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Convertit entre fréquence de recombinaison et distance de carte génétique. r = recombinants / descendance totale (r ≤ 0.5 ; tend vers 0.5 pour gènes distants ou sur des chromosomes différents). Trois fonctions de cartographie (d en morgans, 1 M = 100 cM) : linéaire d = r (courtes distances seulement) ; Haldane 1919 : d = −½ln(1−2r) (sans interférence) ; Kosambi 1944 : d = ¼ln((1+2r)/(1−2r)) (interférence positive). Elles corrigent la sous-estimation par les doubles crossing-over : pour un même r, Haldane ≥ Kosambi ≥ linéaire. Le mode intervalles somme les distances et prédit r par les fonctions inverses (la carte totale peut dépasser 50 cM tandis que r sature à 50%). Sources : Sturtevant 1913, Haldane 1919, Kosambi 1944, Griffiths. Usage éducatif uniquement.
Appelez cet outil depuis votre code en trois langages.
curl -X POST 'http://127.0.0.1:3003/fr/api/tools/recombination-frequency-map' \
-H 'Content-Type: application/json' \
-d '{"mode":"counts","recombinantCount":18,"totalProgeny":100,"intervalDistances":"","decimalPlaces":4}'Envoyez une requête POST avec vos entrées en JSON. Les paramètres de type fichier nécessitent un upload préalable.
POST http://127.0.0.1:3003/fr/api/tools/recombination-frequency-map| Nom | Type | Requis | Description |
|---|---|---|---|
| mode | select | Oui | From recombination counts, or from a list of map intervals. |
| recombinantCount | number | Oui | Recombinant offspring in a testcross (counts mode). |
| totalProgeny | number | Oui | Total offspring scored (counts mode). |
| intervalDistances | text | Non | Comma-separated adjacent interval distances in centimorgans (intervals mode). |
| decimalPlaces | number |
Ajoutez cet outil à votre serveur Model Context Protocol pour que les agents IA puissent le lister et l'appeler.
Ajoutez ce bloc à la configuration de votre client MCP :
{
"mcpServers": {
"elysiatools-recombination-frequency-map": {
"name": "recombination-frequency-map",
"description": "Convertit entre fréquence de recombinaison et distance de carte génétique. r = recombinants / descendance totale (r ≤ 0.5 ; tend vers 0.5 pour gènes distants ou sur des chromosomes différents). Trois fonctions de cartographie (d en morgans, 1 M = 100 cM) : linéaire d = r (courtes distances seulement) ; Haldane 1919 : d = −½ln(1−2r) (sans interférence) ; Kosambi 1944 : d = ¼ln((1+2r)/(1−2r)) (interférence positive). Elles corrigent la sous-estimation par les doubles crossing-over : pour un même r, Haldane ≥ Kosambi ≥ linéaire. Le mode intervalles somme les distances et prédit r par les fonctions inverses (la carte totale peut dépasser 50 cM tandis que r sature à 50%). Sources : Sturtevant 1913, Haldane 1919, Kosambi 1944, Griffiths. Usage éducatif uniquement.",
"baseUrl": "http://127.0.0.1:3003/mcp/sse?toolId=recombination-frequency-map",
"command": "",
"args": [],
"env": {},
"isActive": true,
"type": "sse"
}
}
}Après connexion au point d'accès SSE, listez les outils exposés :
{
"jsonrpc": "2.0",
"id": 1,
"method": "tools/list"
}Appelez l'outil par son id ; les arguments sont construits à partir de ses paramètres :
{
"jsonrpc": "2.0",
"id": 2,
"method": "tools/call",
"params": {
"name": "recombination-frequency-map",
"arguments": {
"mode": "counts",
"recombinantCount": 18,
"totalProgeny": 100,
"intervalDistances": "",
"decimalPlaces": 4
}
}
}| Non |
| — |
Résultat JSON
{
"key": {...},
"metadata": {
"key": "value"
},
"error": "Error message (optional)",
"message": "Notification message (optional)"
}Des questions ou un problème ? Contactez [email protected]