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Calculadora de ponto isoelétrico de proteínas (pI)

Calcula o ponto isoelétrico teórico a partir da composição de aminoácidos: carga líquida por Henderson–Hasselbalch em cada grupo ionizável (conjunto de pKa simplificado ExPASy/Bjellqvist: N-term 7.5, K 10.0, R 12.0, H 5.98; C-term 3.55, D 4.05, E 4.45, C 9.0, Y 10.0) e bisseção até carga zero. Também devolve a carga líquida no pH fisiológico 7.4, a massa molecular média (tabela ProtParam + água) e a leitura ácida/básica. Limitações: pKa de cadeia desdobrada, sem modificações pós-traducionais; o conjunto de pKa e o algoritmo de bisseção são idênticos ao Biopython IsoelectricPoint (resultados numericamente iguais), enquanto o conjunto completo de Bjellqvist do ExPASy distingue resíduos terminais e pode diferir levemente. Fontes: Bjellqvist 1993, Gasteiger 2003 (ExPASy), Biopython IsoelectricPoint. Apenas para educação.

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Chame esta ferramenta a partir do seu código em três idiomas.

cURL

curl -X POST 'http://127.0.0.1:3003/pt/api/tools/protein-isoelectric-point' \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"sequence":"GIVEQCCTSICSLYQLENYCN","decimalPlaces":2}'

Referência da API

Envie uma requisição POST com suas entradas em JSON. Parâmetros do tipo arquivo exigem upload prévio.

Endpoint

HTTP

POST http://127.0.0.1:3003/pt/api/tools/protein-isoelectric-point

Parâmetros

Nome	Tipo	Obrigatório	Descrição
sequence	textarea	Sim	One-letter amino-acid codes, 20 standard residues only (FASTA headers, whitespace, and '*' are stripped).
decimalPlaces	number	Não	—

Formato de resposta

Resultado JSON

JSON

{
  "key": {...},
  "metadata": {
    "key": "value"
  },
  "error": "Error message (optional)",
  "message": "Notification message (optional)"
}

Integração MCP

Adicione esta ferramenta ao seu servidor Model Context Protocol para que agentes de IA possam listá-la e chamá-la.

Configuração do servidor

Adicione este bloco à configuração do seu cliente MCP:

mcp.json

{
  "mcpServers": {
    "elysiatools-protein-isoelectric-point": {
      "name": "protein-isoelectric-point",
      "description": "Calcula o ponto isoelétrico teórico a partir da composição de aminoácidos: carga líquida por Henderson–Hasselbalch em cada grupo ionizável (conjunto de pKa simplificado ExPASy/Bjellqvist: N-term 7.5, K 10.0, R 12.0, H 5.98; C-term 3.55, D 4.05, E 4.45, C 9.0, Y 10.0) e bisseção até carga zero. Também devolve a carga líquida no pH fisiológico 7.4, a massa molecular média (tabela ProtParam + água) e a leitura ácida/básica. Limitações: pKa de cadeia desdobrada, sem modificações pós-traducionais; o conjunto de pKa e o algoritmo de bisseção são idênticos ao Biopython IsoelectricPoint (resultados numericamente iguais), enquanto o conjunto completo de Bjellqvist do ExPASy distingue resíduos terminais e pode diferir levemente. Fontes: Bjellqvist 1993, Gasteiger 2003 (ExPASy), Biopython IsoelectricPoint. Apenas para educação.",
      "baseUrl": "http://127.0.0.1:3003/mcp/sse?toolId=protein-isoelectric-point",
      "command": "",
      "args": [],
      "env": {},
      "isActive": true,
      "type": "sse"
    }
  }
}

Listar ferramentas disponíveis

Após conectar ao endpoint SSE, liste as ferramentas expostas:

tools/list

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 1,
  "method": "tools/list"
}

Chamar esta ferramenta

Invoque a ferramenta pelo seu id; os argumentos são construídos a partir de seus parâmetros:

tools/call

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 2,
  "method": "tools/call",
  "params": {
    "name": "protein-isoelectric-point",
    "arguments": {
  "sequence": "GIVEQCCTSICSLYQLENYCN",
  "decimalPlaces": 2
}
  }
}

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