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Calculadora de Tm de oligonucleotídeos (correção por sal)

Duas estimativas clássicas de Tm: a regra de Wallace Tm = 2×(A+T) + 4×(G+C) (oligos curtos <14 nt, sem dependência de sal) e a fórmula corrigida por sal Tm = 81.5 + 16.6×log₁₀[Na⁺] + 0.41×(%G+C) − 600/n (Sambrook 1989 p. 11.46, a mesma do Primer3; o termo de comprimento varia 500–675/n conforme a fonte). O modo automático escolhe pelo comprimento. Retorna %GC, composição e ambas as estimativas. São aproximações — para precisão de projeto use termodinâmica de vizinhos mais próximos (ferramenta pcr-primer-tm). Premissas: DNA, sem pareamentos incorretos, sem formamida/DMSO, [Na⁺] 0.01–1 M. Fontes: Wallace 1979, von Ahsen 2001, Sambrook & Maniatis, OligoCalc. Apenas para educação.

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Chame esta ferramenta a partir do seu código em três idiomas.

cURL

curl -X POST 'https://api.elysiatools.com/pt/api/tools/oligo-melting-temperature' \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"sequence":"ATGCATGCATGCATGCATGC","method":"auto","sodiumMm":50,"decimalPlaces":2}'

Referência da API

Envie uma requisição POST com suas entradas em JSON. Parâmetros do tipo arquivo exigem upload prévio.

Endpoint

HTTP

POST https://api.elysiatools.com/pt/api/tools/oligo-melting-temperature

Parâmetros

Nome	Tipo	Obrigatório	Descrição
sequence	text	Sim	DNA sequence, A/C/G/T only (spaces stripped, case-insensitive), 4–200 nt.
method	select	Sim	Auto uses Wallace below 14 nt and the salt-corrected formula from 14 nt up.
sodiumMm	number	Sim	Total [Na⁺] (or equivalent monovalent) of the buffer; used by the salt-corrected formula.
decimalPlaces	number	Não	—

Formato de resposta

Resultado JSON

Integração MCP

Adicione esta ferramenta ao seu servidor Model Context Protocol para que agentes de IA possam listá-la e chamá-la.

Configuração do servidor

Adicione este bloco à configuração do seu cliente MCP:

mcp.json

{
  "mcpServers": {
    "elysiatools-oligo-melting-temperature": {
      "name": "oligo-melting-temperature",
      "description": "Duas estimativas clássicas de Tm: a regra de Wallace Tm = 2×(A+T) + 4×(G+C) (oligos curtos <14 nt, sem dependência de sal) e a fórmula corrigida por sal Tm = 81.5 + 16.6×log₁₀[Na⁺] + 0.41×(%G+C) − 600/n (Sambrook 1989 p. 11.46, a mesma do Primer3; o termo de comprimento varia 500–675/n conforme a fonte). O modo automático escolhe pelo comprimento. Retorna %GC, composição e ambas as estimativas. São aproximações — para precisão de projeto use termodinâmica de vizinhos mais próximos (ferramenta pcr-primer-tm). Premissas: DNA, sem pareamentos incorretos, sem formamida/DMSO, [Na⁺] 0.01–1 M. Fontes: Wallace 1979, von Ahsen 2001, Sambrook & Maniatis, OligoCalc. Apenas para educação.",
      "baseUrl": "https://api.elysiatools.com/mcp/sse?toolId=oligo-melting-temperature",
      "command": "",
      "args": [],
      "env": {},
      "isActive": true,
      "type": "sse"
    }
  }
}

Listar ferramentas disponíveis

Após conectar ao endpoint SSE, liste as ferramentas expostas:

tools/list

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 1,
  "method": "tools/list"
}

Chamar esta ferramenta

Invoque a ferramenta pelo seu id; os argumentos são construídos a partir de seus parâmetros:

tools/call

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 2,
  "method": "tools/call",
  "params": {
    "name": "oligo-melting-temperature",
    "arguments": {
  "sequence": "ATGCATGCATGCATGCATGC",
  "method": "auto",
  "sodiumMm": 50,
  "decimalPlaces": 2
}
  }
}

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