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Calculadora de eficiência catalítica (kcat/Km)

Calcula a eficiência catalítica kcat/Km (M⁻¹s⁻¹) — a constante aparente de segunda ordem em substrato baixo e a forma justa de comparar a preferência de uma enzima por substratos. Duas entradas: kcat direto (s⁻¹ ou min⁻¹) e Km (nM/µM/mM); ou kcat obtido de Vmax(µM/min) ÷ [E](µM) e dividido por Km. Faixas (M⁻¹s⁻¹): <10³ ineficiente (suspeite de substrato errado ou artefato), 10³–10⁵ moderada, 10⁵–10⁷ eficiente (enzimas bem evoluídas), 10⁷–10⁸ muito eficiente, ≥10⁸ perto do limite de difusão (10⁸–10⁹), «cataliticamente perfeita» (triose-fosfato isomerase, anidrase carbônica, acetilcolinesterase). Válida apenas no estado estacionário com Km ≫ [E]. Fontes: Fersht, Knowles & Albery 1977, Radzicka & Wolfenden 1995. Apenas para educação.

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Início rápido

Chame esta ferramenta a partir do seu código em três idiomas.

cURL
curl -X POST 'https://api.elysiatools.com/pt/api/tools/enzyme-catalytic-efficiency' \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"mode":"direct","kcatValue":1000,"kcatUnit":"per-sec","kmValue":100,"kmUnit":"micro","vmaxUMLMin":50,"enzymeUM":2,"decimalPlaces":4}'

Referência da API

Envie uma requisição POST com suas entradas em JSON. Parâmetros do tipo arquivo exigem upload prévio.

Endpoint

HTTP
POST https://api.elysiatools.com/pt/api/tools/enzyme-catalytic-efficiency

Parâmetros

NomeTipoObrigatórioDescrição
modeselectSimEnter kcat directly, or derive it from Vmax and enzyme concentration.
kcatValuenumberSimTurnover number in the unit selected below (direct mode).
kcatUnitselectSimWhether kcat is per second or per minute.
kmValuenumberSimMichaelis constant in the unit selected below.
kmUnitselectSim

Integração MCP

Adicione esta ferramenta ao seu servidor Model Context Protocol para que agentes de IA possam listá-la e chamá-la.

Configuração do servidor

Adicione este bloco à configuração do seu cliente MCP:

mcp.json
{
  "mcpServers": {
    "elysiatools-enzyme-catalytic-efficiency": {
      "name": "enzyme-catalytic-efficiency",
      "description": "Calcula a eficiência catalítica kcat/Km (M⁻¹s⁻¹) — a constante aparente de segunda ordem em substrato baixo e a forma justa de comparar a preferência de uma enzima por substratos. Duas entradas: kcat direto (s⁻¹ ou min⁻¹) e Km (nM/µM/mM); ou kcat obtido de Vmax(µM/min) ÷ [E](µM) e dividido por Km. Faixas (M⁻¹s⁻¹): <10³ ineficiente (suspeite de substrato errado ou artefato), 10³–10⁵ moderada, 10⁵–10⁷ eficiente (enzimas bem evoluídas), 10⁷–10⁸ muito eficiente, ≥10⁸ perto do limite de difusão (10⁸–10⁹), «cataliticamente perfeita» (triose-fosfato isomerase, anidrase carbônica, acetilcolinesterase). Válida apenas no estado estacionário com Km ≫ [E]. Fontes: Fersht, Knowles & Albery 1977, Radzicka & Wolfenden 1995. Apenas para educação.",
      "baseUrl": "https://api.elysiatools.com/mcp/sse?toolId=enzyme-catalytic-efficiency",
      "command": "",
      "args": [],
      "env": {},
      "isActive": true,
      "type": "sse"
    }
  }
}

Listar ferramentas disponíveis

Após conectar ao endpoint SSE, liste as ferramentas expostas:

tools/list
{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 1,
  "method": "tools/list"
}

Chamar esta ferramenta

Invoque a ferramenta pelo seu id; os argumentos são construídos a partir de seus parâmetros:

tools/call
{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 2,
  "method": "tools/call",
  "params": {
    "name": "enzyme-catalytic-efficiency",
    "arguments": {
  "mode": "direct",
  "kcatValue": 1000,
  "kcatUnit": "per-sec",
  "kmValue": 100,
  "kmUnit": "micro",
  "vmaxUMLMin": 50,
  "enzymeUM": 2,
  "decimalPlaces": 4
}
  }
}
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Concentration unit of Km.
vmaxUMLMinnumberSimMaximal velocity as a concentration rate (from-Vmax mode).
enzymeUMnumberSimActive-site concentration (from-Vmax mode).
decimalPlacesnumberNão—

Formato de resposta

Resultado JSON

JSON
{
  "key": {...},
  "metadata": {
    "key": "value"
  },
  "error": "Error message (optional)",
  "message": "Notification message (optional)"
}
Encadeie várias ferramentas em uma sessão com uma lista toolId separada por vírgulas, p. ex. /mcp/sse?toolId=png-to-webp,jpg-to-webp,gif-to-webp (máx. 20).

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