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Indice de Diversité de Shannon (H′)

Calcule l'indice de Shannon (Shannon–Wiener) : H′ = −Σpᵢ·ln pᵢ, avec pᵢ = nᵢ/N. H′ augmente avec la richesse S et avec l'équitabilité ; bases ln (convention classique), log₂ (bits par espèce) ou log₁₀. Indique H′max = ln(S) et l'équitabilité de Pielou J = H′/ln(S) (0–1 ; J=1 parfaitement uniforme). Repères : H′ < 1 faible, 1–3 modéré–élevé, > 3 très élevé (contextuel ; comparez des communautés à S proche).

json· Résultat JSONOuvrir l'outil

Démarrage rapide

Appelez cet outil depuis votre code en trois langages.

cURL

curl -X POST 'https://api.elysiatools.com/fr/api/tools/shannon-diversity-index' \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"counts":"40\n25\n20\n10\n5","base":"ln"}'

Référence de l'API

Envoyez une requête POST avec vos entrées en JSON. Les paramètres de type fichier nécessitent un upload préalable.

Point d'accès

HTTP

POST https://api.elysiatools.com/fr/api/tools/shannon-diversity-index

Paramètres

Nom	Type	Requis	Description
counts	textarea	Oui	One abundance count per species, separated by new lines, commas, or spaces.
base	select	Oui	—

Format de réponse

Résultat JSON

JSON

{
  "key": {...},
  "metadata": {
    "key": "value"
  },
  "error": "Error message (optional)",
  "message": "Notification message (optional)"
}

Intégration MCP

Ajoutez cet outil à votre serveur Model Context Protocol pour que les agents IA puissent le lister et l'appeler.

Configuration du serveur

Ajoutez ce bloc à la configuration de votre client MCP :

mcp.json

{
  "mcpServers": {
    "elysiatools-shannon-diversity-index": {
      "name": "shannon-diversity-index",
      "description": "Calcule l'indice de Shannon (Shannon–Wiener) : H′ = −Σpᵢ·ln pᵢ, avec pᵢ = nᵢ/N. H′ augmente avec la richesse S et avec l'équitabilité ; bases ln (convention classique), log₂ (bits par espèce) ou log₁₀. Indique H′max = ln(S) et l'équitabilité de Pielou J = H′/ln(S) (0–1 ; J=1 parfaitement uniforme). Repères : H′ < 1 faible, 1–3 modéré–élevé, > 3 très élevé (contextuel ; comparez des communautés à S proche).",
      "baseUrl": "https://api.elysiatools.com/mcp/sse?toolId=shannon-diversity-index",
      "command": "",
      "args": [],
      "env": {},
      "isActive": true,
      "type": "sse"
    }
  }
}

Lister les outils disponibles

Après connexion au point d'accès SSE, listez les outils exposés :

tools/list

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 1,
  "method": "tools/list"
}

Appeler cet outil

Appelez l'outil par son id ; les arguments sont construits à partir de ses paramètres :

tools/call

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 2,
  "method": "tools/call",
  "params": {
    "name": "shannon-diversity-index",
    "arguments": {
  "counts": "40\n25\n20\n10\n5",
  "base": "ln"
}
  }
}

Chaînez plusieurs outils dans une session avec une liste toolId séparée par des virgules, ex. /mcp/sse?toolId=png-to-webp,jpg-to-webp,gif-to-webp (20 max).

Parcourir les outils Ouvrir l'outil

Indice de Diversité de Shannon (H′)

Nom

Type

Requis

Description

counts

textarea

Oui

One abundance count per species, separated by new lines, commas, or spaces.

base

select

Oui

—

{ "mcpServers": { "elysiatools-shannon-diversity-index": { "name": "shannon-diversity-index", "description": "Calcule l'indice de Shannon (Shannon–Wiener) : H′ = −Σpᵢ·ln pᵢ, avec pᵢ = nᵢ/N. H′ augmente avec la richesse S et avec l'équitabilité ; bases ln (convention classique), log₂ (bits par espèce) ou log₁₀. Indique H′max = ln(S) et l'équitabilité de Pielou J = H′/ln(S) (0–1 ; J=1 parfaitement uniforme). Repères : H′ < 1 faible, 1–3 modéré–élevé, > 3 très élevé (contextuel ; comparez des communautés à S proche).", "baseUrl": "https://api.elysiatools.com/mcp/sse?toolId=shannon-diversity-index", "command": "", "args": [], "env": {}, "isActive": true, "type": "sse" } } }