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Simulador do efeito gargalo genético (perda de heterozigosidade)
Simula a perda esperada de heterozigosidade após um gargalo (esperança determinística). Sob deriva Wright-Fisher ideal, H_{t+1} = H_t(1 − 1/(2N)) por geração, logo H_final = H₀(1−1/2Nb)^t × (1−1/2Nr)^g; o tamanho efetivo harmônico Ne = (t+g)/(t/Nb + g/Nr) é dominado pelo mínimo; F acumulado = 1 − H_final/H₀. Para um alelo de frequência p, a sobrevivência a UMA geração de gargalo é 1 − (1−p)^(2Nb); alelos raros perdem-se primeiro. Casos clássicos: elefante-marinho-do-norte (~20 sobreviventes em 1890), guepardo, nēnē do Havaí, bisão-europeu, atol Pingelap. Fontes: Wright 1931, Nei et al. 1975, Hartl & Clark 2007, StatPearls. Apenas uso educativo.
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Chame esta ferramenta a partir do seu código em três idiomas.
curl -X POST 'https://api.elysiatools.com/pt/api/tools/bottleneck-effect-simulator' \
-H 'Content-Type: application/json' \
-d '{"initialHeterozygosity":0.5,"bottleneckSize":20,"bottleneckGenerations":5,"recoverySize":2000,"recoveryGenerations":10,"alleleFrequency":0.1,"decimalPlaces":4}'Referência da API
Envie uma requisição POST com suas entradas em JSON. Parâmetros do tipo arquivo exigem upload prévio.
Endpoint
POST https://api.elysiatools.com/pt/api/tools/bottleneck-effect-simulatorParâmetros
| Nome | Tipo | Obrigatório | Descrição |
|---|---|---|---|
| initialHeterozygosity | number | Sim | Heterozygosity before the bottleneck (0 < H₀ ≤ 1). |
| bottleneckSize | number | Sim | Census size during the bottleneck (Nb). |
| bottleneckGenerations | number | Sim | Number of generations spent at the bottleneck size (t). |
| recoverySize | number | Sim | Census size after recovery (Nr). |
| recoveryGenerations | number |
Integração MCP
Adicione esta ferramenta ao seu servidor Model Context Protocol para que agentes de IA possam listá-la e chamá-la.
Configuração do servidor
Adicione este bloco à configuração do seu cliente MCP:
{
"mcpServers": {
"elysiatools-bottleneck-effect-simulator": {
"name": "bottleneck-effect-simulator",
"description": "Simula a perda esperada de heterozigosidade após um gargalo (esperança determinística). Sob deriva Wright-Fisher ideal, H_{t+1} = H_t(1 − 1/(2N)) por geração, logo H_final = H₀(1−1/2Nb)^t × (1−1/2Nr)^g; o tamanho efetivo harmônico Ne = (t+g)/(t/Nb + g/Nr) é dominado pelo mínimo; F acumulado = 1 − H_final/H₀. Para um alelo de frequência p, a sobrevivência a UMA geração de gargalo é 1 − (1−p)^(2Nb); alelos raros perdem-se primeiro. Casos clássicos: elefante-marinho-do-norte (~20 sobreviventes em 1890), guepardo, nēnē do Havaí, bisão-europeu, atol Pingelap. Fontes: Wright 1931, Nei et al. 1975, Hartl & Clark 2007, StatPearls. Apenas uso educativo.",
"baseUrl": "https://api.elysiatools.com/mcp/sse?toolId=bottleneck-effect-simulator",
"command": "",
"args": [],
"env": {},
"isActive": true,
"type": "sse"
}
}
}Listar ferramentas disponíveis
Após conectar ao endpoint SSE, liste as ferramentas expostas:
{
"jsonrpc": "2.0",
"id": 1,
"method": "tools/list"
}Chamar esta ferramenta
Invoque a ferramenta pelo seu id; os argumentos são construídos a partir de seus parâmetros:
{
"jsonrpc": "2.0",
"id": 2,
"method": "tools/call",
"params": {
"name": "bottleneck-effect-simulator",
"arguments": {
"initialHeterozygosity": 0.5,
"bottleneckSize": 20,
"bottleneckGenerations": 5,
"recoverySize": 2000,
"recoveryGenerations": 10,
"alleleFrequency": 0.1,
"decimalPlaces": 4
}
}
}