Explora el plegamiento de proteinas mediante embudos de paisaje energetico, modelo HP y minimizacion de energia libre
Las proteinas se pliegan desde cadenas desordenadas hacia estructuras 3D unicas. La estructura nativa corresponde al minimo global de energia libre G.
El paisaje energetico es una superficie en forma de embudo que mapea cada conformacion a su energia libre. El embudo guia el plegamiento.
El nucleo del modelo HP clasifica residuos como Hidrofobicos (H) o Polares (P) y usa contactos H-H no enlazados como termino principal. Esta pagina conserva ese nucleo y agrega opcionalmente un bono simplificado de contacto P-P como proxy pedagogico de estabilizacion extra.
Comprender los paisajes energeticos permite el diseno racional de farmacos. Las moleculas pequenas deben unirse al minimo de energia del estado nativo.
AlphaFold (2020) revoluciono la prediccion de estructura proteica aprendiendo el paisaje energetico a partir de datos evolutivos.
Observe la red 2D: los residuos H (naranja) intentan agruparse mientras los P (azul) permanecen expuestos. El paisaje coloca energia frente a compacidad dentro de un embudo esquematico.
1) Comience con 'Ideal' y observe el plegamiento rapido. 2) Cambie a 'Frustrado' para ver trampas cineticas. 3) Aumente la temperatura relativa. 4) Suba el bono polar para ver como el modelo cambia el embudo.