Rekombinationsfrequenz- und Karten-Distanz-Rechner (cM) | Kostenloses Online-Tool | Elysia Tools
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Rekombinationsfrequenz- und Karten-Distanz-Rechner (cM)
Rechnet zwischen Rekombinationsfrequenz und kartografischer Distanz um. r = Rekombinanten / Gesamtnachkommen (r ≤ 0.5; strebt für weit entfernte Gene oder verschiedene Chromosomen gegen 0.5). Drei Mapping-Funktionen (d in Morgan, 1 M = 100 cM): linear d = r (nur kurze Distanzen); Haldane 1919: d = −½ln(1−2r) (ohne Interferenz); Kosambi 1944: d = ¼ln((1+2r)/(1−2r)) (positive Interferenz). Sie korrigieren die Unterschätzung durch Doppel-Crossover: bei gleichem r gilt Haldane ≥ Kosambi ≥ linear. Der Intervallmodus summiert Distanzen und sagt r über die Umkehrfunktionen vorher (Gesamtkarte > 50 cM möglich, während r bei 50% sättigt). Quellen: Sturtevant 1913, Haldane 1919, Kosambi 1944, Griffiths. Nur für Bildungszwecke.
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Leitfaden zur Tool-Nutzung
Erfahren Sie, wann dieses Tool passt, was es unterstützt und wie Nutzer es anwenden.
Wichtige Fakten
Kategorie
Education
Eingabetypen
select, number, text
Ausgabetyp
json
Sample-Abdeckung
4
API bereit
Ja
Überblick
Der Rekombinationsfrequenz- und Karten-Distanz-Rechner wandelt Nachkommenzahlen oder benachbarte Kartenintervalle in genetische Distanzen und vorhergesagte Rekombinationsraten um. Er verwendet die lineare, die Haldane- und die Kosambi-Mapping-Funktion und gibt Ergebnisse in cM aus. Das Tool dient ausschließlich zu Bildungszwecken.
Wann verwenden
Wenn aus Rekombinanten und der Gesamtzahl der Nachkommen die Rekombinationsfrequenz und Kartenentfernung berechnet werden sollen.
Wenn mehrere benachbarte genetische Intervalle zu einer Gesamtdistanz in cM summiert werden sollen.
Wenn der Einfluss von Doppel-Crossovers durch den Vergleich der linearen, Haldane- und Kosambi-Funktion veranschaulicht werden soll.
So funktioniert es
1Wähle den Modus „Anzahlen → Rekombination und Distanz“ oder „Intervalle → Gesamtdistanz und r“.
2Im Anzahlmodus werden Rekombinanten durch die Gesamtnachkommen geteilt: r = Rekombinanten / Gesamtnachkommen.
3Das Tool berechnet daraus die lineare Distanz sowie die Distanzen nach Haldane und Kosambi in cM.
4Im Intervallmodus werden kommagetrennte cM-Werte addiert; anschließend werden die Rekombinationsraten nach Haldane und Kosambi vorhergesagt.
Anwendungsfälle
Auswertung einfacher Testcross-Aufgaben in Genetik- und Biologieunterricht.
Vergleich verschiedener Mapping-Funktionen bei der Erstellung von Kopplungskarten.
Zusammenfassung mehrerer Kartenintervalle und Schätzung der Rekombinationsrate über die Gesamtstrecke.
Beispiele
1. Testcross mit 18 Rekombinanten
Biologiestudent
Hintergrund
In einem Testcross wurden 18 rekombinante Nachkommen unter insgesamt 100 Nachkommen gezählt.
Aufgabe
Die Rekombinationsfrequenz und die genetische Distanz sollen mit drei Mapping-Funktionen verglichen werden.
Verwendung
Wähle den Modus „Anzahlen → Rekombination und Distanz“, trage 18 bei „Rekombinanten“ und 100 bei „Nachkommen gesamt“ ein.
Dezimalstellen: 4
Ergebnis
Das Ergebnis ist r = 0,18 beziehungsweise 18 %. Die lineare Distanz beträgt 18 cM, nach Haldane 22,3144 cM und nach Kosambi 18,8443 cM.
2. Drei Kartenintervalle zusammenfassen
Lehrkraft für Genetik
Hintergrund
Eine Kopplungskarte enthält drei benachbarte Intervalle mit 5,2 cM, 8,1 cM und 12,0 cM.
Aufgabe
Die Gesamtdistanz und die erwartete Rekombinationsfrequenz über die gesamte Strecke sollen bestimmt werden.
Verwendung
Wähle den Modus „Intervalle → Gesamtdistanz und r“ und gib bei „Intervall-Distanzen in cM“ die Werte „5.2, 8.1, 12.0“ ein.
FAQ
Welche Eingaben benötigt der Anzahlmodus?
Er benötigt die Zahl der Rekombinanten und die Gesamtzahl der Nachkommen.
Was bedeutet die Rekombinationsfrequenz r?
r ist der Anteil der Rekombinanten an allen ausgewerteten Nachkommen. Für genetische Kopplung gilt r ≤ 0,5.
Warum liefert Haldane eine größere Distanz als die lineare Näherung?
Haldane berücksichtigt, dass Doppel-Crossovers in der beobachteten Rekombinationsfrequenz unentdeckt bleiben können.
Wie werden mehrere Intervalle eingegeben?
Gib die benachbarten Distanzen im Intervallmodus als kommagetrennte Werte ein, zum Beispiel „5.2, 8.1, 12.0“.
Kann die Gesamtdistanz im Intervallmodus über 50 cM liegen?
Ja. Die Kartendistanz kann über 50 cM steigen, während die beobachtbare Rekombinationsfrequenz bei 50 % sättigt.