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Calculadora de ciclos PCR e produto (amplificação 2^n)

Calcula o produto de uma PCR com amplificação exponencial ideal: após n ciclos, cópias = molde × (1 + eficiência)^n; a 100% é a duplicação 2^n dos livros (30 ciclos ≈ 1.07×10⁹ vezes); a PCR real rende 70–100%, e 25 ciclos a 90% custam ~100× de produto versus o ideal. Com o comprimento do amplícone converte em massa ng (660 Da por par de bases, N_A = 6.022×10²³). Correções de realidade incluídas: a reação atinge platô em ~10¹²–10¹³ moléculas de produto (a ferramenta sinaliza excedentes) e mais de 35 ciclos amplificam sobretudo produtos inespecíficos e dímeros. Fontes: Saiki 1988, Innis & Gelfand 1990, Lorenz 2012. Apenas planejamento.

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Chame esta ferramenta a partir do seu código em três idiomas.

cURL

curl -X POST 'http://127.0.0.1:3003/pt/api/tools/pcr-cycle-number' \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"templateCopies":1000,"cycles":30,"efficiencyPercent":100,"ampliconLengthBp":500,"decimalPlaces":2}'

Referência da API

Envie uma requisição POST com suas entradas em JSON. Parâmetros do tipo arquivo exigem upload prévio.

Endpoint

HTTP

POST http://127.0.0.1:3003/pt/api/tools/pcr-cycle-number

Parâmetros

Nome	Tipo	Obrigatório	Descrição
templateCopies	number	Sim	Starting number of target molecules (see the companion copy-number tool).
cycles	number	Sim	Number of thermal cycles (most protocols: 25–35).
efficiencyPercent	number	Sim	Per-cycle amplification efficiency; 100% = perfect doubling, real PCR typically 70–100%.
ampliconLengthBp	number	Não	Amplicon length in base pairs for the ng-yield conversion; enter 0 to skip.
decimalPlaces	number

Integração MCP

Adicione esta ferramenta ao seu servidor Model Context Protocol para que agentes de IA possam listá-la e chamá-la.

Configuração do servidor

Adicione este bloco à configuração do seu cliente MCP:

mcp.json

{
  "mcpServers": {
    "elysiatools-pcr-cycle-number": {
      "name": "pcr-cycle-number",
      "description": "Calcula o produto de uma PCR com amplificação exponencial ideal: após n ciclos, cópias = molde × (1 + eficiência)^n; a 100% é a duplicação 2^n dos livros (30 ciclos ≈ 1.07×10⁹ vezes); a PCR real rende 70–100%, e 25 ciclos a 90% custam ~100× de produto versus o ideal. Com o comprimento do amplícone converte em massa ng (660 Da por par de bases, N_A = 6.022×10²³). Correções de realidade incluídas: a reação atinge platô em ~10¹²–10¹³ moléculas de produto (a ferramenta sinaliza excedentes) e mais de 35 ciclos amplificam sobretudo produtos inespecíficos e dímeros. Fontes: Saiki 1988, Innis & Gelfand 1990, Lorenz 2012. Apenas planejamento.",
      "baseUrl": "http://127.0.0.1:3003/mcp/sse?toolId=pcr-cycle-number",
      "command": "",
      "args": [],
      "env": {},
      "isActive": true,
      "type": "sse"
    }
  }
}

Listar ferramentas disponíveis

Após conectar ao endpoint SSE, liste as ferramentas expostas:

tools/list

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 1,
  "method": "tools/list"
}

Chamar esta ferramenta

Invoque a ferramenta pelo seu id; os argumentos são construídos a partir de seus parâmetros:

tools/call

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 2,
  "method": "tools/call",
  "params": {
    "name": "pcr-cycle-number",
    "arguments": {
  "templateCopies": 1000,
  "cycles": 30,
  "efficiencyPercent": 100,
  "ampliconLengthBp": 500,
  "decimalPlaces": 2
}
  }
}

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