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Calculateur de densité cellulaire OD600 (E. coli)
Convertit la turbidité OD600 en concentration cellulaire et poids sec (CDW) : OD normalisée = lecture × facteur de dilution ÷ trajet optique ; cellules/mL = OD × cellules par unité d'OD (1×10⁹ par défaut, valeur usuelle d'E. coli) ; CDW g/L = OD × g/L par unité d'OD (0.36 par défaut, BioNumbers 109837 ; plage 0.3–0.5). Les deux facteurs sont modifiables — souche, milieu et instrument les influencent ; les valeurs par défaut sont auto-cohérentes : 0.36 g/L ÷ 10⁹ cellules/mL = 0.36 pg/cellule. Les lectures OD > 1 sont signalées hors plage linéaire (Sigma-Aldrich). Sources : BioNumbers 109835/109837, Agilent/VectorBuilder. Calibrez avec votre propre courbe OD-CFU. Uniquement pour l'éducation.
Démarrage rapide
Appelez cet outil depuis votre code en trois langages.
curl -X POST 'https://api.elysiatools.com/fr/api/tools/od600-cell-density' \
-H 'Content-Type: application/json' \
-d '{"od600":0.5,"dilutionFactor":1,"pathLengthCm":1,"cellsPerOd":1000000000,"cdwPerOd":0.36,"cultureVolumeMl":25,"decimalPlaces":4}'Référence de l'API
Envoyez une requête POST avec vos entrées en JSON. Les paramètres de type fichier nécessitent un upload préalable.
Point d'accès
POST https://api.elysiatools.com/fr/api/tools/od600-cell-densityParamètres
| Nom | Type | Requis | Description |
|---|---|---|---|
| od600 | number | Oui | Raw absorbance of the (diluted) sample at 600 nm, blanked against medium. |
| dilutionFactor | number | Oui | Sample-to-total dilution before measurement (1 = measured undiluted). |
| pathLengthCm | number | Oui | Cuvette path length (1 cm standard; readings are normalized to 1 cm). |
| cellsPerOd | number | Oui | Viable+total cells per mL at OD600 = 1 (E. coli default 1×10⁹; range 5×10⁸–1.2×10⁹). |
| cdwPerOd | number |
Intégration MCP
Ajoutez cet outil à votre serveur Model Context Protocol pour que les agents IA puissent le lister et l'appeler.
Configuration du serveur
Ajoutez ce bloc à la configuration de votre client MCP :
{
"mcpServers": {
"elysiatools-od600-cell-density": {
"name": "od600-cell-density",
"description": "Convertit la turbidité OD600 en concentration cellulaire et poids sec (CDW) : OD normalisée = lecture × facteur de dilution ÷ trajet optique ; cellules/mL = OD × cellules par unité d'OD (1×10⁹ par défaut, valeur usuelle d'E. coli) ; CDW g/L = OD × g/L par unité d'OD (0.36 par défaut, BioNumbers 109837 ; plage 0.3–0.5). Les deux facteurs sont modifiables — souche, milieu et instrument les influencent ; les valeurs par défaut sont auto-cohérentes : 0.36 g/L ÷ 10⁹ cellules/mL = 0.36 pg/cellule. Les lectures OD > 1 sont signalées hors plage linéaire (Sigma-Aldrich). Sources : BioNumbers 109835/109837, Agilent/VectorBuilder. Calibrez avec votre propre courbe OD-CFU. Uniquement pour l'éducation.",
"baseUrl": "https://api.elysiatools.com/mcp/sse?toolId=od600-cell-density",
"command": "",
"args": [],
"env": {},
"isActive": true,
"type": "sse"
}
}
}Lister les outils disponibles
Après connexion au point d'accès SSE, listez les outils exposés :
{
"jsonrpc": "2.0",
"id": 1,
"method": "tools/list"
}Appeler cet outil
Appelez l'outil par son id ; les arguments sont construits à partir de ses paramètres :
{
"jsonrpc": "2.0",
"id": 2,
"method": "tools/call",
"params": {
"name": "od600-cell-density",
"arguments": {
"od600": 0.5,
"dilutionFactor": 1,
"pathLengthCm": 1,
"cellsPerOd": 1000000000,
"cdwPerOd": 0.36,
"cultureVolumeMl": 25,
"decimalPlaces": 4
}
}
}