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Calculadora do número de renovação enzimática (kcat)

Calcula o número de renovação kcat = Vmax ÷ [E]total, em min⁻¹ e s⁻¹. Três entradas: Vmax(µmol/min) ÷ quantidade de enzima(µmol); Vmax(µM/min) ÷ [E](µM); ou a partir da concentração de proteína(mg/mL) e peso molecular(kDa), [E](µM) = 1000×c÷MW (1 mg/mL de uma proteína de 1 kDa = 1000 µM), depois kcat. Faixas (s⁻¹): <0,01 muito lenta, 0,01–1 lenta, 1–100 moderada (enzimas metabólicas típicas), 100–10⁴ rápida, >10⁴ muito rápida (catalase ≈4×10⁷ s⁻¹). [E] deve contar centros ativos (n-mero × n). Fontes: Michaelis-Menten 1913, Fersht, Lehninger. Apenas para educação.

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Início rápido

Chame esta ferramenta a partir do seu código em três idiomas.

cURL
curl -X POST 'https://api.elysiatools.com/pt/api/tools/enzyme-turnover-number' \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"mode":"amount","vmaxUmolMin":12,"enzymeUmol":0.02,"vmaxUMLMin":40,"enzymeUM":2,"proteinMgPerMl":1,"molecularWeightKda":50,"decimalPlaces":4}'

Referência da API

Envie uma requisição POST com suas entradas em JSON. Parâmetros do tipo arquivo exigem upload prévio.

Endpoint

HTTP
POST https://api.elysiatools.com/pt/api/tools/enzyme-turnover-number

Parâmetros

NomeTipoObrigatórioDescrição
modeselectSimHow you know the enzyme: as an amount, a concentration, or protein concentration plus molecular weight.
vmaxUmolMinnumberSimMaximal velocity from a saturated assay (amount mode).
enzymeUmolnumberSimTotal enzyme (better: active-site) amount in the assay (amount mode).
vmaxUMLMinnumberSimMaximal velocity as a concentration rate (concentration and protein modes).
enzymeUMnumber

Integração MCP

Adicione esta ferramenta ao seu servidor Model Context Protocol para que agentes de IA possam listá-la e chamá-la.

Configuração do servidor

Adicione este bloco à configuração do seu cliente MCP:

mcp.json
{
  "mcpServers": {
    "elysiatools-enzyme-turnover-number": {
      "name": "enzyme-turnover-number",
      "description": "Calcula o número de renovação kcat = Vmax ÷ [E]total, em min⁻¹ e s⁻¹. Três entradas: Vmax(µmol/min) ÷ quantidade de enzima(µmol); Vmax(µM/min) ÷ [E](µM); ou a partir da concentração de proteína(mg/mL) e peso molecular(kDa), [E](µM) = 1000×c÷MW (1 mg/mL de uma proteína de 1 kDa = 1000 µM), depois kcat. Faixas (s⁻¹): <0,01 muito lenta, 0,01–1 lenta, 1–100 moderada (enzimas metabólicas típicas), 100–10⁴ rápida, >10⁴ muito rápida (catalase ≈4×10⁷ s⁻¹). [E] deve contar centros ativos (n-mero × n). Fontes: Michaelis-Menten 1913, Fersht, Lehninger. Apenas para educação.",
      "baseUrl": "https://api.elysiatools.com/mcp/sse?toolId=enzyme-turnover-number",
      "command": "",
      "args": [],
      "env": {},
      "isActive": true,
      "type": "sse"
    }
  }
}

Listar ferramentas disponíveis

Após conectar ao endpoint SSE, liste as ferramentas expostas:

tools/list
{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 1,
  "method": "tools/list"
}

Chamar esta ferramenta

Invoque a ferramenta pelo seu id; os argumentos são construídos a partir de seus parâmetros:

tools/call
{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 2,
  "method": "tools/call",
  "params": {
    "name": "enzyme-turnover-number",
    "arguments": {
  "mode": "amount",
  "vmaxUmolMin": 12,
  "enzymeUmol": 0.02,
  "vmaxUMLMin": 40,
  "enzymeUM": 2,
  "proteinMgPerMl": 1,
  "molecularWeightKda": 50,
  "decimalPlaces": 4
}
  }
}
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Sim
Enzyme (active-site) concentration (concentration mode).
proteinMgPerMlnumberSimProtein concentration of the enzyme stock (protein mode).
molecularWeightKdanumberSimMolecular weight of one active-site-bearing subunit (protein mode).
decimalPlacesnumberNão—

Formato de resposta

Resultado JSON

JSON
{
  "key": {...},
  "metadata": {
    "key": "value"
  },
  "error": "Error message (optional)",
  "message": "Notification message (optional)"
}
Encadeie várias ferramentas em uma sessão com uma lista toolId separada por vírgulas, p. ex. /mcp/sse?toolId=png-to-webp,jpg-to-webp,gif-to-webp (máx. 20).

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