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Calculateur de Tm d'oligonucléotides (correction saline)

Deux estimations classiques du Tm : la règle de Wallace Tm = 2×(A+T) + 4×(G+C) (oligos courts <14 nt, sans dépendance au sel) et la formule corrigée du sel Tm = 81.5 + 16.6×log₁₀[Na⁺] + 0.41×(%G+C) − 600/n (Sambrook 1989 p. 11.46, la même que Primer3 ; le terme de longueur varie de 500 à 675/n selon les sources). Le mode automatique choisit selon la longueur. Renvoie %GC, composition et les deux estimations. Ce sont des approximations — pour une précision de conception, utiliser la thermodynamique plus proches voisins (outil pcr-primer-tm). Hypothèses : ADN, sans mésappariement, sans formamide/DMSO, [Na⁺] 0.01–1 M. Sources : Wallace 1979, von Ahsen 2001, Sambrook & Maniatis, OligoCalc. Uniquement pour l'éducation.

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Démarrage rapide

Appelez cet outil depuis votre code en trois langages.

cURL

curl -X POST 'https://api.elysiatools.com/fr/api/tools/oligo-melting-temperature' \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"sequence":"ATGCATGCATGCATGCATGC","method":"auto","sodiumMm":50,"decimalPlaces":2}'

Référence de l'API

Envoyez une requête POST avec vos entrées en JSON. Les paramètres de type fichier nécessitent un upload préalable.

Point d'accès

HTTP

POST https://api.elysiatools.com/fr/api/tools/oligo-melting-temperature

Paramètres

Nom	Type	Requis	Description
sequence	text	Oui	DNA sequence, A/C/G/T only (spaces stripped, case-insensitive), 4–200 nt.
method	select	Oui	Auto uses Wallace below 14 nt and the salt-corrected formula from 14 nt up.
sodiumMm	number	Oui	Total [Na⁺] (or equivalent monovalent) of the buffer; used by the salt-corrected formula.
decimalPlaces	number	Non	—

Format de réponse

Résultat JSON

Intégration MCP

Ajoutez cet outil à votre serveur Model Context Protocol pour que les agents IA puissent le lister et l'appeler.

Configuration du serveur

Ajoutez ce bloc à la configuration de votre client MCP :

mcp.json

{
  "mcpServers": {
    "elysiatools-oligo-melting-temperature": {
      "name": "oligo-melting-temperature",
      "description": "Deux estimations classiques du Tm : la règle de Wallace Tm = 2×(A+T) + 4×(G+C) (oligos courts <14 nt, sans dépendance au sel) et la formule corrigée du sel Tm = 81.5 + 16.6×log₁₀[Na⁺] + 0.41×(%G+C) − 600/n (Sambrook 1989 p. 11.46, la même que Primer3 ; le terme de longueur varie de 500 à 675/n selon les sources). Le mode automatique choisit selon la longueur. Renvoie %GC, composition et les deux estimations. Ce sont des approximations — pour une précision de conception, utiliser la thermodynamique plus proches voisins (outil pcr-primer-tm). Hypothèses : ADN, sans mésappariement, sans formamide/DMSO, [Na⁺] 0.01–1 M. Sources : Wallace 1979, von Ahsen 2001, Sambrook & Maniatis, OligoCalc. Uniquement pour l'éducation.",
      "baseUrl": "https://api.elysiatools.com/mcp/sse?toolId=oligo-melting-temperature",
      "command": "",
      "args": [],
      "env": {},
      "isActive": true,
      "type": "sse"
    }
  }
}

Lister les outils disponibles

Après connexion au point d'accès SSE, listez les outils exposés :

tools/list

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 1,
  "method": "tools/list"
}

Appeler cet outil

Appelez l'outil par son id ; les arguments sont construits à partir de ses paramètres :

tools/call

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 2,
  "method": "tools/call",
  "params": {
    "name": "oligo-melting-temperature",
    "arguments": {
  "sequence": "ATGCATGCATGCATGCATGC",
  "method": "auto",
  "sodiumMm": 50,
  "decimalPlaces": 2
}
  }
}

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Calculateur de Tm d'oligonucléotides (correction saline)

curl -X POST 'https://api.elysiatools.com/fr/api/tools/oligo-melting-temperature' \ -H 'Content-Type: application/json' \ -d '{"sequence":"ATGCATGCATGCATGCATGC","method":"auto","sodiumMm":50,"decimalPlaces":2}'

Nom

Type

Requis

Description

sequence

text

Oui

DNA sequence, A/C/G/T only (spaces stripped, case-insensitive), 4–200 nt.

method

select

Oui

Auto uses Wallace below 14 nt and the salt-corrected formula from 14 nt up.

sodiumMm

number

Oui

Total [Na⁺] (or equivalent monovalent) of the buffer; used by the salt-corrected formula.

decimalPlaces

number

Non

—

{ "mcpServers": { "elysiatools-oligo-melting-temperature": { "name": "oligo-melting-temperature", "description": "Deux estimations classiques du Tm : la règle de Wallace Tm = 2×(A+T) + 4×(G+C) (oligos courts <14 nt, sans dépendance au sel) et la formule corrigée du sel Tm = 81.5 + 16.6×log₁₀[Na⁺] + 0.41×(%G+C) − 600/n (Sambrook 1989 p. 11.46, la même que Primer3 ; le terme de longueur varie de 500 à 675/n selon les sources). Le mode automatique choisit selon la longueur. Renvoie %GC, composition et les deux estimations. Ce sont des approximations — pour une précision de conception, utiliser la thermodynamique plus proches voisins (outil pcr-primer-tm). Hypothèses : ADN, sans mésappariement, sans formamide/DMSO, [Na⁺] 0.01–1 M. Sources : Wallace 1979, von Ahsen 2001, Sambrook & Maniatis, OligoCalc. Uniquement pour l'éducation.", "baseUrl": "https://api.elysiatools.com/mcp/sse?toolId=oligo-melting-temperature", "command": "", "args": [], "env": {}, "isActive": true, "type": "sse" } } }

{ "jsonrpc": "2.0", "id": 2, "method": "tools/call", "params": { "name": "oligo-melting-temperature", "arguments": { "sequence": "ATGCATGCATGCATGCATGC", "method": "auto", "sodiumMm": 50, "decimalPlaces": 2 } } }