Elysia Tools
导航
Education
分析一条氨基酸序列的组成：20 种标准氨基酸各自的计数与摩尔百分数；分组统计（碱性 K/R/H、酸性 D/E、芳香族 F/W/Y、含硫 C/M、脂肪族 A/I/L/V、酰胺侧链 N/Q、羟基 S/T、其他 G/P）；按 Kyte–Doolittle 1982 疏水值计算 GRAVY 平均疏水指数（>0 偏疏水、<0 偏亲水，可溶性球状蛋白通常介于 −1 至 +0.3）；并附 ProtParam 平均质量表的分子量。歧义码（B/J/O/U/X/Z）单独计数、不计入百分比。来源：Kyte & Doolittle 1982、ExPASy ProtParam、Lehninger。仅供教学与实验规划。
执行
填写表单、运行工具，并在同一页面查看结果。
案例
相关内容
工具使用指南
氨基酸组成分析器可根据一条单字母氨基酸序列，统计 20 种标准氨基酸的数量与摩尔百分数、主要残基分组、Kyte–Doolittle GRAVY 平均疏水指数及按 ProtParam 平均质量表计算的分子量；歧义码会单独计数并排除在百分比之外。
背景
实验人员需要快速了解序列 MGSSHHHHHHSSGLVPRGSH 中组氨酸和丝氨酸的比例，以及标签整体的疏水性。
问题
手动统计残基数量并计算摩尔百分数和 GRAVY 容易出错。
如何使用
将序列输入“氨基酸序列”字段，并将“小数位数”设为 2。
sequence：MGSSHHHHHHSSGLVPRGSH；decimalPlaces：2结果
结果显示序列长度为 20，H 为 7 个、占 35.00 mol%，S 为 5 个、占 25.00 mol%，GRAVY 为 −1.19，整体偏亲水。
背景
学生使用十聚丙氨酸序列检查氨基酸计数、百分比和 GRAVY 计算是否符合预期。
问题
需要一个组成单一、结果容易核对的测试序列。
如何使用
输入序列 AAAAAAAAAA，并保留默认小数位数。
sequence：AAAAAAAAAA；decimalPlaces：2结果
结果显示 A 为 10 个、占 100.00 mol%，GRAVY 为 +1.80，脂肪族分组计数为 10，整体偏疏水。
支持标准单字母氨基酸代码，也会识别 B、J、O、U、X、Z 等歧义码。
可以。工具会忽略空格以及 *、-、. 分隔符。
不会。歧义码单独计数，并排除在标准氨基酸百分比之外。
GRAVY 大于 0 表示整体偏疏水，小于 0 表示整体偏亲水。
可以。小数位数可设置为 0 至 8 位，默认值为 2 位。
背景
序列中可能包含 X 等无法确定具体种类的氨基酸代码，需要避免其影响标准氨基酸百分比。
问题
直接将歧义码纳入分母会改变标准残基的摩尔百分数。
如何使用
输入包含标准氨基酸和 B、J、O、U、X 或 Z 的序列，并设置所需的小数位数。
结果
工具将歧义码单独计数，不把它们纳入 20 种标准氨基酸的百分比，同时输出标准残基组成、分组统计、GRAVY 和分子量。