Indice de Diversité de Shannon (H′) | Outil en ligne gratuit | Elysia Tools
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Indice de Diversité de Shannon (H′)
Calcule l'indice de Shannon (Shannon–Wiener) : H′ = −Σpᵢ·ln pᵢ, avec pᵢ = nᵢ/N. H′ augmente avec la richesse S et avec l'équitabilité ; bases ln (convention classique), log₂ (bits par espèce) ou log₁₀. Indique H′max = ln(S) et l'équitabilité de Pielou J = H′/ln(S) (0–1 ; J=1 parfaitement uniforme). Repères : H′ < 1 faible, 1–3 modéré–élevé, > 3 très élevé (contextuel ; comparez des communautés à S proche).
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Points clés
Catégorie
Health
Types d’entrée
textarea, select
Type de sortie
json
Exemples associés
4
API disponible
Oui
Aperçu
Calculez l'indice de Shannon–Wiener H′ = −Σpᵢ·ln pᵢ à partir des effectifs par espèce (pᵢ = nᵢ/N). L'outil renvoie aussi H′max = ln(S) et l'équitabilité de Pielou J = H′/ln(S). Choisissez la base ln (classique), log₂ ou log₁₀.
Quand l’utiliser
Comparer la diversité de communautés à richesse S proche en écologie de terrain ou en laboratoire.
Obtenir H′, H′max et J à partir d'une liste d'abondances pour un rapport ou un protocole.
Vérifier l'effet de la base du logarithme (ln, bits par espèce ou log₁₀) sur le même jeu de comptages.
Fonctionnement
1Saisissez un effectif par espèce, un par ligne, ou séparés par des virgules ou des espaces.
2Choisissez la base : ln (convention écologique), log₂ (bits par espèce) ou log₁₀.
3Le calcul détermine S, N, les proportions pᵢ, puis H′ = −Σ pᵢ log pᵢ, H′max et J.
4Le résultat JSON indique H′, l'interprétation d'équitabilité et les métadonnées (richesse, N, proportions).
Cas d’usage
Inventaire de terrain : calculer H′ et J d'un relevé d'abondances pour un mémoire ou un article.
Cours d'écologie : illustrer comment la richesse S plafonne H′ même si J est élevé.
Suivi de laboratoire : comparer deux échantillons (même base) pour détecter une perte d'équitabilité.
Exemples
1. Cinq espèces 40 / 25 / 20 / 10 / 5
Écologue de terrain
Contexte
Un relevé de 100 individus répartis en cinq taxons sert de référence pour un suivi de communauté.
Problème
Obtenir H′, H′max et J en base ln pour juger si la communauté est plutôt uniforme.
Utilisation
Coller les effectifs 40, 25, 20, 10 et 5 (un par ligne) et laisser la base ln.
counts: 40\n25\n20\n10\n5 ; base: ln
Résultat
H′ = 1,4150, H′max = 1,6094, J = 0,8792. Communauté modérément uniforme (S = 5, N = 100).
2. Deux espèces 60 / 40
Enseignant en écologie
Contexte
Un exercice simple montre qu'une faible richesse limite H′ même quand les abondances sont proches.
Problème
Montrer que H′ reste bas à cause de S = 2, alors que J est très élevé.
Utilisation
Entrer 60 puis 40, base ln.
counts: 60\n40 ; base: ln
FAQ
Quelle formule est utilisée ?
H′ = −Σ pᵢ · log pᵢ avec pᵢ = nᵢ/N. La base du logarithme est celle que vous sélectionnez (ln par défaut).
Que signifient H′max et J ?
H′max = log(S) est la diversité maximale pour S espèces. J = H′/H′max (0–1) mesure l'équitabilité de Pielou ; J = 1 si les abondances sont parfaitement égales.
Comment interpréter la valeur de H′ ?
Repères usuels (contextuels) : H′ < 1 faible, 1–3 modéré à élevé, > 3 très élevé. Comparez surtout des communautés de richesse S similaire.
Quels formats d'effectifs sont acceptés ?
Un nombre entier ou décimal par espèce, séparés par des retours à la ligne, des virgules ou des espaces. Chaque valeur est un effectif nᵢ.
La base change-t-elle le classement des communautés ?
Non : ln, log₂ et log₁₀ ne font que redimensionner H′ et H′max. L'équitabilité J reste identique car le rapport est invariant.