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Calculadora del punto isoeléctrico de proteínas (pI)
Calcula el punto isoeléctrico teórico a partir de la composición de aminoácidos: carga neta por Henderson–Hasselbalch en cada grupo ionizable (conjunto pKa simplificado de ExPASy/Bjellqvist: N-term 7.5, K 10.0, R 12.0, H 5.98; C-term 3.55, D 4.05, E 4.45, C 9.0, Y 10.0) y bisección hasta la carga cero. También devuelve la carga neta a pH fisiológico 7.4, el peso molecular medio (tabla de masas de ProtParam + agua) y la lectura ácida/básica. Limitaciones: pKa de cadena desplegada, sin modificaciones postraduccionales; el conjunto de pKa y el algoritmo de bisección son idénticos a Biopython IsoelectricPoint (resultados numéricamente iguales), mientras que el conjunto completo de Bjellqvist de ExPASy distingue residuos terminales y puede diferir ligeramente. Fuentes: Bjellqvist 1993, Gasteiger 2003 (ExPASy), Biopython IsoelectricPoint. Solo para educación.
Ejecución
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Ejemplos
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Guía de uso de la herramienta
Conoce cuándo usar esta herramienta, qué admite y cómo la aplican los usuarios.
Datos clave
Categoría
Education
Tipos de entrada
textarea, number
Tipo de salida
json
Cobertura de ejemplos
4
API disponible
Sí
Resumen
La calculadora del punto isoeléctrico de proteínas estima el pI teórico a partir de una secuencia de aminoácidos estándar. También muestra la carga neta a pH 7,4, el peso molecular medio en daltons y una clasificación como proteína ácida o básica.
Cuándo usarlo
Para estimar el pI teórico de una proteína o péptido a partir de su secuencia.
Resultado
Listo para ejecutar
Al ejecutar la herramienta, aquí verás archivos, texto, datos estructurados o salida en streaming.
Para consultar la carga neta aproximada de una secuencia a pH fisiológico 7,4.
Para obtener rápidamente una estimación del peso molecular medio y orientar comparaciones de laboratorio.
Cómo funciona
1Introduce una secuencia con códigos de aminoácidos de una letra correspondientes a los 20 residuos estándar.
2La herramienta calcula la carga de cada grupo ionizable mediante la ecuación de Henderson–Hasselbalch.
3Aplica una búsqueda por bisección hasta encontrar el pH con carga neta cercana a cero.
4Devuelve el pI, la carga neta a pH 7,4, el peso molecular medio y la lectura ácida o básica.
Casos de uso
Comparar el carácter ácido o básico de distintas secuencias antes de planificar un experimento.
Consultar el pI teórico como referencia para cromatografía de intercambio iónico o enfoque isoeléctrico.
Estimar el peso molecular medio de péptidos y proteínas a partir de su composición de aminoácidos.
Ejemplos
1. Cadena A de la insulina: pI ácido
Estudiante de biología molecular
Contexto
La cadena A humana de la insulina contiene varios residuos ionizables ácidos y no tiene lisina, arginina ni histidina.
Problema
Necesita estimar su pI, su carga a pH fisiológico y su peso molecular.
Cómo usarlo
Introduce la secuencia `GIVEQCCTSICSLYQLENYCN` y conserva 2 decimales.
Secuencia: GIVEQCCTSICSLYQLENYCN; decimales: 2
Resultado
El resultado es pI ≈ 3,79, carga neta −2,54 a pH 7,4 y peso molecular de 2383,71 Da; la secuencia se clasifica como ácida.
2. Bradicinina: pI básico
Investigador de bioquímica
Contexto
La bradicinina `RPPGFSPFR` es un péptido corto con dos residuos de arginina y sin residuos ácidos internos.
Problema
Quiere conocer su comportamiento teórico de carga antes de comparar péptidos con composiciones diferentes.
Cómo usarlo
Introduce `RPPGFSPFR` y establece 2 decimales.
Secuencia: RPPGFSPFR; decimales: 2
Resultado
La calculadora devuelve pI ≈ 12, carga neta +1,56 a pH 7,4 y peso molecular de 1060,22 Da; el péptido se clasifica como básico.
Preguntas frecuentes
¿Qué secuencia acepta la calculadora?
Acepta códigos de una letra de los 20 aminoácidos estándar. Se eliminan las cabeceras FASTA, los espacios y el carácter de terminación '*'.
¿Qué resultados devuelve?
Devuelve el pI teórico, la carga neta a pH 7,4, el peso molecular medio en Da y la clasificación ácida o básica.
¿Qué modelo de pKa utiliza?
Usa el conjunto simplificado de pKa de ExPASy/Bjellqvist para los grupos ionizables y el algoritmo de bisección de Biopython IsoelectricPoint.
¿El pI calculado es experimental?
No. Es una estimación teórica basada en pKa de una cadena desplegada y no incluye modificaciones postraduccionales.
¿Puedo cambiar el número de decimales?
Sí. Puedes elegir entre 0 y 8 decimales; el valor predeterminado es 2.