Education

Calculateur de masse peptidique (monoisotopique/moyenne)

Calcule la masse d'un peptide par sommation des résidus : M = Σ masses des résidus + H₂O (table ExPASy ProtParam). Deux modes : monoisotopique (H₂O = 18,01056, idéal pour les courts peptides en MS haute résolution) ou moyenne (H₂O = 18,01524, pour des chaînes plus longues), avec les ions [M+H]⁺, [M+Na]⁺ et [M+2H]²⁺. La séquence ignore la casse, les espaces et séparateurs ; les codes d'ambiguïté B/J/O/U/X/Z sont rejetés. Source : ExPASy ProtParam (Gasteiger 2005). Uniquement à but éducatif.

json· Résultat JSONOuvrir l'outil

Démarrage rapide

Appelez cet outil depuis votre code en trois langages.

cURL

curl -X POST 'http://127.0.0.1:3003/fr/api/tools/peptide-mass-calculator' \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"sequence":"DRVYIHPF","massType":"monoisotopic","decimalPlaces":4}'

Référence de l'API

Envoyez une requête POST avec vos entrées en JSON. Les paramètres de type fichier nécessitent un upload préalable.

Point d'accès

HTTP

POST http://127.0.0.1:3003/fr/api/tools/peptide-mass-calculator

Paramètres

Nom	Type	Requis	Description
sequence	text	Oui	Single-letter amino acid codes; 1–200 residues.
massType	select	Oui	Monoisotopic for short peptides in HRMS; average for longer chains.
decimalPlaces	number	Non	—

Format de réponse

Résultat JSON

JSON

{
  "key": {...},
  "metadata": {
    "key": "value"
  },
  "error": "Error message (optional)",
  "message": "Notification message (optional)"
}

Intégration MCP

Ajoutez cet outil à votre serveur Model Context Protocol pour que les agents IA puissent le lister et l'appeler.

Configuration du serveur

Ajoutez ce bloc à la configuration de votre client MCP :

mcp.json

{
  "mcpServers": {
    "elysiatools-peptide-mass-calculator": {
      "name": "peptide-mass-calculator",
      "description": "Calcule la masse d'un peptide par sommation des résidus : M = Σ masses des résidus + H₂O (table ExPASy ProtParam). Deux modes : monoisotopique (H₂O = 18,01056, idéal pour les courts peptides en MS haute résolution) ou moyenne (H₂O = 18,01524, pour des chaînes plus longues), avec les ions [M+H]⁺, [M+Na]⁺ et [M+2H]²⁺. La séquence ignore la casse, les espaces et séparateurs ; les codes d'ambiguïté B/J/O/U/X/Z sont rejetés. Source : ExPASy ProtParam (Gasteiger 2005). Uniquement à but éducatif.",
      "baseUrl": "http://127.0.0.1:3003/mcp/sse?toolId=peptide-mass-calculator",
      "command": "",
      "args": [],
      "env": {},
      "isActive": true,
      "type": "sse"
    }
  }
}

Lister les outils disponibles

Après connexion au point d'accès SSE, listez les outils exposés :

tools/list

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 1,
  "method": "tools/list"
}

Appeler cet outil

Appelez l'outil par son id ; les arguments sont construits à partir de ses paramètres :

tools/call

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 2,
  "method": "tools/call",
  "params": {
    "name": "peptide-mass-calculator",
    "arguments": {
  "sequence": "DRVYIHPF",
  "massType": "monoisotopic",
  "decimalPlaces": 4
}
  }
}

Parcourir les outils Ouvrir l'outil