.

Les espaces et séparateurs sont-ils acceptés ?

Oui. Les espaces et séparateurs sont ignorés, tout comme la différence entre majuscules et minuscules.

Quels codes sont refusés ?

Les codes d’ambiguïté B, J, O, U, X et Z sont rejetés.

Quelles valeurs sont calculées ?

Le résultat comprend la masse neutre ainsi que les ions [M+H]⁺, [M+Na]⁺ et [M+2H]²⁺, selon le mode choisi.

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Calculateur de masse peptidique (monoisotopique/moyenne)

Calcule la masse d'un peptide par sommation des résidus : M = Σ masses des résidus + H₂O (table ExPASy ProtParam). Deux modes : monoisotopique (H₂O = 18,01056, idéal pour les courts peptides en MS haute résolution) ou moyenne (H₂O = 18,01524, pour des chaînes plus longues), avec les ions [M+H]⁺, [M+Na]⁺ et [M+2H]²⁺. La séquence ignore la casse, les espaces et séparateurs ; les codes d'ambiguïté B/J/O/U/X/Z sont rejetés. Source : ExPASy ProtParam (Gasteiger 2005). Uniquement à but éducatif.

Exécution

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2 exemples

Angiotensine II (DRVYIHPF) — monoisotopique 1045,5345 Da

L'angiotensine II a pour séquence DRVYIHPF. La somme des huit masses monoisotopiques des résidus plus H₂O donne M = 1045,5345 Da, d'où l'ion ESI usuel [M+H]⁺ = 1046,5418 — la valeur de référence citée dans les tutoriels de MS peptidique.

{"result":"DRVYIHPF (8 residues) monoisotopic: M = 1045.5345 Da, [M+H]+ = 1046.5418, [M+Na]+ = 1068.5237","metadata":{"result":{"neutralMass":1045.5345,"protonatedMh":1046.5418,"length":8}}}

GGFL — masse moyenne 392,4550 Da

Le tétrapeptide Gly-Gly-Phe-Leu est un étalon classique de synthèse. Avec les masses moyennes à abondance naturelle, la masse neutre vaut 392,4550 Da et l'adduit sodié [M+Na]⁺ se trouve à 415,4443 — souvent l'espèce dominante en contrôle MALDI.

{"result":"GGFL (4 residues) average: M = 392.455 Da, [M+H]+ = 393.4623, [M+Na]+ = 415.4443","metadata":{"result":{"neutralMass":392.455,"sodiatedMNa":415.4443,"length":4}}}

Entrées

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3 réglages

ContenuCollez ou saisissez les valeurs principales.1

Séquence du peptidetextRequisSingle-letter amino acid codes; 1–200 residues.

RéglagesAjustez formats, plages, nombres et modes.2

Type de masseselectRequisMonoisotopic for short peptides in HRMS; average for longer chains.DécimalesnumberOptionnel

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1. Masse monoisotopique de l’angiotensine II

2. Masse moyenne du tétrapeptide GGFL

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Calculateur de multiplicité d'infection (MOI)

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Outils de quantification des protéines, cinétique enzymatique et analyse de séquences