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Calculadora de temperatura de anelamento PCR (Ta = Tm − 5°C)
Calcula a temperatura de anelamento (Ta) da PCR por duas regras: a regra simples de bancada Ta = Tm − 5°C (usando o MENOR Tm do par de primers) e a fórmula empírica de Rychlik 1990: Ta = 0.3×Tm(primer) + 0.7×Tm(produto) − 14.9 (o Tm do produto costuma ser 75–90°C e a fórmula fica 1–8°C acima da regra simples em pares típicos). Fornece a Ta recomendada, faixa de gradiente ±3°C e a direção de ajuste: Ta baixa dá bandas inespecíficas e dímeros, alta sem produto; mantenha os dois Tm dentro de 2–3°C e anele pelo menor. Fontes: Rychlik 1990, Innis & Gelfand 1990, Lorenz 2012. Apenas planejamento experimental.
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Chame esta ferramenta a partir do seu código em três idiomas.
curl -X POST 'https://api.elysiatools.com/pt/api/tools/annealing-temperature-calculator' \
-H 'Content-Type: application/json' \
-d '{"rule":"simple","forwardTm":62,"reverseTm":60,"productTm":85,"decimalPlaces":1}'Referência da API
Envie uma requisição POST com suas entradas em JSON. Parâmetros do tipo arquivo exigem upload prévio.
Endpoint
POST https://api.elysiatools.com/pt/api/tools/annealing-temperature-calculatorParâmetros
| Nome | Tipo | Obrigatório | Descrição |
|---|---|---|---|
| rule | select | Sim | Simple rule uses the lower primer Tm; Rychlik also weighs the product Tm. |
| forwardTm | number | Sim | Melting temperature of the forward primer. |
| reverseTm | number | Sim | Melting temperature of the reverse primer. |
| productTm | number | Sim | Amplicon melting temperature (typically 75–90°C for a 100–500 bp product); used by the Rychlik formula. |
| decimalPlaces | number |
Integração MCP
Adicione esta ferramenta ao seu servidor Model Context Protocol para que agentes de IA possam listá-la e chamá-la.
Configuração do servidor
Adicione este bloco à configuração do seu cliente MCP:
{
"mcpServers": {
"elysiatools-annealing-temperature-calculator": {
"name": "annealing-temperature-calculator",
"description": "Calcula a temperatura de anelamento (Ta) da PCR por duas regras: a regra simples de bancada Ta = Tm − 5°C (usando o MENOR Tm do par de primers) e a fórmula empírica de Rychlik 1990: Ta = 0.3×Tm(primer) + 0.7×Tm(produto) − 14.9 (o Tm do produto costuma ser 75–90°C e a fórmula fica 1–8°C acima da regra simples em pares típicos). Fornece a Ta recomendada, faixa de gradiente ±3°C e a direção de ajuste: Ta baixa dá bandas inespecíficas e dímeros, alta sem produto; mantenha os dois Tm dentro de 2–3°C e anele pelo menor. Fontes: Rychlik 1990, Innis & Gelfand 1990, Lorenz 2012. Apenas planejamento experimental.",
"baseUrl": "https://api.elysiatools.com/mcp/sse?toolId=annealing-temperature-calculator",
"command": "",
"args": [],
"env": {},
"isActive": true,
"type": "sse"
}
}
}Listar ferramentas disponíveis
Após conectar ao endpoint SSE, liste as ferramentas expostas:
{
"jsonrpc": "2.0",
"id": 1,
"method": "tools/list"
}Chamar esta ferramenta
Invoque a ferramenta pelo seu id; os argumentos são construídos a partir de seus parâmetros:
{
"jsonrpc": "2.0",
"id": 2,
"method": "tools/call",
"params": {
"name": "annealing-temperature-calculator",
"arguments": {
"rule": "simple",
"forwardTm": 62,
"reverseTm": 60,
"productTm": 85,
"decimalPlaces": 1
}
}
}