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估算限制酶消化后的片段大小:环状底物 n 个切点产生 n 个片段(绕原点环绕),线性底物 n 个切点产生 n+1 个片段。切点位置模式按逗号分隔的坐标精确计算各片段;切点数目模式按平均分布给出片段数与均值。附带随机 DNA 识别位点频率:4 碱基识别子约每 256 bp 一个、6 碱基约每 4096 bp 一个(REBASE/Sambrook),以及琼脂糖凝胶分辨率提示(<50 bp 可能跑丢)。来源:Sambrook & Russell 第 3 版、REBASE。仅供教学与实验规划。
用三种语言从你的代码中调用此工具。
curl -X POST 'http://127.0.0.1:3003/zh/api/tools/restriction-fragment-length' \
-H 'Content-Type: application/json' \
-d '{"topology":"circular","inputMode":"positions","substrateLengthBp":2686,"cutPositions":"1000, 2000","cutSiteCount":2,"decimalPlaces":2}'以 JSON 形式 POST 提交输入参数。文件类型参数需先单独上传。
POST http://127.0.0.1:3003/zh/api/tools/restriction-fragment-length| 参数名 | 类型 | 必填 | 说明 |
|---|---|---|---|
| topology | select | 是 | Circular plasmids give n fragments from n cuts; linear DNA gives n+1. |
| inputMode | select | 是 | Enter exact cut positions, or just the number of cut sites for an average estimate. |
| substrateLengthBp | number | 是 | Total length of the substrate (plasmid or linear DNA) in base pairs. |
| cutPositions | text | 是 | Cut coordinates counted from base 1 (positions mode); each must be strictly inside the substrate and unique. |
| cutSiteCount | number |
将此工具加入你的 Model Context Protocol 服务,让 AI 智能体可以列出并调用它。
将以下内容加入你的 MCP 客户端配置:
{
"mcpServers": {
"elysiatools-restriction-fragment-length": {
"name": "restriction-fragment-length",
"description": "估算限制酶消化后的片段大小:环状底物 n 个切点产生 n 个片段(绕原点环绕),线性底物 n 个切点产生 n+1 个片段。切点位置模式按逗号分隔的坐标精确计算各片段;切点数目模式按平均分布给出片段数与均值。附带随机 DNA 识别位点频率:4 碱基识别子约每 256 bp 一个、6 碱基约每 4096 bp 一个(REBASE/Sambrook),以及琼脂糖凝胶分辨率提示(<50 bp 可能跑丢)。来源:Sambrook & Russell 第 3 版、REBASE。仅供教学与实验规划。",
"baseUrl": "http://127.0.0.1:3003/mcp/sse?toolId=restriction-fragment-length",
"command": "",
"args": [],
"env": {},
"isActive": true,
"type": "sse"
}
}
}连接到 SSE 端点后,列出已开放的工具:
{
"jsonrpc": "2.0",
"id": 1,
"method": "tools/list"
}通过工具 id 调用,参数由其参数表构建:
{
"jsonrpc": "2.0",
"id": 2,
"method": "tools/call",
"params": {
"name": "restriction-fragment-length",
"arguments": {
"topology": "circular",
"inputMode": "positions",
"substrateLengthBp": 2686,
"cutPositions": "1000, 2000",
"cutSiteCount": 2,
"decimalPlaces": 2
}
}
}有问题或反馈?请联系 [email protected]
| Number of cut sites (count mode); fragments = n circular or n+1 linear. |
| decimalPlaces | number | 否 | — |
JSON 结果
{
"key": {...},
"metadata": {
"key": "value"
},
"error": "Error message (optional)",
"message": "Notification message (optional)"
}