Calculateur de nombre de copies d'ADN (concentration → copies) | Outil en ligne gratuit | Elysia Tools
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Calculateur de nombre de copies d'ADN (concentration → copies)
Convertit une concentration massique d'ADN en copies moléculaires par microlitre : copies/µL = c(g/µL) × N_A ÷ (longueur pb × 660 g/mol). Accepte ng/µL (sortie NanoDrop habituelle, identique à µg/mL), pg/µL (gamme Qubit) et µg/µL ; fournit la conversion en pmol/µL et le total de copies dans un volume optionnel. Repère : un plasmide de 5 000 pb à 50 ng/µL → 9.12×10⁹ copies/µL (0.0152 pmol/µL). Rappels : 660 Da/pb est une moyenne suffisante pour plasmides/génome/amplicons (pour des oligos exacts, sommez les masses des bases) ; l'A260 surestime les échantillons contaminés par ARN/nucléotides libres — pour la précision, préférez un dosage fluorométrique. Sources : N_A SI 2019, convention Thermo Fisher, Sambrook & Russell. Uniquement pour la planification.
Exécution
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Guide d'utilisation de l'outil
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Points clés
Catégorie
Education
Types d’entrée
number, select
Type de sortie
json
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4
API disponible
Oui
Aperçu
Ce calculateur convertit une concentration massique d'ADN en copies moléculaires par µL à partir de la concentration, de l'unité choisie et de la longueur de la matrice en paires de bases. Il fournit aussi la valeur en pmol/µL et, si un volume est indiqué, le nombre total de copies. Cet outil est destiné à la planification expérimentale.
Quand l’utiliser
Résultat
Prêt à exécuter
Après exécution, les fichiers, textes, données structurées ou sorties en flux apparaîtront ici.
Estimer le nombre de copies d'un plasmide, d'un génome ou d'un amplicon à partir d'une concentration en ADN.
Préparer une matrice pour une PCR ou une qPCR et calculer le nombre total de copies introduites.
Convertir des mesures en ng/µL, pg/µL, µg/mL ou µg/µL en copies/µL et en pmol/µL.
Fonctionnement
1Saisissez la concentration d'ADN et sélectionnez son unité : ng/µL, pg/µL, µg/mL ou µg/µL.
2Indiquez la longueur totale de la matrice en paires de bases, par exemple la taille d'un plasmide ou d'un amplicon.
3Le calcul applique la relation copies/µL = c(g/µL) × N_A ÷ (longueur en pb × 660 g/mol).
4Ajoutez éventuellement un volume en µL pour obtenir le nombre total de copies dans cet échantillon.
Cas d’usage
Planification de matrices pour des réactions PCR ou qPCR.
Préparation d'une courbe standard à partir d'un plasmide ou d'un ADN lambda.
Conversion de concentrations mesurées au NanoDrop ou dans la gamme du Qubit en quantité moléculaire.
Exemples
1. Miniprep plasmidique à 50 ng/µL
Chercheuse en biologie moléculaire
Contexte
Une solution de plasmide de 5 000 pb est mesurée à 50 ng/µL et doit être caractérisée avant une qPCR.
Problème
Déterminer le nombre de copies disponibles par microlitre et dans 2 µL d'échantillon.
Utilisation
Saisissez 50 comme concentration, sélectionnez ng/µL, indiquez 5 000 pb et renseignez un volume de 2 µL.
Le résultat est d'environ 1,88×10⁸ copies/µL et 0,0003 pmol/µL. Aucun total de copies n'est calculé puisque le volume vaut 0.
FAQ
Quelles unités de concentration sont acceptées ?
Le calculateur accepte ng/µL, pg/µL, µg/mL et µg/µL.
Quelle longueur d'ADN faut-il saisir ?
Saisissez la longueur totale de la matrice double brin en paires de bases : plasmide, génome ou amplicon.
Comment obtenir le nombre total de copies ?
Indiquez le volume de l'échantillon en µL. Le résultat multiplie alors les copies/µL par ce volume.
Pourquoi la valeur 660 g/mol par paire de bases est-elle utilisée ?
Il s'agit d'une masse moyenne adaptée aux plasmides, génomes et amplicons. Pour un oligonucléotide exact, les masses de chaque base doivent être additionnées.
Une mesure A260 est-elle toujours précise ?
Non. L'A260 peut surestimer la concentration en présence d'ARN ou de nucléotides libres ; un dosage fluorométrique est préférable pour une mesure plus précise.