Explore o dobramento de proteinas atraves de funis de paisagem energetica, modelo HP e minimizacao de energia livre
Proteinas se dobram de cadeias desordenadas em estruturas 3D unicas. A estrutura nativa corresponde ao minimo global de energia livre G.
A paisagem energetica e uma superficie em forma de funil que mapeia cada conformacao a sua energia livre. O funil guia o dobramento.
O nucleo do modelo HP classifica residuos como Hidrofobicos (H) ou Polares (P) e usa contatos H-H nao ligados como termo principal. Esta pagina mantem esse nucleo e adiciona opcionalmente um bonus simplificado de contato P-P como proxy didatico de estabilizacao extra.
Compreender paisagens energeticas permite o design racional de farmacos. Moleculas pequenas devem se ligar ao minimo de energia do estado nativo.
AlphaFold (2020) revolucionou a predicao de estrutura proteica aprendendo a paisagem energetica a partir de dados evolutivos.
Observe a grade 2D: residuos H (laranja) tentam se agrupar enquanto P (azul) permanecem expostos. A paisagem coloca energia contra compacidade dentro de um funil esquematico.
1) Comece com 'Ideal' e observe o dobramento rapido. 2) Mude para 'Frustrado' para ver armadilhas cineticas. 3) Aumente a temperatura relativa. 4) Aumente o bonus polar para ver como o modelo remodela o funil.