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模拟 Wright–Fisher 遗传漂变,可设突变和选择,运行多个重复种群。可视化漂变轨迹、最终频率分布、杂合度衰减 Hₜ = H₀(1−1/2Nₑ)ᵗ,并可做哈迪-温伯格卡方检验。
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Wright–Fisher 模型(随机遗传漂变的经典零模型)的交互式导师。设置种群大小 N(二倍体 2N 或单倍体 N 基因拷贝)、初始等位基因频率 p₀、可选突变率 μ 和选择系数 s(显性/隐性/加性),并行运行多个重复种群。工具绘制每条重复轨迹、最终频率分布(显示 A 固定/丢失的频率)、观察到的平均杂合度对照解析衰减公式 Hₜ = H₀(1−1/(2Nₑ))ᵗ,以及 Kimura 理论固定概率。可选填基因型计数(AA/Aa/aa)做哈迪-温伯格平衡卡方检验。弥合单次孟德尔 Punnett 杂交与等位基因群体长期命运之间的鸿沟。按种子可复现。
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案例
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工具使用指南
Wright–Fisher 群体漂变与等位基因频率导师可模拟随机遗传漂变、突变和选择对等位基因 A 的长期影响，并通过重复种群比较频率轨迹、最终频率分布、杂合度衰减和固定概率。
背景
学生希望了解初始频率为 0.5 的等位基因在有限二倍体种群中如何随世代随机变化。
问题
单条模拟轨迹难以体现 A 固定或丢失的不同可能性，需要比较多个重复种群。
如何使用
设置 N=100、二倍体、100 代、40 个重复种群、p₀=0.5，并将 μ 和 s 设为 0。
N=100；ploidy=二倍体；generations=100；reps=40；p₀=0.5；μ=0；s=0；seed=42结果
结果展示多条漂变轨迹和最终频率分布，约有部分种群中的 A 固定、部分种群中的 A 丢失；杂合度按 Hₜ=H₀(1−1/2Nₑ)ᵗ 衰减。
背景
研究者希望比较初始频率为 0.3 的 A 在中性条件和正向选择条件下的长期命运。
问题
需要在重复种群中观察选择系数对 A 频率轨迹和固定频率的影响。
如何使用
设置 N=200、二倍体、150 代、40 个重复种群、p₀=0.3，输入 s=0.1，并选择加性模式。
N=200；ploidy=二倍体；generations=150；reps=40；p₀=0.3；μ=0；s=0.1；dominance=加性；seed=7结果
结果显示 A 的频率轨迹、最终频率分布和理论固定概率；与中性预期相比，正向选择使 A 的固定频率更高。
它模拟 Wright–Fisher 模型，即随机遗传漂变的经典群体遗传学零模型。
二倍体使用 2N 个基因拷贝，单倍体使用 N 个基因拷贝；N 越小，随机漂变通常越明显。
可以设置突变率 μ 和选择系数 s，并为 A 选择显性、隐性或加性模式。
多个重复种群可用于比较不同随机轨迹，并观察 A 最终固定或丢失的频率分布。
可以。使用相同参数和随机种子可复现对应的模拟结果。