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Calculadora de pureza de ácidos nucleicos (OD260/280)

Avalia a pureza de ácidos nucleicos pela razão OD260/280: as bases absorvem no máximo a 260 nm e os aminoácidos aromáticos (e o fenol) perto de 280 nm, então A260/A280 diagnostica arraste de proteína/fenol. Valores esperados: DNA puro ≈ 1.8 (janela 1.7–2.0), RNA puro ≈ 2.0 (janela 1.8–2.2); DNA < 1.7 ou RNA < 1.8 indica contaminação por proteína/fenol/guanidina, DNA > 2.0 sugere contaminação com RNA, RNA > 2.2 aponta artefato de medição (baixa força iônica). Campo A230 opcional para a razão secundária A260/A230 (puro 2.0–2.2; abaixo disso guanidina/fenol/carboidratos/sais). Com leituras < ~0.05 a razão não é confiável. Fontes: Manchester 1995, Sambrook & Russell, Thermo Fisher T042. Apenas educação e planejamento.

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Chame esta ferramenta a partir do seu código em três idiomas.

cURL

curl -X POST 'http://127.0.0.1:3003/pt/api/tools/od260-280-ratio' \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"nucleicAcidType":"DNA","a260":0.45,"a280":0.25,"a230":0.2,"decimalPlaces":2}'

Referência da API

Envie uma requisição POST com suas entradas em JSON. Parâmetros do tipo arquivo exigem upload prévio.

Endpoint

HTTP

POST http://127.0.0.1:3003/pt/api/tools/od260-280-ratio

Parâmetros

Nome	Tipo	Obrigatório	Descrição
nucleicAcidType	select	Sim	Expected ratio: DNA ~1.8, RNA ~2.0 — the acceptable window shifts with type.
a260	number	Sim	Absorbance at 260 nm (nucleic acid peak), same diluted sample as the A280 reading.
a280	number	Sim	Absorbance at 280 nm (protein/phenol peak) of the same diluted sample.
a230	number	Não	Absorbance at 230 nm; enter 0 to skip the secondary A260/A230 ratio.
decimalPlaces	number

Integração MCP

Adicione esta ferramenta ao seu servidor Model Context Protocol para que agentes de IA possam listá-la e chamá-la.

Configuração do servidor

Adicione este bloco à configuração do seu cliente MCP:

mcp.json

{
  "mcpServers": {
    "elysiatools-od260-280-ratio": {
      "name": "od260-280-ratio",
      "description": "Avalia a pureza de ácidos nucleicos pela razão OD260/280: as bases absorvem no máximo a 260 nm e os aminoácidos aromáticos (e o fenol) perto de 280 nm, então A260/A280 diagnostica arraste de proteína/fenol. Valores esperados: DNA puro ≈ 1.8 (janela 1.7–2.0), RNA puro ≈ 2.0 (janela 1.8–2.2); DNA < 1.7 ou RNA < 1.8 indica contaminação por proteína/fenol/guanidina, DNA > 2.0 sugere contaminação com RNA, RNA > 2.2 aponta artefato de medição (baixa força iônica). Campo A230 opcional para a razão secundária A260/A230 (puro 2.0–2.2; abaixo disso guanidina/fenol/carboidratos/sais). Com leituras < ~0.05 a razão não é confiável. Fontes: Manchester 1995, Sambrook & Russell, Thermo Fisher T042. Apenas educação e planejamento.",
      "baseUrl": "http://127.0.0.1:3003/mcp/sse?toolId=od260-280-ratio",
      "command": "",
      "args": [],
      "env": {},
      "isActive": true,
      "type": "sse"
    }
  }
}

Listar ferramentas disponíveis

Após conectar ao endpoint SSE, liste as ferramentas expostas:

tools/list

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 1,
  "method": "tools/list"
}

Chamar esta ferramenta

Invoque a ferramenta pelo seu id; os argumentos são construídos a partir de seus parâmetros:

tools/call

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 2,
  "method": "tools/call",
  "params": {
    "name": "od260-280-ratio",
    "arguments": {
  "nucleicAcidType": "DNA",
  "a260": 0.45,
  "a280": 0.25,
  "a230": 0.2,
  "decimalPlaces": 2
}
  }
}

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