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Calculadora de massa molecular de proteína (por sequência)

Calcula a massa molecular de uma proteína a partir da sequência: MW = Σ massas médias dos resíduos + H₂O (18,01524 Da), com a mesma tabela do ExPASy ProtParam (A 71,0788 … W 186,2132). A entrada não diferencia maiúsculas; espaços e separadores * - . são removidos; códigos de ambiguidade (B/J/O/U/X/Z) não são somados, mas contados e reportados. O resultado é a cadeia polipeptídica não modificada: sem remoção de peptídeo sinal, pontes dissulfeto (−2H por ponte), PTMs ou tags. Retorna kDa, massa média por resíduo e comprimento. Fontes: ExPASy ProtParam (Gasteiger 2005), manual de Fasman. Apenas para educação.

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Chame esta ferramenta a partir do seu código em três idiomas.

cURL

curl -X POST 'http://127.0.0.1:3003/pt/api/tools/protein-molecular-weight' \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"sequence":"MGSSHHHHHHSSGLVPRGSH","decimalPlaces":2}'

Referência da API

Envie uma requisição POST com suas entradas em JSON. Parâmetros do tipo arquivo exigem upload prévio.

Endpoint

HTTP

POST http://127.0.0.1:3003/pt/api/tools/protein-molecular-weight

Parâmetros

Nome	Tipo	Obrigatório	Descrição
sequence	textarea	Sim	One-letter amino-acid sequence (case-insensitive; spaces and * - . separators are ignored).
decimalPlaces	number	Não	—

Formato de resposta

Resultado JSON

JSON

{
  "key": {...},
  "metadata": {
    "key": "value"
  },
  "error": "Error message (optional)",
  "message": "Notification message (optional)"
}

Integração MCP

Adicione esta ferramenta ao seu servidor Model Context Protocol para que agentes de IA possam listá-la e chamá-la.

Configuração do servidor

Adicione este bloco à configuração do seu cliente MCP:

mcp.json

{
  "mcpServers": {
    "elysiatools-protein-molecular-weight": {
      "name": "protein-molecular-weight",
      "description": "Calcula a massa molecular de uma proteína a partir da sequência: MW = Σ massas médias dos resíduos + H₂O (18,01524 Da), com a mesma tabela do ExPASy ProtParam (A 71,0788 … W 186,2132). A entrada não diferencia maiúsculas; espaços e separadores * - . são removidos; códigos de ambiguidade (B/J/O/U/X/Z) não são somados, mas contados e reportados. O resultado é a cadeia polipeptídica não modificada: sem remoção de peptídeo sinal, pontes dissulfeto (−2H por ponte), PTMs ou tags. Retorna kDa, massa média por resíduo e comprimento. Fontes: ExPASy ProtParam (Gasteiger 2005), manual de Fasman. Apenas para educação.",
      "baseUrl": "http://127.0.0.1:3003/mcp/sse?toolId=protein-molecular-weight",
      "command": "",
      "args": [],
      "env": {},
      "isActive": true,
      "type": "sse"
    }
  }
}

Listar ferramentas disponíveis

Após conectar ao endpoint SSE, liste as ferramentas expostas:

tools/list

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 1,
  "method": "tools/list"
}

Chamar esta ferramenta

Invoque a ferramenta pelo seu id; os argumentos são construídos a partir de seus parâmetros:

tools/call

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 2,
  "method": "tools/call",
  "params": {
    "name": "protein-molecular-weight",
    "arguments": {
  "sequence": "MGSSHHHHHHSSGLVPRGSH",
  "decimalPlaces": 2
}
  }
}

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