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模拟种群瓶颈后的期望杂合度损失（确定性期望）。理想 Wright-Fisher 漂变下每代 H_{t+1} = H_t(1 − 1/(2N))，故 H_final = H₀(1−1/2Nb)^t × (1−1/2Nr)^g；调和平均有效种群大小 Ne = (t+g)/(t/Nb + g/Nr) 由最小瓶颈主导；相对基础群体的累积近交系数 F = 1 − H_final/H₀。对频率 p 的目标等位基因，单代瓶颈存活概率 = 1 − (1−p)^(2Nb)，稀有等位基因最先丢失。经典案例：北象海豹（1890 年代约 20 只幸存 → 近零变异）、猎豹、夏威夷雁、欧洲野牛、平格拉普环礁。来源：Wright 1931、Nei et al. 1975、Hartl & Clark 2007、StatPearls。仅供教学用途。
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案例
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工具使用指南
种群瓶颈效应模拟器根据初始杂合度、瓶颈期与恢复期种群规模及持续代数，计算期望终末杂合度、保留比例、累积近交系数、调和平均有效种群大小，并估算目标等位基因在单代瓶颈中的存活概率。结果基于理想 Wright-Fisher 漂变模型，仅供教学使用。
背景
需要演示一个小规模种群经历短期瓶颈、随后恢复到较大规模时的遗传多样性变化。
问题
评估初始杂合度为 0.5 的种群经过瓶颈和恢复期后，还能保留多少杂合度。
如何使用
输入 H₀=0.5、Nb=20、t=5、Nr=2000、g=10、p=0.1，并将小数位数设为 4。
初始杂合度：0.5；瓶颈期种群大小：20；瓶颈持续代数：5；恢复期种群大小：2000；恢复期代数：10；目标等位基因频率：0.1；小数位数：4。结果
终末杂合度为 0.4394，保留初始杂合度的 87.89%，累积近交系数 F=0.1211，调和平均有效种群大小 Ne=29.55；目标等位基因单代存活概率为 98.52%。
背景
需要展示极小种群在连续多代瓶颈下的杂合度损失，以及恢复到大种群后短期内难以抵消的影响。
问题
比较严重瓶颈对遗传多样性和目标等位基因存活概率的影响。
如何使用
输入 H₀=0.5、Nb=5、t=10、Nr=5000、g=5、p=0.1，并将小数位数设为 4。
初始杂合度：0.5；瓶颈期种群大小：5；瓶颈持续代数：10；恢复期种群大小：5000；恢复期代数：5；目标等位基因频率：0.1；小数位数：4。结果
终末杂合度为 0.1743，仅保留 34.85%，累积近交系数 F=0.6515；目标等位基因单代存活概率为 65.13%，显示小规模瓶颈的主导影响。
不是。工具计算的是理想 Wright-Fisher 漂变模型下的确定性期望，不是多次随机重复模拟。
必须输入初始杂合度、瓶颈期种群大小与代数、恢复期种群大小与代数，以及目标等位基因频率。
可以。恢复代数设为 0 时，计算会跳过恢复期的杂合度衰减。
结果包括终末杂合度、杂合度保留比例、累积近交系数和调和平均有效种群大小；还会计算目标等位基因的单代存活概率。
每代杂合度衰减因子为 1−1/(2N)，种群规模越小，衰减越快；稀有等位基因也更容易在瓶颈中丢失。