Калькулятор частоты рекомбинации и генетических расстояний (сМ)
Преобразование между частотой рекомбинации и расстоянием на генетической карте. r = рекомбинанты / всё потомство (r ≤ 0.5; стремится к 0.5 для далёких генов или разных хромосом). Три функции картирования (d в морганидах, 1 М = 100 сМ): линейная d = r (только короткие расстояния); Холдейн 1919: d = −½ln(1−2r) (без интерференции); Косамби 1944: d = ¼ln((1+2r)/(1−2r)) (положительная интерференция). Они корректируют занижение r из-за двойных кроссоверов: при одном r Холдейн ≥ Косамби ≥ линейная. Режим интервалов суммирует расстояния и предсказывает r через обратные функции (суммарная карта может превышать 50 сМ, а r насыщается на 50%). Источники: Sturtevant 1913, Халдейн 1919, Косамби 1944, Griffiths. Только для обучения.
Запуск
Запустить этот инструмент
Заполните форму, запустите инструмент и посмотрите результат на этой же странице.
Примеры
Примеры для этого инструмента
Связано
Продолжить с похожими инструментами и темами
Результат
Готово к запуску
После запуска здесь появятся файлы, текст, структурированные данные или потоковый вывод.
Руководство по использованию инструмента
Узнайте, когда использовать этот инструмент, что он поддерживает и как его применяют пользователи.
Ключевые факты
Категория
Education
Типы ввода
select, number, text
Тип вывода
json
Покрытие примерами
4
API доступен
Да
Обзор
Калькулятор частоты рекомбинации переводит число рекомбинантов и общее число потомков в r и расстояние на генетической карте в сМ. Он также суммирует соседние интервалы и оценивает ожидаемую рекомбинацию по линейной функции, функциям Холдейна и Косамби. Инструмент предназначен для обучения.
Когда использовать
Чтобы рассчитать частоту рекомбинации по результатам анализирующего скрещивания.
Чтобы сравнить линейную оценку расстояния с функциями картирования Холдейна и Косамби.
Чтобы сложить несколько интервалов генетической карты и предсказать общую частоту рекомбинации.
Как это работает
1Выберите режим «Числа → рекомбинация и расстояние» или «Интервалы → суммарное расстояние и r».
2В режиме чисел укажите число рекомбинантов и общее количество потомков; калькулятор вычислит r = рекомбинанты / всё потомство.
3Для одного значения r будут рассчитаны расстояния по линейной функции, функции Холдейна и функции Косамби.
4В режиме интервалов введите расстояния в сМ через запятую: калькулятор сложит их и оценит r по обратным функциям Холдейна и Косамби.
Сценарии использования
Разбор результатов анализирующего скрещивания на занятиях по генетике.
Построение учебной карты сцепления по нескольким расстояниям между локусами.
Сравнение влияния двойных кроссоверов и разных функций картирования на оценку расстояния.
Примеры
1. 18 рекомбинантов из 100 потомков
Студент, изучающий генетическое картирование
Контекст
В анализирующем скрещивании получено 100 потомков, среди которых 18 рекомбинантов.
Проблема
Нужно определить частоту рекомбинации и сравнить расстояния, рассчитанные разными функциями картирования.
Как использовать
Выберите режим «Числа → рекомбинация и расстояние», введите 18 в поле числа рекомбинантов и 100 в поле общего потомства.
Число рекомбинантов: 18; общее потомство: 100; знаков после запятой: 4.
Результат
r = 0,18, или 18%. Линейная оценка составляет 18 сМ, по Холдейну — 22,3144 сМ, по Косамби — 18,8443 сМ.
2. Суммирование трёх интервалов карты
Преподаватель генетики
Контекст
Учебная карта содержит три соседних интервала длиной 5,2, 8,1 и 12,0 сМ.
Проблема
Нужно получить общую длину участка и оценить частоту рекомбинации между его крайними точками.
Как использовать
Выберите режим «Интервалы → суммарное расстояние и r» и введите строку 5.2, 8.1, 12.0.
FAQ
Что такое частота рекомбинации?
Это доля рекомбинантных потомков: r = число рекомбинантов / общее число потомков. В расчётах r не превышает 0,5.
Почему расстояния Холдейна и Косамби отличаются?
Функции по-разному учитывают двойные кроссоверы и интерференцию. При одном r расстояние Холдейна обычно не меньше расстояния Косамби.
Когда применима линейная оценка?
Линейное правило удобно для коротких расстояний, где вероятность двойных кроссоверов мала.
Можно ли получить карту длиннее 50 сМ?
Да. Суммарное расстояние интервалов может превышать 50 сМ, хотя наблюдаемая частота рекомбинации насыщается на уровне 50%.
Какие данные нужны в режиме интервалов?
Введите соседние расстояния в сМ через запятую, например: 5.2, 8.1, 12.0.