Равновесие Харди-Вайнберга

Исследуйте, как отбор, мутации, миграция и дрейф изменяют частоты аллелей и генотипов

Популяция

Частота аллелей

Частота генотипов

Текущие vs Начальные

Равновесие Харди-Вайнберга

В большой случайно скрещивающейся популяции без отбора, мутаций, миграции и дрейфа частоты аллелей p и q остаются постоянными, а частоты генотипов достигают равновесия p², 2pq, q². Независимо открыто Харди и Вайнбергом в 1908 году.

Пять условий

РХВ требует: (1) Бесконечная популяция, (2) Случайное скрещивание, (3) Нет отбора, (4) Нет мутаций, (5) Нет миграции. Нарушение любого условия вызывает эволюцию.

Естественный отбор

Разные генотипы имеют разную приспособленность w. Отбор сдвигает частоту аллелей в пользу advantageous аллелей. Более высокие коэффициенты отбора вызывают более быстрые изменения.

Мутация

Скорость мутации μ вызывает превращение аллеля A в a с вероятностью μ за поколение. При односторонней мутации p постепенно приближается к 0.

Миграция (Поток генов)

Иммиграция привносит аллели из других популяций. Скорость миграции m и частота аллеля мигрантов p_m определяют направление потока генов.

Генетический дрейф

В конечных популяциях случайная выборка вызывает флуктуации частот аллелей. Меньшие популяции испытывают более сильный дрейф, приводящий к фиксации или потере аллелей.

Что наблюдать

Начните с РХВ (нет сил): p и q постоянны. Затем включайте по одной силе для наблюдения их эффекта.

Эксперименты

1) N=50 с дрейфом: наблюдайте разные пути фиксации. 2) w(aa)=0.5: наблюдайте удаление рецессивного аллеля. 3) Мутация и отбор вместе для баланса мутация-отбор.