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Calculadora de frequência de recombinação e mapa genético (cM)

Converte entre frequência de recombinação e distância do mapa genético. r = recombinantes / descendência total (r ≤ 0.5; tende a 0.5 para genes distantes ou em cromossomos diferentes). Três funções de mapeamento (d em morgans, 1 M = 100 cM): linear d = r (apenas curtas distâncias); Haldane 1919: d = −½ln(1−2r) (sem interferência); Kosambi 1944: d = ¼ln((1+2r)/(1−2r)) (interferência positiva). Corrigem a subestimação por duplos crossing-overs: para o mesmo r, Haldane ≥ Kosambi ≥ linear. O modo de intervalos soma distâncias e prevê r pelas funções inversas (o mapa total pode exceder 50 cM enquanto r satura em 50%). Fontes: Sturtevant 1913, Haldane 1919, Kosambi 1944, Griffiths. Apenas uso educativo.

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Chame esta ferramenta a partir do seu código em três idiomas.

cURL

curl -X POST 'http://127.0.0.1:3003/pt/api/tools/recombination-frequency-map' \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"mode":"counts","recombinantCount":18,"totalProgeny":100,"intervalDistances":"","decimalPlaces":4}'

Referência da API

Envie uma requisição POST com suas entradas em JSON. Parâmetros do tipo arquivo exigem upload prévio.

Endpoint

HTTP

POST http://127.0.0.1:3003/pt/api/tools/recombination-frequency-map

Parâmetros

Nome	Tipo	Obrigatório	Descrição
mode	select	Sim	From recombination counts, or from a list of map intervals.
recombinantCount	number	Sim	Recombinant offspring in a testcross (counts mode).
totalProgeny	number	Sim	Total offspring scored (counts mode).
intervalDistances	text	Não	Comma-separated adjacent interval distances in centimorgans (intervals mode).
decimalPlaces	number

Integração MCP

Adicione esta ferramenta ao seu servidor Model Context Protocol para que agentes de IA possam listá-la e chamá-la.

Configuração do servidor

Adicione este bloco à configuração do seu cliente MCP:

mcp.json

{
  "mcpServers": {
    "elysiatools-recombination-frequency-map": {
      "name": "recombination-frequency-map",
      "description": "Converte entre frequência de recombinação e distância do mapa genético. r = recombinantes / descendência total (r ≤ 0.5; tende a 0.5 para genes distantes ou em cromossomos diferentes). Três funções de mapeamento (d em morgans, 1 M = 100 cM): linear d = r (apenas curtas distâncias); Haldane 1919: d = −½ln(1−2r) (sem interferência); Kosambi 1944: d = ¼ln((1+2r)/(1−2r)) (interferência positiva). Corrigem a subestimação por duplos crossing-overs: para o mesmo r, Haldane ≥ Kosambi ≥ linear. O modo de intervalos soma distâncias e prevê r pelas funções inversas (o mapa total pode exceder 50 cM enquanto r satura em 50%). Fontes: Sturtevant 1913, Haldane 1919, Kosambi 1944, Griffiths. Apenas uso educativo.",
      "baseUrl": "http://127.0.0.1:3003/mcp/sse?toolId=recombination-frequency-map",
      "command": "",
      "args": [],
      "env": {},
      "isActive": true,
      "type": "sse"
    }
  }
}

Listar ferramentas disponíveis

Após conectar ao endpoint SSE, liste as ferramentas expostas:

tools/list

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 1,
  "method": "tools/list"
}

Chamar esta ferramenta

Invoque a ferramenta pelo seu id; os argumentos são construídos a partir de seus parâmetros:

tools/call

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 2,
  "method": "tools/call",
  "params": {
    "name": "recombination-frequency-map",
    "arguments": {
  "mode": "counts",
  "recombinantCount": 18,
  "totalProgeny": 100,
  "intervalDistances": "",
  "decimalPlaces": 4
}
  }
}

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