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Calculateur d'efficacité catalytique (kcat/Km)

Calcule l'efficacité catalytique kcat/Km (M⁻¹s⁻¹) — la constante apparente du second ordre à faible substrat et la façon équitable de comparer la préférence d'une enzyme pour ses substrats. Deux entrées : kcat direct (s⁻¹ ou min⁻¹) et Km (nM/µM/mM) ; ou kcat déduit de Vmax(µM/min) ÷ [E](µM) puis divisé par Km. Bandes (M⁻¹s⁻¹) : <10³ inefficace (suspecter un mauvais substrat ou un artefact), 10³–10⁵ modeste, 10⁵–10⁷ efficace (enzymes bien optimisées), 10⁷–10⁸ très efficace, ≥10⁸ près de la limite de diffusion (10⁸–10⁹), « catalytiquement parfaite » (triose-phosphate isomérase, anhydrase carbonique, acétylcholinestérase). Valide seulement en régime stationnaire avec Km ≫ [E]. Sources : Fersht, Knowles & Albery 1977, Radzicka & Wolfenden 1995. Uniquement à but éducatif.

json· Résultat JSONOuvrir l'outil

Démarrage rapide

Appelez cet outil depuis votre code en trois langages.

cURL
curl -X POST 'https://api.elysiatools.com/fr/api/tools/enzyme-catalytic-efficiency' \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"mode":"direct","kcatValue":1000,"kcatUnit":"per-sec","kmValue":100,"kmUnit":"micro","vmaxUMLMin":50,"enzymeUM":2,"decimalPlaces":4}'

Référence de l'API

Envoyez une requête POST avec vos entrées en JSON. Les paramètres de type fichier nécessitent un upload préalable.

Point d'accès

HTTP
POST https://api.elysiatools.com/fr/api/tools/enzyme-catalytic-efficiency

Paramètres

NomTypeRequisDescription
modeselectOuiEnter kcat directly, or derive it from Vmax and enzyme concentration.
kcatValuenumberOuiTurnover number in the unit selected below (direct mode).
kcatUnitselectOuiWhether kcat is per second or per minute.
kmValuenumberOuiMichaelis constant in the unit selected below.
kmUnitselectOui

Intégration MCP

Ajoutez cet outil à votre serveur Model Context Protocol pour que les agents IA puissent le lister et l'appeler.

Configuration du serveur

Ajoutez ce bloc à la configuration de votre client MCP :

mcp.json
{
  "mcpServers": {
    "elysiatools-enzyme-catalytic-efficiency": {
      "name": "enzyme-catalytic-efficiency",
      "description": "Calcule l'efficacité catalytique kcat/Km (M⁻¹s⁻¹) — la constante apparente du second ordre à faible substrat et la façon équitable de comparer la préférence d'une enzyme pour ses substrats. Deux entrées : kcat direct (s⁻¹ ou min⁻¹) et Km (nM/µM/mM) ; ou kcat déduit de Vmax(µM/min) ÷ [E](µM) puis divisé par Km. Bandes (M⁻¹s⁻¹) : <10³ inefficace (suspecter un mauvais substrat ou un artefact), 10³–10⁵ modeste, 10⁵–10⁷ efficace (enzymes bien optimisées), 10⁷–10⁸ très efficace, ≥10⁸ près de la limite de diffusion (10⁸–10⁹), « catalytiquement parfaite » (triose-phosphate isomérase, anhydrase carbonique, acétylcholinestérase). Valide seulement en régime stationnaire avec Km ≫ [E]. Sources : Fersht, Knowles & Albery 1977, Radzicka & Wolfenden 1995. Uniquement à but éducatif.",
      "baseUrl": "https://api.elysiatools.com/mcp/sse?toolId=enzyme-catalytic-efficiency",
      "command": "",
      "args": [],
      "env": {},
      "isActive": true,
      "type": "sse"
    }
  }
}

Lister les outils disponibles

Après connexion au point d'accès SSE, listez les outils exposés :

tools/list
{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 1,
  "method": "tools/list"
}

Appeler cet outil

Appelez l'outil par son id ; les arguments sont construits à partir de ses paramètres :

tools/call
{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 2,
  "method": "tools/call",
  "params": {
    "name": "enzyme-catalytic-efficiency",
    "arguments": {
  "mode": "direct",
  "kcatValue": 1000,
  "kcatUnit": "per-sec",
  "kmValue": 100,
  "kmUnit": "micro",
  "vmaxUMLMin": 50,
  "enzymeUM": 2,
  "decimalPlaces": 4
}
  }
}
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Concentration unit of Km.
vmaxUMLMinnumberOuiMaximal velocity as a concentration rate (from-Vmax mode).
enzymeUMnumberOuiActive-site concentration (from-Vmax mode).
decimalPlacesnumberNon—

Format de réponse

Résultat JSON

JSON
{
  "key": {...},
  "metadata": {
    "key": "value"
  },
  "error": "Error message (optional)",
  "message": "Notification message (optional)"
}
Chaînez plusieurs outils dans une session avec une liste toolId séparée par des virgules, ex. /mcp/sse?toolId=png-to-webp,jpg-to-webp,gif-to-webp (20 max).

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