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Calculadora de massa de peptídeos (monoisotópica/média)

Calcula a massa de um peptídeo somando resíduos: M = Σ massas de resíduo + H₂O (tabela ExPASy ProtParam). Dois modos: monoisotópica (H₂O = 18,01056, ideal para peptídeos curtos em MS de alta resolução) ou média (H₂O = 18,01524, para cadeias mais longas), com os íons [M+H]⁺, [M+Na]⁺ e [M+2H]²⁺. A sequência não diferencia maiúsculas e ignora espaços e separadores; os códigos de ambiguidade B/J/O/U/X/Z são rejeitados. Fonte: ExPASy ProtParam (Gasteiger 2005). Apenas para educação.

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Chame esta ferramenta a partir do seu código em três idiomas.

cURL

curl -X POST 'http://127.0.0.1:3003/pt/api/tools/peptide-mass-calculator' \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"sequence":"DRVYIHPF","massType":"monoisotopic","decimalPlaces":4}'

Referência da API

Envie uma requisição POST com suas entradas em JSON. Parâmetros do tipo arquivo exigem upload prévio.

Endpoint

HTTP

POST http://127.0.0.1:3003/pt/api/tools/peptide-mass-calculator

Parâmetros

Nome	Tipo	Obrigatório	Descrição
sequence	text	Sim	Single-letter amino acid codes; 1–200 residues.
massType	select	Sim	Monoisotopic for short peptides in HRMS; average for longer chains.
decimalPlaces	number	Não	—

Formato de resposta

Resultado JSON

JSON

{
  "key": {...},
  "metadata": {
    "key": "value"
  },
  "error": "Error message (optional)",
  "message": "Notification message (optional)"
}

Integração MCP

Adicione esta ferramenta ao seu servidor Model Context Protocol para que agentes de IA possam listá-la e chamá-la.

Configuração do servidor

Adicione este bloco à configuração do seu cliente MCP:

mcp.json

{
  "mcpServers": {
    "elysiatools-peptide-mass-calculator": {
      "name": "peptide-mass-calculator",
      "description": "Calcula a massa de um peptídeo somando resíduos: M = Σ massas de resíduo + H₂O (tabela ExPASy ProtParam). Dois modos: monoisotópica (H₂O = 18,01056, ideal para peptídeos curtos em MS de alta resolução) ou média (H₂O = 18,01524, para cadeias mais longas), com os íons [M+H]⁺, [M+Na]⁺ e [M+2H]²⁺. A sequência não diferencia maiúsculas e ignora espaços e separadores; os códigos de ambiguidade B/J/O/U/X/Z são rejeitados. Fonte: ExPASy ProtParam (Gasteiger 2005). Apenas para educação.",
      "baseUrl": "http://127.0.0.1:3003/mcp/sse?toolId=peptide-mass-calculator",
      "command": "",
      "args": [],
      "env": {},
      "isActive": true,
      "type": "sse"
    }
  }
}

Listar ferramentas disponíveis

Após conectar ao endpoint SSE, liste as ferramentas expostas:

tools/list

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 1,
  "method": "tools/list"
}

Chamar esta ferramenta

Invoque a ferramenta pelo seu id; os argumentos são construídos a partir de seus parâmetros:

tools/call

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 2,
  "method": "tools/call",
  "params": {
    "name": "peptide-mass-calculator",
    "arguments": {
  "sequence": "DRVYIHPF",
  "massType": "monoisotopic",
  "decimalPlaces": 4
}
  }
}

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