Calculateur de densité cellulaire OD600 (E. coli) | Outil en ligne gratuit | Elysia Tools
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Calculateur de densité cellulaire OD600 (E. coli)
Convertit la turbidité OD600 en concentration cellulaire et poids sec (CDW) : OD normalisée = lecture × facteur de dilution ÷ trajet optique ; cellules/mL = OD × cellules par unité d'OD (1×10⁹ par défaut, valeur usuelle d'E. coli) ; CDW g/L = OD × g/L par unité d'OD (0.36 par défaut, BioNumbers 109837 ; plage 0.3–0.5). Les deux facteurs sont modifiables — souche, milieu et instrument les influencent ; les valeurs par défaut sont auto-cohérentes : 0.36 g/L ÷ 10⁹ cellules/mL = 0.36 pg/cellule. Les lectures OD > 1 sont signalées hors plage linéaire (Sigma-Aldrich). Sources : BioNumbers 109835/109837, Agilent/VectorBuilder. Calibrez avec votre propre courbe OD-CFU. Uniquement pour l'éducation.
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Points clés
Catégorie
Education
Types d’entrée
number
Type de sortie
json
Exemples associés
4
API disponible
Oui
Aperçu
Le calculateur de densité cellulaire OD600 convertit une lecture de turbidité en OD normalisée, cellules/mL et poids sec cellulaire (CDW) en g/L. Il prend en compte le facteur de dilution et la longueur du trajet optique, avec des coefficients modifiables pour les cellules par OD et le CDW par OD. Outil destiné à l’éducation et à la planification expérimentale.
Quand l’utiliser
Estimer la concentration d’une culture d’E. coli à partir d’une lecture OD600.
Calculer le poids sec cellulaire par litre et, avec un volume renseigné, la quantité totale de cellules et de CDW.
Vérifier si une OD normalisée dépasse la plage linéaire et déterminer s’il faut diluer davantage l’échantillon.
Fonctionnement
1Saisissez la lecture OD600, le facteur de dilution et la longueur du trajet optique.
2L’outil calcule l’OD normalisée selon la formule : lecture × facteur de dilution ÷ trajet optique.
3Il multiplie l’OD normalisée par le nombre de cellules par OD et par le CDW en g/L par OD.
4Ajoutez le volume de culture pour obtenir les cellules totales et le CDW total ; une OD supérieure à 1 est signalée hors plage linéaire.
Cas d’usage
Estimation rapide de la densité d’une culture bactérienne avant une étape expérimentale.
Planification d’un prélèvement à partir du nombre estimé de cellules ou de la biomasse.
Comparaison de cultures mesurées avec des dilutions et des trajets optiques différents.
Exemples
1. Culture en phase logarithmique non diluée
Étudiant en biologie moléculaire
Contexte
Une culture d’E. coli mesurée dans une cuve de 1 cm donne une lecture OD600 de 0,5. Le volume total de culture est de 25 mL.
Problème
Estimer les cellules par mL, le CDW par litre, ainsi que les totaux dans le flacon.
Utilisation
Saisissez une OD600 de 0,5, un facteur de dilution de 1, une longueur de trajet de 1 cm, puis conservez les coefficients par défaut. Entrez 25 mL comme volume de culture.
Résultat
L’OD normalisée est de 0,5, soit 5×10⁸ cellules/mL et 0,18 g/L de CDW. Les 25 mL contiennent environ 1,25×10¹⁰ cellules et 0,0045 g de CDW.
2. Échantillon dilué au 1:10 au-dessus de la plage linéaire
Technicien de laboratoire
Contexte
Une culture mesurée après dilution au 1:10 donne une lecture OD600 de 0,25 dans une cuve de 1 cm. Aucun volume total n’est renseigné.
Problème
Recalculer l’OD réelle et vérifier si la mesure reste dans la plage linéaire.
Utilisation
Saisissez une OD600 de 0,25, un facteur de dilution de 10, une longueur de trajet de 1 cm et laissez le volume de culture à 0.
FAQ
Quelle valeur de cellules par OD600 est utilisée par défaut ?
La valeur par défaut est de 1×10⁹ cellules/mL pour une OD600 de 1, une valeur usuelle pour E. coli. Elle peut être modifiée.
Quel est le CDW par OD600 par défaut ?
Le calculateur utilise 0,36 g/L par unité d’OD600, avec une plage courante de 0,3 à 0,5 g/L. Ce coefficient est modifiable.
Comment le facteur de dilution est-il appliqué ?
L’OD normalisée est calculée en multipliant la lecture par le facteur de dilution, puis en divisant par la longueur du trajet optique.
Que signifie une OD600 supérieure à 1 ?
Elle est considérée comme hors de la plage linéaire indiquée par l’outil. Diluez davantage l’échantillon avant une nouvelle lecture.
Les résultats remplacent-ils une calibration expérimentale ?
Non. Les coefficients dépendent de la souche, du milieu et de l’instrument. Calibrez les conversions avec votre propre courbe OD-CFU ou de poids sec.
L’OD normalisée est de 2,5, soit une estimation de 2,5×10⁹ cellules/mL et 0,9 g/L de CDW. La lecture est signalée au-dessus de la plage linéaire ; une dilution supplémentaire est recommandée.