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Convertit l'OD600 en concentration viable via la pente de calibration : CFU/mL = (OD600 − blanc) × facteur × dilution. Le facteur représente les CFU/mL à OD600 = 1 et dépend fortement de la souche, du milieu et du spectrophotomètre ; les préréglages ne sont que des ordres de grandeur : E. coli ≈ 1×10⁹, B. subtilis ≈ 5×10⁸, S. cerevisiae ≈ 1×10⁷. Calibrez par dénombrement sur plaque. La linéarité va jusqu'à ~0.2–0.6 ; au-delà d'un OD net de 0.6, l'outil conseille de diluer. Volume optionnel pour le CFU total.
Exécution
Remplissez le formulaire, lancez l’outil et consultez le résultat au même endroit.
Exemples
Associé
Guide d'utilisation de l'outil
Cet outil convertit une lecture d'absorbance OD600 en concentration viable (CFU/mL) à l'aide d'une pente de calibration : CFU/mL = (OD600 − blanc) × facteur × dilution. Choisissez un préréglage (E. coli, B. subtilis, S. cerevisiae) ou un facteur personnalisé, corrigez le blanc du milieu, tenez compte de la dilution avant lecture et, si besoin, indiquez le volume de culture pour obtenir le CFU total.
Contexte
Suivi d'une culture d'E. coli non diluée lue à OD600 0,45 avec un blanc milieu à 0,02.
Problème
Convertir cette absorbance en CFU/mL avec le préréglage E. coli, dans la plage linéaire.
Utilisation
Saisir OD600 = 0,45, blanc = 0,02, préréglage E. coli, dilution = 1.
od600: 0.45, blankOd: 0.02, organism: ecoli, sampleDilution: 1Résultat
OD net 0,43 × 1×10⁹ → environ 4,3×10⁸ CFU/mL, sans avertissement de linéarité.
Contexte
Culture de B. subtilis diluée 10× avant lecture : OD600 0,85, pas de blanc, volume 25 mL.
Problème
Obtenir CFU/mL corrigé de la dilution, le CFU total, et tenir compte du dépassement de linéarité.
Utilisation
Saisir OD600 = 0,85, blanc = 0, préréglage B. subtilis, dilution = 10, volume = 25 mL.
CFU/mL = (OD600 − OD du blanc) × facteur de calibration × dilution de l'échantillon. Le facteur est le nombre d'UFC/mL correspondant à un OD600 de 1.
Non : ce sont des ordres de grandeur. Le facteur réel dépend de la souche, du milieu et du spectrophotomètre. Calibrez par dénombrement sur plaque.
La linéarité OD600–concentration est généralement limitée à ~0,2–0,6. Au-delà, diluez l'échantillon et relisez pour rester dans la plage fiable.
Non. Laissez le champ vide pour n'obtenir que la concentration (CFU/mL). Renseignez-le uniquement pour le CFU total.
Lorsque vous avez votre propre pente de calibration (CFU/mL à OD600 = 1) pour votre souche, milieu et appareil.
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od600: 0.85, blankOd: 0, organism: bsub, sampleDilution: 10, cultureVolumeMl: 25Résultat
Environ 4,25×10⁹ CFU/mL et ~1,06×10¹¹ UFC au total, avec avertissement : OD net > 0,6 — diluer davantage et relire.