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Conversion OD600 → CFU/mL (pente de calibration)

Convertit l'OD600 en concentration viable via la pente de calibration : CFU/mL = (OD600 − blanc) × facteur × dilution. Le facteur représente les CFU/mL à OD600 = 1 et dépend fortement de la souche, du milieu et du spectrophotomètre ; les préréglages ne sont que des ordres de grandeur : E. coli ≈ 1×10⁹, B. subtilis ≈ 5×10⁸, S. cerevisiae ≈ 1×10⁷. Calibrez par dénombrement sur plaque. La linéarité va jusqu'à ~0.2–0.6 ; au-delà d'un OD net de 0.6, l'outil conseille de diluer. Volume optionnel pour le CFU total.

json· Résultat JSONOuvrir l'outil

Démarrage rapide

Appelez cet outil depuis votre code en trois langages.

cURL
curl -X POST 'https://api.elysiatools.com/fr/api/tools/bacterial-growth-od' \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"od600":0.45,"blankOd":0.02,"organism":"ecoli","customFactor":0,"sampleDilution":1,"cultureVolumeMl":0}'

Référence de l'API

Envoyez une requête POST avec vos entrées en JSON. Les paramètres de type fichier nécessitent un upload préalable.

Point d'accès

HTTP
POST https://api.elysiatools.com/fr/api/tools/bacterial-growth-od

Paramètres

NomTypeRequisDescription
od600numberOuiRaw absorbance reading of the (possibly diluted) sample at 600 nm.
blankOdnumberNonAbsorbance of sterile medium; subtracted from the reading.
organismselectOui—
customFactornumberNonYour own calibration slope (CFU/mL at OD600 = 1); used when the preset is Custom.
sampleDilutionnumberOui

Intégration MCP

Ajoutez cet outil à votre serveur Model Context Protocol pour que les agents IA puissent le lister et l'appeler.

Configuration du serveur

Ajoutez ce bloc à la configuration de votre client MCP :

mcp.json
{
  "mcpServers": {
    "elysiatools-bacterial-growth-od": {
      "name": "bacterial-growth-od",
      "description": "Convertit l'OD600 en concentration viable via la pente de calibration : CFU/mL = (OD600 − blanc) × facteur × dilution. Le facteur représente les CFU/mL à OD600 = 1 et dépend fortement de la souche, du milieu et du spectrophotomètre ; les préréglages ne sont que des ordres de grandeur : E. coli ≈ 1×10⁹, B. subtilis ≈ 5×10⁸, S. cerevisiae ≈ 1×10⁷. Calibrez par dénombrement sur plaque. La linéarité va jusqu'à ~0.2–0.6 ; au-delà d'un OD net de 0.6, l'outil conseille de diluer. Volume optionnel pour le CFU total.",
      "baseUrl": "https://api.elysiatools.com/mcp/sse?toolId=bacterial-growth-od",
      "command": "",
      "args": [],
      "env": {},
      "isActive": true,
      "type": "sse"
    }
  }
}

Lister les outils disponibles

Après connexion au point d'accès SSE, listez les outils exposés :

tools/list
{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 1,
  "method": "tools/list"
}

Appeler cet outil

Appelez l'outil par son id ; les arguments sont construits à partir de ses paramètres :

tools/call
{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 2,
  "method": "tools/call",
  "params": {
    "name": "bacterial-growth-od",
    "arguments": {
  "od600": 0.45,
  "blankOd": 0.02,
  "organism": "ecoli",
  "customFactor": 0,
  "sampleDilution": 1,
  "cultureVolumeMl": 0
}
  }
}
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Fold-dilution of the sample before reading (1 = undiluted).
cultureVolumeMlnumberNonLeave empty to skip the total-CFU calculation.

Format de réponse

Résultat JSON

JSON
{
  "key": {...},
  "metadata": {
    "key": "value"
  },
  "error": "Error message (optional)",
  "message": "Notification message (optional)"
}
Chaînez plusieurs outils dans une session avec une liste toolId séparée par des virgules, ex. /mcp/sse?toolId=png-to-webp,jpg-to-webp,gif-to-webp (20 max).

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