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Calculateur de score LOD (analyse de liaison)
Analyse de liaison deux-points par scores LOD : LOD(θ) = log10[θ^r(1−θ)^(N−r) / 0.5^N], avec r méioses recombinantes et N méioses informatives totales. L'estimation du maximum de vraisemblance est θ̂ = r/N ; calcule le LOD maximal (Zmax) ou le LOD à θ fixe, avec un tableau de la courbe LOD pour θ = 0.05–0.45. Seuils classiques (Morton 1955) : Z ≥ 3 preuve significative de liaison (1000:1) ; Z ≤ −2 preuve significative contre ; entre les deux, non concluant. Sources : Morton 1955, Ott 1999, Griffiths, StatPearls. Usage éducatif uniquement.
Démarrage rapide
Appelez cet outil depuis votre code en trois langages.
curl -X POST 'https://api.elysiatools.com/fr/api/tools/lod-score-calculator' \
-H 'Content-Type: application/json' \
-d '{"thetaMode":"max","recombinantCount":2,"nonRecombinantCount":18,"theta":0.1,"decimalPlaces":4}'Référence de l'API
Envoyez une requête POST avec vos entrées en JSON. Les paramètres de type fichier nécessitent un upload préalable.
Point d'accès
POST https://api.elysiatools.com/fr/api/tools/lod-score-calculatorParamètres
| Nom | Type | Requis | Description |
|---|---|---|---|
| thetaMode | select | Oui | Report the maximum LOD at θ̂ = r/N, or evaluate the LOD at a fixed θ. |
| recombinantCount | number | Oui | Number of recombinant meioses observed (r). |
| nonRecombinantCount | number | Oui | Number of non-recombinant meioses observed. |
| theta | number | Oui | Recombination fraction at which to evaluate the LOD in fixed-θ mode (0 < θ < 0.5). |
| decimalPlaces | number |
Intégration MCP
Ajoutez cet outil à votre serveur Model Context Protocol pour que les agents IA puissent le lister et l'appeler.
Configuration du serveur
Ajoutez ce bloc à la configuration de votre client MCP :
{
"mcpServers": {
"elysiatools-lod-score-calculator": {
"name": "lod-score-calculator",
"description": "Analyse de liaison deux-points par scores LOD : LOD(θ) = log10[θ^r(1−θ)^(N−r) / 0.5^N], avec r méioses recombinantes et N méioses informatives totales. L'estimation du maximum de vraisemblance est θ̂ = r/N ; calcule le LOD maximal (Zmax) ou le LOD à θ fixe, avec un tableau de la courbe LOD pour θ = 0.05–0.45. Seuils classiques (Morton 1955) : Z ≥ 3 preuve significative de liaison (1000:1) ; Z ≤ −2 preuve significative contre ; entre les deux, non concluant. Sources : Morton 1955, Ott 1999, Griffiths, StatPearls. Usage éducatif uniquement.",
"baseUrl": "https://api.elysiatools.com/mcp/sse?toolId=lod-score-calculator",
"command": "",
"args": [],
"env": {},
"isActive": true,
"type": "sse"
}
}
}Lister les outils disponibles
Après connexion au point d'accès SSE, listez les outils exposés :
{
"jsonrpc": "2.0",
"id": 1,
"method": "tools/list"
}Appeler cet outil
Appelez l'outil par son id ; les arguments sont construits à partir de ses paramètres :
{
"jsonrpc": "2.0",
"id": 2,
"method": "tools/call",
"params": {
"name": "lod-score-calculator",
"arguments": {
"thetaMode": "max",
"recombinantCount": 2,
"nonRecombinantCount": 18,
"theta": 0.1,
"decimalPlaces": 4
}
}
}