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Probabilité de rétention allélique par effet fondateur

Calcule la probabilité qu'un allèle de fréquence p soit retenu parmi les 2N gènes de N fondateurs (échantillonnage binomial) : P(k) = C(2N,k)p^k(1−p)^(2N−k) ; rétention = 1 − (1−p)^(2N) ; perte = (1−p)^(2N) ; copies attendues = 2Np ; variance du nombre de copies = 2Np(1−p) ; variance de dérive de la fréquence fondatrice = p(1−p)/(2N). Sous dérive neutre, la probabilité de fixation finale avec k copies est k/(2N). Cas classiques : atoll de Pingelap (~20 survivants, un porteur de l'achromatopsie ; aujourd'hui ~10% atteints), Amish (Ellis–van Creveld), Ashkénazes (Tay–Sachs), Canadiens français. Sources : Mayr 1942, Hartl & Clark 2007, StatPearls. Usage éducatif uniquement.

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Démarrage rapide

Appelez cet outil depuis votre code en trois langages.

cURL

curl -X POST 'https://api.elysiatools.com/fr/api/tools/founder-effect-probability' \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"founderCount":20,"alleleFrequency":0.05,"decimalPlaces":4}'

Référence de l'API

Envoyez une requête POST avec vos entrées en JSON. Les paramètres de type fichier nécessitent un upload préalable.

Point d'accès

HTTP

POST https://api.elysiatools.com/fr/api/tools/founder-effect-probability

Paramètres

Nom	Type	Requis	Description
founderCount	number	Oui	Number of diploid founders (N).
alleleFrequency	number	Oui	Frequency p of the allele in the source population (0 ≤ p ≤ 1).
decimalPlaces	number	Non	—

Format de réponse

Résultat JSON

JSON

{
  "key": {...},
  "metadata": {
    "key": "value"
  },
  "error": "Error message (optional)",
  "message": "Notification message (optional)"
}

Intégration MCP

Ajoutez cet outil à votre serveur Model Context Protocol pour que les agents IA puissent le lister et l'appeler.

Configuration du serveur

Ajoutez ce bloc à la configuration de votre client MCP :

mcp.json

{
  "mcpServers": {
    "elysiatools-founder-effect-probability": {
      "name": "founder-effect-probability",
      "description": "Calcule la probabilité qu'un allèle de fréquence p soit retenu parmi les 2N gènes de N fondateurs (échantillonnage binomial) : P(k) = C(2N,k)p^k(1−p)^(2N−k) ; rétention = 1 − (1−p)^(2N) ; perte = (1−p)^(2N) ; copies attendues = 2Np ; variance du nombre de copies = 2Np(1−p) ; variance de dérive de la fréquence fondatrice = p(1−p)/(2N). Sous dérive neutre, la probabilité de fixation finale avec k copies est k/(2N). Cas classiques : atoll de Pingelap (~20 survivants, un porteur de l'achromatopsie ; aujourd'hui ~10% atteints), Amish (Ellis–van Creveld), Ashkénazes (Tay–Sachs), Canadiens français. Sources : Mayr 1942, Hartl & Clark 2007, StatPearls. Usage éducatif uniquement.",
      "baseUrl": "https://api.elysiatools.com/mcp/sse?toolId=founder-effect-probability",
      "command": "",
      "args": [],
      "env": {},
      "isActive": true,
      "type": "sse"
    }
  }
}

Lister les outils disponibles

Après connexion au point d'accès SSE, listez les outils exposés :

tools/list

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 1,
  "method": "tools/list"
}

Appeler cet outil

Appelez l'outil par son id ; les arguments sont construits à partir de ses paramètres :

tools/call

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 2,
  "method": "tools/call",
  "params": {
    "name": "founder-effect-probability",
    "arguments": {
  "founderCount": 20,
  "alleleFrequency": 0.05,
  "decimalPlaces": 4
}
  }
}

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Probabilité de rétention allélique par effet fondateur

Nom

Type

Requis

Description

founderCount

number

Oui

Number of diploid founders (N).

alleleFrequency

number

Oui

Frequency p of the allele in the source population (0 ≤ p ≤ 1).

decimalPlaces

number

Non

—

{ "mcpServers": { "elysiatools-founder-effect-probability": { "name": "founder-effect-probability", "description": "Calcule la probabilité qu'un allèle de fréquence p soit retenu parmi les 2N gènes de N fondateurs (échantillonnage binomial) : P(k) = C(2N,k)p^k(1−p)^(2N−k) ; rétention = 1 − (1−p)^(2N) ; perte = (1−p)^(2N) ; copies attendues = 2Np ; variance du nombre de copies = 2Np(1−p) ; variance de dérive de la fréquence fondatrice = p(1−p)/(2N). Sous dérive neutre, la probabilité de fixation finale avec k copies est k/(2N). Cas classiques : atoll de Pingelap (~20 survivants, un porteur de l'achromatopsie ; aujourd'hui ~10% atteints), Amish (Ellis–van Creveld), Ashkénazes (Tay–Sachs), Canadiens français. Sources : Mayr 1942, Hartl & Clark 2007, StatPearls. Usage éducatif uniquement.", "baseUrl": "https://api.elysiatools.com/mcp/sse?toolId=founder-effect-probability", "command": "", "args": [], "env": {}, "isActive": true, "type": "sse" } } }

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