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Calculadora de proporção molar de ligação (inserto:vetor)
Configura ligações segundo NEB: pmol = ng × 10³ ÷ (650 × bp). O modo de cálculo de massa usa a fórmula clássica inserto_ng = proporção × vetor_ng × (bp_inserto ÷ bp_vetor) (o fator 650 cancela); o modo de verificação recebe ambas as massas e devolve a proporção molar real. Faixas recomendadas por tamanho do inserto: <200 bp 5–10:1, 200–999 bp 3–5:1, ≥1000 bp 1–5:1, avisando que proporções >10:1 favorecem concatenâmeros do inserto. Com o volume de reação, a ferramenta dá as concentrações nM (a ligase é sensível à concentração de extremidades, >1 nM é mais eficiente). Fontes: NEB NEBioCalculator e guia de ligação, Promega BioMath, Sambrook & Russell. Apenas para educação.
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Chame esta ferramenta a partir do seu código em três idiomas.
curl -X POST 'https://api.elysiatools.com/pt/api/tools/ligation-molar-ratio' \
-H 'Content-Type: application/json' \
-d '{"mode":"solveInsert","vectorSizeBp":3000,"vectorMassNg":100,"insertSizeBp":1000,"insertMassNg":50,"ratio":3,"reactionVolumeUl":20,"decimalPlaces":3}'Referência da API
Envie uma requisição POST com suas entradas em JSON. Parâmetros do tipo arquivo exigem upload prévio.
Endpoint
POST https://api.elysiatools.com/pt/api/tools/ligation-molar-ratioParâmetros
| Nome | Tipo | Obrigatório | Descrição |
|---|---|---|---|
| mode | select | Sim | Solve for the insert mass a desired ratio needs, or check the actual ratio of two masses. |
| vectorSizeBp | number | Sim | Double-digested vector backbone length in base pairs. |
| vectorMassNg | number | Sim | Mass of the linearized vector in the reaction. |
| insertSizeBp | number | Sim | Insert fragment length in base pairs. |
| insertMassNg | number |
Integração MCP
Adicione esta ferramenta ao seu servidor Model Context Protocol para que agentes de IA possam listá-la e chamá-la.
Configuração do servidor
Adicione este bloco à configuração do seu cliente MCP:
{
"mcpServers": {
"elysiatools-ligation-molar-ratio": {
"name": "ligation-molar-ratio",
"description": "Configura ligações segundo NEB: pmol = ng × 10³ ÷ (650 × bp). O modo de cálculo de massa usa a fórmula clássica inserto_ng = proporção × vetor_ng × (bp_inserto ÷ bp_vetor) (o fator 650 cancela); o modo de verificação recebe ambas as massas e devolve a proporção molar real. Faixas recomendadas por tamanho do inserto: <200 bp 5–10:1, 200–999 bp 3–5:1, ≥1000 bp 1–5:1, avisando que proporções >10:1 favorecem concatenâmeros do inserto. Com o volume de reação, a ferramenta dá as concentrações nM (a ligase é sensível à concentração de extremidades, >1 nM é mais eficiente). Fontes: NEB NEBioCalculator e guia de ligação, Promega BioMath, Sambrook & Russell. Apenas para educação.",
"baseUrl": "https://api.elysiatools.com/mcp/sse?toolId=ligation-molar-ratio",
"command": "",
"args": [],
"env": {},
"isActive": true,
"type": "sse"
}
}
}Listar ferramentas disponíveis
Após conectar ao endpoint SSE, liste as ferramentas expostas:
{
"jsonrpc": "2.0",
"id": 1,
"method": "tools/list"
}Chamar esta ferramenta
Invoque a ferramenta pelo seu id; os argumentos são construídos a partir de seus parâmetros:
{
"jsonrpc": "2.0",
"id": 2,
"method": "tools/call",
"params": {
"name": "ligation-molar-ratio",
"arguments": {
"mode": "solveInsert",
"vectorSizeBp": 3000,
"vectorMassNg": 100,
"insertSizeBp": 1000,
"insertMassNg": 50,
"ratio": 3,
"reactionVolumeUl": 20,
"decimalPlaces": 3
}
}
}