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Calculadora de densidade celular OD600 (E. coli)

Converte turbidez OD600 em concentração celular e peso seco (CDW): OD normalizada = leitura × fator de diluição ÷ trajeto óptico; células/mL = OD × células por unidade de OD (1×10⁹ padrão, valor usual de E. coli); CDW g/L = OD × g/L por unidade de OD (0.36 padrão, BioNumbers 109837; faixa 0.3–0.5). Os dois fatores são editáveis — cepa, meio e instrumento os alteram; os padrões são autoconsistentes: 0.36 g/L ÷ 10⁹ células/mL = 0.36 pg/célula. Leituras OD > 1 são marcadas fora da faixa linear (Sigma-Aldrich). Fontes: BioNumbers 109835/109837, Agilent/VectorBuilder. Calibre com sua própria curva OD-UCF. Apenas para educação.

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Chame esta ferramenta a partir do seu código em três idiomas.

cURL

curl -X POST 'https://api.elysiatools.com/pt/api/tools/od600-cell-density' \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"od600":0.5,"dilutionFactor":1,"pathLengthCm":1,"cellsPerOd":1000000000,"cdwPerOd":0.36,"cultureVolumeMl":25,"decimalPlaces":4}'

Referência da API

Envie uma requisição POST com suas entradas em JSON. Parâmetros do tipo arquivo exigem upload prévio.

Endpoint

HTTP

POST https://api.elysiatools.com/pt/api/tools/od600-cell-density

Parâmetros

Nome	Tipo	Obrigatório	Descrição
od600	number	Sim	Raw absorbance of the (diluted) sample at 600 nm, blanked against medium.
dilutionFactor	number	Sim	Sample-to-total dilution before measurement (1 = measured undiluted).
pathLengthCm	number	Sim	Cuvette path length (1 cm standard; readings are normalized to 1 cm).
cellsPerOd	number	Sim	Viable+total cells per mL at OD600 = 1 (E. coli default 1×10⁹; range 5×10⁸–1.2×10⁹).
cdwPerOd	number

Integração MCP

Adicione esta ferramenta ao seu servidor Model Context Protocol para que agentes de IA possam listá-la e chamá-la.

Configuração do servidor

Adicione este bloco à configuração do seu cliente MCP:

mcp.json

{
  "mcpServers": {
    "elysiatools-od600-cell-density": {
      "name": "od600-cell-density",
      "description": "Converte turbidez OD600 em concentração celular e peso seco (CDW): OD normalizada = leitura × fator de diluição ÷ trajeto óptico; células/mL = OD × células por unidade de OD (1×10⁹ padrão, valor usual de E. coli); CDW g/L = OD × g/L por unidade de OD (0.36 padrão, BioNumbers 109837; faixa 0.3–0.5). Os dois fatores são editáveis — cepa, meio e instrumento os alteram; os padrões são autoconsistentes: 0.36 g/L ÷ 10⁹ células/mL = 0.36 pg/célula. Leituras OD > 1 são marcadas fora da faixa linear (Sigma-Aldrich). Fontes: BioNumbers 109835/109837, Agilent/VectorBuilder. Calibre com sua própria curva OD-UCF. Apenas para educação.",
      "baseUrl": "https://api.elysiatools.com/mcp/sse?toolId=od600-cell-density",
      "command": "",
      "args": [],
      "env": {},
      "isActive": true,
      "type": "sse"
    }
  }
}

Listar ferramentas disponíveis

Após conectar ao endpoint SSE, liste as ferramentas expostas:

tools/list

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 1,
  "method": "tools/list"
}

Chamar esta ferramenta

Invoque a ferramenta pelo seu id; os argumentos são construídos a partir de seus parâmetros:

tools/call

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 2,
  "method": "tools/call",
  "params": {
    "name": "od600-cell-density",
    "arguments": {
  "od600": 0.5,
  "dilutionFactor": 1,
  "pathLengthCm": 1,
  "cellsPerOd": 1000000000,
  "cdwPerOd": 0.36,
  "cultureVolumeMl": 25,
  "decimalPlaces": 4
}
  }
}

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