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种群瓶颈效应模拟器（杂合度衰减）
模拟种群瓶颈后的期望杂合度损失（确定性期望）。理想 Wright-Fisher 漂变下每代 H_{t+1} = H_t(1 − 1/(2N))，故 H_final = H₀(1−1/2Nb)^t × (1−1/2Nr)^g；调和平均有效种群大小 Ne = (t+g)/(t/Nb + g/Nr) 由最小瓶颈主导；相对基础群体的累积近交系数 F = 1 − H_final/H₀。对频率 p 的目标等位基因，单代瓶颈存活概率 = 1 − (1−p)^(2Nb)，稀有等位基因最先丢失。经典案例：北象海豹（1890 年代约 20 只幸存 → 近零变异）、猎豹、夏威夷雁、欧洲野牛、平格拉普环礁。来源：Wright 1931、Nei et al. 1975、Hartl & Clark 2007、StatPearls。仅供教学用途。
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用三种语言从你的代码中调用此工具。
cURL
curl -X POST 'https://api.elysiatools.com/zh/api/tools/bottleneck-effect-simulator' \
-H 'Content-Type: application/json' \
-d '{"initialHeterozygosity":0.5,"bottleneckSize":20,"bottleneckGenerations":5,"recoverySize":2000,"recoveryGenerations":10,"alleleFrequency":0.1,"decimalPlaces":4}'API 参考
以 JSON 形式 POST 提交输入参数。文件类型参数需先单独上传。
请求端点
HTTP
POST https://api.elysiatools.com/zh/api/tools/bottleneck-effect-simulator请求参数
| 参数名 | 类型 | 必填 | 说明 |
|---|---|---|---|
| initialHeterozygosity | number | 是 | Heterozygosity before the bottleneck (0 < H₀ ≤ 1). |
| bottleneckSize | number | 是 | Census size during the bottleneck (Nb). |
| bottleneckGenerations | number | 是 | Number of generations spent at the bottleneck size (t). |
| recoverySize | number | 是 | Census size after recovery (Nr). |
| recoveryGenerations | number | 是 |
MCP 集成
将此工具加入你的 Model Context Protocol 服务，让 AI 智能体可以列出并调用它。
服务配置
将以下内容加入你的 MCP 客户端配置：
mcp.json
{
"mcpServers": {
"elysiatools-bottleneck-effect-simulator": {
"name": "bottleneck-effect-simulator",
"description": "模拟种群瓶颈后的期望杂合度损失（确定性期望）。理想 Wright-Fisher 漂变下每代 H_{t+1} = H_t(1 − 1/(2N))，故 H_final = H₀(1−1/2Nb)^t × (1−1/2Nr)^g；调和平均有效种群大小 Ne = (t+g)/(t/Nb + g/Nr) 由最小瓶颈主导；相对基础群体的累积近交系数 F = 1 − H_final/H₀。对频率 p 的目标等位基因，单代瓶颈存活概率 = 1 − (1−p)^(2Nb)，稀有等位基因最先丢失。经典案例：北象海豹（1890 年代约 20 只幸存 → 近零变异）、猎豹、夏威夷雁、欧洲野牛、平格拉普环礁。来源：Wright 1931、Nei et al. 1975、Hartl & Clark 2007、StatPearls。仅供教学用途。",
"baseUrl": "https://api.elysiatools.com/mcp/sse?toolId=bottleneck-effect-simulator",
"command": "",
"args": [],
"env": {},
"isActive": true,
"type": "sse"
}
}
}列出可用工具
连接到 SSE 端点后，列出已开放的工具：
tools/list
{
"jsonrpc": "2.0",
"id": 1,
"method": "tools/list"
}调用此工具
通过工具 id 调用，参数由其参数表构建：
tools/call
{
"jsonrpc": "2.0",
"id": 2,
"method": "tools/call",
"params": {
"name": "bottleneck-effect-simulator",
"arguments": {
"initialHeterozygosity": 0.5,
"bottleneckSize": 20,
"bottleneckGenerations": 5,
"recoverySize": 2000,
"recoveryGenerations": 10,
"alleleFrequency": 0.1,
"decimalPlaces": 4
}
}
}可用逗号分隔的 toolId 在一个会话中串联多个工具，例如 /mcp/sse?toolId=png-to-webp,jpg-to-webp,gif-to-webp（最多 20 个）。
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